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GH97糖質加水分解酵素に発見した多様な基質認識の解明と触媒機構の変換

Research Project

Project/Area Number 19J10141
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Review Section Basic Section 38030:Applied biochemistry-related
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

菊池 麻子  北海道大学, 農学院, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2019-04-25 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Keywords糖質加水分解酵素 / GH97 / 分子進化 / α-glucoside hydrolase / α-galactosidase
Outline of Research at the Start

本研究の目的は,基質認識と触媒機構が多様な糖質加水分解酵素ファミリー97 (GH97) がどのようにして2つの触媒機構を有する酵素群へと分子進化したのか明らかにすることである.
申請者は腸内細菌がコードする10個のGH97酵素の性質を比較することにより,進化の軌跡を紐解くことを試みている.本年度は,立体構造解析と変異酵素の解析により,GH97パラログ間でどのように変異が蓄積したか調べる.

Outline of Annual Research Achievements

反転型α-glucoside hydrolaseと保持型α-galactosidaseを含む糖質加水分解酵素ファミリー97 (GH97)に期待される多様な機能と,それらを獲得するに至った分子進化の軌跡を明らかにすることを目的とし,10個のGH97パラログの基本的性質を比較した。
本年度の実施項目は3点である。まず前年度に完成しなかった(1)1酵素の立体構造解析を継続して行い,基本的情報を収集した。次に(2)着目している10個のGH97パラログの三次元構造比較から各酵素の分子機構決定に重要な構造因子の推定を行い,(2)の結果をもとに(3)変異導入し基質認識機構比較を実施した。
(1)酵素生産方法および結晶化条件を再検討することにより充分なクオリティーで三次元構造を取得することができた。
(2)着目している10個のGH97パラログの立体構造を,系統解析に基づき分類したサブファミリーごとに比較し,各酵素の基質特異性を決定づける責任因子を推定した。それぞれの酵素は特徴的な構造因子を有していたことから,GH97は様々な基質認識機構を持つ分子構造に分岐し,多様な機能を獲得したと考えられた。
(3)対象のGH97パラログのうち,異なる基質特異性を示す2酵素について(2)で予想された基質認識に関与するアミノ酸残基に対して変異を導入し,両酵素の各種基質に対する反応速度パラメーターを比較したが,特異性の明瞭な変化は認められなかった。基質認識を制御するためには,目的のアミノ酸だけでなく,その周辺構造を含む変異が必要と考えられた。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2021 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Lyon1/CNRS(フランス)

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  • [Int'l Joint Research] University of Lyon1/CNRS(フランス)

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  • [Journal Article] Molecular insight into regioselectivity of transfructosylation catalyzed by GH68 levansucrase and β-fructofuranosidase2021

    • Author(s)
      Okuyama Masayuki、Serizawa Ryo、Tanuma Masanari、Kikuchi Asako、Sadahiro Juri、Tagami Takayoshi、Lang Weeranuch、Kimura Atsuo
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 296 Pages: 100398-100398

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2021.100398

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      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] α-1,3/α-1,4-Glucosidase from Aspergillus niger Exhibits Unique Transglucosylation to Generate High Levels of Nigerose and Kojibiose.2019

    • Author(s)
      Ma M, Okuyama M, Tagami T, Kikuchi A, Klahan P, Kimura A.
    • Journal Title

      J Agric Food Chem

      Volume: 67 Issue: 12 Pages: 3380-3388

    • DOI

      10.1021/acs.jafc.8b07087

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 糖質加水分解酵素ファミリー97 α-ガラクトシダーゼの糖転移反応の解析2021

    • Author(s)
      岡本菜央、菊池麻子、田上貴祥、奥山正幸、木村淳夫
    • Organizer
      日本応用糖質科学会北海道支部会
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  • [Presentation] GH97 α-グルコシドヒドロラーゼが示す多様な基質特異性:新奇な基質認識を与える2酵素と分子機構2020

    • Author(s)
      菊池麻子、田上貴祥、奥山正幸、木村淳夫
    • Organizer
      日本応用糖質科学会2020年度大会(第69回)
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  • [Presentation] 糖質加水分解酵素ファミリー97の多様な基質認識機構の解析2020

    • Author(s)
      菊池 麻子
    • Organizer
      令和元年度日本応用糖質科学会北海道支部支部賞授賞式・受賞講演およびシンポジウム
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      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Five function-unknown GH97 paralogs from Bacteroides thetaiotaomicron2019

    • Author(s)
      Kikuchi A, Nakagawa Y, Okuyama M, Tagami T, Kimura A
    • Organizer
      13th Carbohydrate Bioengineering Meeting
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      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] GH97 α-glucoside hydrolases in Bacteroides thetaiotaomicron2019

    • Author(s)
      Kikuchi A, Okuyama M, Tagami T, Kimura A
    • Organizer
      7th Symposium on the Alpha-Amylase Family
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  • [Presentation] GH97 glycosidases in Bacteroides thetaiotaomicron2019

    • Author(s)
      Kikuchi A
    • Organizer
      Five-Universities Forum: Honoring the Legacy of Norman Borlaug: Inspiring the Next Generation of Agricultural Professionals
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      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

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Published: 2019-05-29   Modified: 2024-03-26  

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