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Efficient Synthesis of Oligonucleotides in a Micro-flow Reactor

Research Project

Project/Area Number 19J14624
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Review Section Basic Section 33020:Synthetic organic chemistry-related
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

小竹 佑磨  東京工業大学, 生命理工学院, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2019-04-25 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Keywordsマイクロフロー / 核酸 / 三塩化リン / クロロ亜リン酸エステル
Outline of Research at the Start

本研究はマイクロフロー合成法を駆使し、オリゴ核酸を高効率に合成可能な手法の開発を目的とする。三塩化リンは安価で反応性および原子効率が高い理想的なリン源であるが、求核剤の導入数を制御できない。そのため核酸合成では、不必要な置換基を導入し、わざと反応性を低下させた高価なリン源の利用を強いられてきた。これが次世代型医薬品であるオリゴ核酸の大量かつ安価な供給を妨げている。
そこで本研究ではマイクロフロー法を駆使し、ミリ秒単位で三塩化リンの反応を制御し、その挙動を定量的に解明する。得られた知見を元に、マイクロリアクターを順次連結することで、オリゴ核酸の高効率連続合成法の開発を行う。

Outline of Annual Research Achievements

オリゴ核酸は遺伝子に直接作用し、難病の根治を実現しうる次世代の医薬品候補であるが、その一般的合成法は高価な試薬や基質を要する。三塩化リンは安価かつ反応性および原子効率が高い理想的なリン源であるが、求核剤の導入を制御できない。本申請では、マイクロフロー合成法を活用することで、三塩化リンへのアルコールの選択的導入手法の開発を目指すとともに、そのオリゴ核酸合成への展開を図る。
R1年度は、はじめに脂肪族のアルコールをモデル基質として用い、三塩化リンへの選択的導入を試みた。種々の検討の結果、三塩化リンに対して副反応を抑えつつ1分子のアルコールを導入可能な条件を見出した。本反応は数十ミリ秒と極めて短時間で進行する反応であり、バッチリアクターを用いた条件との比較から、混合効率に優れたマイクロフローリアクターの使用が本反応において不可欠であることを見出した。一方、予め1分子のアルコールが三塩化リンに導入された化合物(ジクロロ亜リン酸エステル)に対し、2分子目のアルコールの導入を試みたところ、副生成物が多量に生じて目的物を選択的に得ることは困難であった。この結果は、マイクロフローリアクターを用いて数ミリ秒の反応を制御することで得られた、三塩化リンおよびクロロ亜リン酸エステル類とアルコールの反応速度に関する初めての定量的知見である。なお、2分子目のアルコールの選択的導入が困難である問題については、添加剤の使用により選択性が大幅に改善可能であることを示唆する結果を得ている。また、チミジンを原料とするジヌクレオチドの合成に先述したモデル基質を用いる反応系で確立した反応条件を変更することなく適用したところ、モデル基質を用いた場合と同程度の収率で目的物が得られることを見出した。

Research Progress Status

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Report

(1 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2020 2019 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] N‐Methylated Peptide Synthesis via Acyl N‐Methylimidazolium Cation Generation Accelerated by a Bronsted Acid2020

    • Author(s)
      Otake Yuma、Shibata Yusuke、Hayashi Yoshihiro、Kawauchi Susumu、Nakamura Hiroyuki、Fuse Shinichiro
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: - Issue: 31 Pages: 12925-12930

    • DOI

      10.1002/anie.202002106

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Peptide-Chain Elongation Using Unprotected Amino Acids in a Micro-Flow Reactor2019

    • Author(s)
      Shinichiro Fuse, Koshiro Masuda, Yuma Otake, and Hiroyuki Nakamura
    • Journal Title

      Chemistry a European Journal

      Volume: 25 Issue: 66 Pages: 15091-15097

    • DOI

      10.1002/chem.201903531

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single‐Step, Rapid, and Mild Synthesis of β‐Amino Acid N‐Carboxy Anhydrides Using Micro‐Flow Technology2019

    • Author(s)
      Sugisawa Naoto、Otake Yuma、Nakamura Hiroyuki、Fuse Shinichiro
    • Journal Title

      Chemistry - An Asian Journal

      Volume: 15 Issue: 1 Pages: 79-84

    • DOI

      10.1002/asia.201901429

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] アシルイミダゾリウムカチオン中間体を利用するマイクロフローN-メチル化ペプチド合成法の開発2019

    • Author(s)
      小竹佑磨、柴田裕介、林慶浩、川内進、中村浩之、布施新一郎
    • Organizer
      第77回有機合成化学協会関東支部シンポジウム
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Rapid and Mild Synthesis of Amino Acid N-Carboxy Anhydrides Using Basic-to-Acidic Flash Switching in a Micro-flow Reactor2019

    • Author(s)
      小竹佑磨、中村浩之、布施新一郎
    • Organizer
      第5回野依フォーラム若手育成塾
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] アシルイミダゾリウムカチオン中間体を利用するマイクロフローN-メチル化ペプチド合成法の開発とPterulamide I-IVの全合成2019

    • Author(s)
      小竹佑磨、 柴田裕介、林慶浩、川内進、中村浩之、布施新一郎
    • Organizer
      第61回天然有機化合物討論会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Remarks] 中村研究室ホームページ

    • URL

      http://syn.res.titech.ac.jp/

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Remarks] 布施研究室ホームページ

    • URL

      http://133.6.82.55/lab_pages/chemprocess/

    • Related Report
      2019 Annual Research Report

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Published: 2019-05-29   Modified: 2024-03-26  

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