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人工金属錯体を有するヘム酵素の開発および高難度酸化反応の達成

Research Project

Project/Area Number 19J21931
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Review Section Basic Section 37010:Bio-related chemistry
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

大村 慧太  名古屋大学, 理学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2019-04-25 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥3,100,000 (Direct Cost: ¥3,100,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
KeywordsシトクロムP450 / 酸化反応 / ヘム置換 / バイオ触媒 / 補因子置換
Outline of Research at the Start

ヘム酵素の一種であるシトクロムP450は常温・常圧下で強固なsp3C-H結合を直接水酸化するため、環境調和型のバイオ触媒として期待される。その中でも巨大菌由来のP450BM3は還元系と一体化した複合型酵素であり、ドメイン間での高効率な電子伝達が可能なため、極めて高い触媒活性を示す。しかし化学的に不活性な有機小分子(メタン、エタン等)の効率的な反応は達成されていない。これらの不活性分子に対する反応性を向上させるには、従来の変異導入だけでなく、活性中心となるヘム自体の反応性を改変する必要がある。そこで本研究では活性中心であるヘムを合成金属錯体に置換することでP450BM3の触媒活性の向上を目指す。

Outline of Annual Research Achievements

本申請課題では反応中心であるヘム補因子を合成金属錯体に置換することによるP450BM3の高機能化を目標とした.前年度の検討ではマンガンプロトポルフィリンIX結合型P450BM3(Mn-BM3)の高活性な変異体I401Pを発見した.そこで本年度はこのI401P変異体を起点とし,高機能化に向けた変異体の検討を行った.ラジカルクロック基質を用いた検討により,F87A変異の導入によって反応中間体であるアルキルラジカル種を長寿命化することを発見した.この結果は,ヘム上部に位置する87番目のフェニルアラニンが、立体障害の低いアラニンに置換されることによって,反応中間体のアルキルラジカル種に対する空間的な制御が緩和されたことによるものだと推測される.アルキルラジカル種は種々のC-H結合官能基化反応の中間体として知られ,その長寿命化を促進するF87A変異体を用いることにより,Mn-BM3による種々の非天然反応への展開が期待できる.
前年度に引き続き,触媒サイクルの律速段階を調査するために速度論的同位体効果(KIE)の測定を行った.前年度の検討では,①「非競合試験」と,②「分子間競合試験」を行い,いずれの実験においてもKIEは観測されないことが確認された.そこで本年度の検討では,③等価反応点の重水素化基質を用いて反応を行い生成物比から分子内競合を求める「分子内競合試験」を実施した.その結果,野生型(ヘム結合型)P450BM3を用いた場合とMn-BM3を用いた場合のいずれにおいても大きな分子内KIEが観測された.①,②,③の結果から,Mn-BM3による水素原子引抜き過程は十分素早く進行しており,触媒サイクルの律速ではないことが推定される.したがって,水素原子引抜き以外の反応過程(例えば,基質分子のタンパク質に対する結合過程,酸化活性種の生成過程)が触媒サイクルの律速であることが推定される.

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2022 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] North Carolina State University(米国)

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    • Author(s)
      Keita Omura, Yuichiro Aiba, Kazuto Suzuki, Shinya Ariyasu, Hiroshi Sugimoto, Osami Shoji
    • Journal Title

      ACS Catalysis

      Volume: -

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Crystals in minutes: instant on-site microcrystallisation of various flavours of the CYP102A1 (P450BM3) haem domain2020

    • Author(s)
      Stanfield, J. K., Omura, K., Matsumoto, A., Kasai, C., Sugimoto, H., Shiro, Y., Watanabe, Y., Shoji, O.
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 59 Issue: 19 Pages: 7611-7618

    • DOI

      10.1002/anie.201913407

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Kristalle in Minutenschnelle: Sofortige Mikrokristallisation verschiedenster Varianten der CYP102A1‐(P450BM3)‐Hamdomane2020

    • Author(s)
      J. K. Stanfield, K. Omura, A. Matsumoto, C. Kasai, H. Sugimoto, Y. Shiro, Y. Watanabe, O. Shoji
    • Journal Title

      Angew. Chem.

      Volume: 132 Issue: 19 Pages: 7681-7689

    • DOI

      10.1002/ange.201913407

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    • Peer Reviewed / Open Access
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    • Author(s)
      大村慧太、鈴木和人、愛場雄一郎、杉本宏、Reza Ghiladi、渡辺芳人、荘司長三
    • Organizer
      第14回バイオ関連化学シンポジウム
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      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Utilization of Multi-domain Enzimatic Scaffold of Cytochrome P450BM3 for Molecular Oxygen Activation with Non-biological Porphyrin Complex2020

    • Author(s)
      K. Omura, Y. Aiba, J. K. Stanfield, S. Ariyasu, H. Sugimoto, R. Ghiladi, Y. Watanabe, O.Shoji
    • Organizer
      第20回日本蛋白質科学会年会
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      2020 Annual Research Report
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      K. Omura, Y. Aiba, S. Ariyasu, H. Sugimoto, Y. Watanabe, O. Shoji
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      259th ACS National Meeting & Exposition
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      K. Omura, Y. Aiba, A. Matsumoto, J. K. Stanfield, H. Onoda, S. Ariyasu, H. Sugimoto, Y. Shiro, Y. Watanabe, O. Shoji
    • Organizer
      The 69th Conference of Japan Society of Coordination Chemistry
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      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] マンガンポルフィリン錯体を補因子に有するシトクロムP450の反応メカニズム解明に向けた諸検討2019

    • Author(s)
      大村慧太、愛場雄一郎、有安真也、杉本宏、渡辺芳人、荘司長三
    • Organizer
      第32回生物無機化学夏季セミナー
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  • [Presentation] Oxygen Activation by Self-sufficient Cytochrome P450 Reconstituted with Manganese Porphyrin2019

    • Author(s)
      K. Omura, Y. Aiba, A. Matsumoto, J. K. Stanfield, H. Onoda, S. Ariyasu, H. Sugimoto, Y. Shiro, Y. Watanabe, O. Shoji
    • Organizer
      19th International Conference on Biological Inorganic Chemistry (ICBIC-19)
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2019-05-29   Modified: 2024-03-26  

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