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Exploration of DNA cis-elements essential for mammalian circadian clock oscillation

Research Project

Project/Area Number 19J22296
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Review Section Basic Section 43010:Molecular biology-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

阿部 泰子  東京大学, 理学系研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2019-04-25 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥3,100,000 (Direct Cost: ¥3,100,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Keywords体内時計 / 転写制御 / DNAシスエレメント / CRISPR/Cas9 / ノックインマウス / 数理モデル
Outline of Research at the Start

体内時計機構はヒトをはじめとする地球上のほぼすべての生物種に存在し、代謝や睡眠などに約24時間周期のリズム性を生み出す。哺乳類においては、DNA上の6~10塩基の配列(時計シス配列)を介した転写制御によってフィードバックループが形成され、多くの遺伝子がリズミックに転写されている。本研究では、マウス個体において、特定の遺伝子近傍に存在する時計シス配列をゲノム編集技術を用いて欠損することにより、その遺伝子の転写レベルのみを一定にした状態を作り出す。この変異マウスを解析することにより、体内時計における各遺伝子の転写リズムの生理的な重要性を明らかにし、体内時計メカニズムの根源に迫る。

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、時計遺伝子Bmal1の近傍に存在する時計シス配列RREを欠損した変異細胞株およびマウス個体を樹立して解析することにより、RREを介した転写フィードバックループの重要性を明らかにしてきた。最終年度となる今年度は、数理モデルによるシミュレーションを併用することによってさらに詳細な分子メカニズムに迫った。その結果、RREの欠損によってBmal1の転写リズムが消失した状態においても、時計タンパク質の翻訳後制御による機能リズムが継続している可能性を見出した。さらに、数理モデルと培養細胞の双方において、RREを欠損することにより体内時計の振動が特定の摂動に対して脆弱になることを示すとともに、マウス個体の臓器を用いた網羅解析によってその作用機序を明らかにした。以上の結果から、約24時間周期で振動する体内時計の計時システムを頑強に保つ上で、Bmal1の上流のRREを介したフィードバック構造が重要な役割を果たすと結論づけた。
さらに本研究では、RREを介した転写制御機構において新規の転写因子が関わっている可能性を見出した。今年度は、これまでのスクリーニングによって得られた候補因子の転写活性化能を調べることにより、RREを介して転写を活性化する複数の転写因子を新たに同定することに成功した。これらの新規因子の発見は、体内時計の転写フィードバック機構を詳細に明らかにする上でも重要な鍵となると考えており、本研究の成果が体内時計メカニズムのさらなる理解につながると期待している。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2021 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] KAIST(韓国)

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] KAIST(韓国)

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Rhythmic transcription of Bmal1 stabilizes the circadian timekeeping system in mammals2021

    • Author(s)
      Yasuko O. Abe, Hikari Yoshitane, Dae Wook Kim, Michinori Koebis, Kazuki Nakao, Atsu Aiba, Jae Kyoung Kim and Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      第28回 日本時間生物学会 学術大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Rhythmic transcription of Bmal1 stabilizes the circadian timekeeping system in mammals(Bmal1 の転写リズムを介した概日時計振動の安定化機構)2021

    • Author(s)
      Yasuko O. Abe, Hikari Yoshitane, Dae Wook Kim, Michinori Koebis, Kazuki Nakao, Atsu Aiba, Jae Kyoung Kim and Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      2021年度 東京都医学総合研究所 所内研究発表会(第3部会)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 哺乳類概日時計におけるBmal1のリズミックな転写制御の生理的意義 (Physiological roles of rhythmic transcription of Bmal1 in the mammalian circadian clock)2020

    • Author(s)
      阿部泰子、吉種光、古戎道典、饗場篤、深田吉孝
    • Organizer
      第27回 日本時間生物学会学術大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 概日時計におけるBmal1発現リズムの生理的意義 (Physiological Roles of Bmal1 Expression Rhythm in the Circadian Clock Oscillation)2020

    • Author(s)
      阿部泰子、吉種光、古戎道典、饗場篤、深田吉孝
    • Organizer
      第20回 東京大学生命科学シンポジウム
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Rhythmic transcription of Bmal1 stabilizes the robust circadian oscillation2020

    • Author(s)
      Yasuko O. Abe, Hikari Yoshitane, Michinori Koebis, Atsu Aiba and Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      日本比較生理生化学会 第42回大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Physiological Roles of Bmal1 expression rhythms in the Circadian Clock Oscillation2019

    • Author(s)
      Yasuko O. Abe, Hikari Yoshitane, Michinori Koebis, Atsu Aiba and Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      International Conference on Mathematical Modeling and Applications (ICMMA) 2019
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 概日時計におけるBmal1のmRNAリズムの生理的意義(Physiological Functions of Bmal1 mRNA Rhythm in the Circadian Clock Oscillation)2019

    • Author(s)
      Yasuko O. Abe, Hikari Yoshitane, Michinori Koebis, Atsu Aiba and Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      第26回 日本時間生物学会 学術大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 概日時計におけるBmal1の転写リズムの生理的意義(Physiological Functions of Bmal1 Transcriptional Rhythms in the Circadian Clock Oscillation)2019

    • Author(s)
      Yasuko O. Abe, Hikari Yoshitane and Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      第92回 日本生化学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report

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Published: 2019-05-29   Modified: 2024-03-26  

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