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Structural analysis of biased agonism in GPCR and drug discovery

Research Project

Project/Area Number 19J22636
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Review Section Basic Section 47010:Pharmaceutical chemistry and drug development sciences-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

前田 信太郎  京都大学, 医学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2019-04-25 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥3,400,000 (Direct Cost: ¥3,400,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
KeywordsGPCR / S1P / バイアスド・アゴニスト / 結晶構造解析 / cryo-EM / シグナル伝達 / 構造解析 / 活性化機構
Outline of Research at the Start

GPCRは細胞外からの刺激に応じて細胞内に様々なシグナルを伝達することから、GPCRを標的とする治療薬が数多く開発されている。しかしながら、GPCRの活性化するシグナルは多岐にわたるため、治療薬によっては目的のもの以外のシグナル経路を変動させてしまうことが副作用の原因となっている。より副作用を少なく治療効果を高めるために、特定のシグナル経路のみを活性化させるバイアスド・アゴニストに期待が高まっているが、その構造生物学的機序(MOA)は明らかとなっていない。そこで、当研究室の所有するバイアスド・アゴニストとその標的GPCRの複合体の結晶構造からMOAを明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

Gタンパク質共役受容体(GPCR)は細胞外からの刺激に応じてその構造を変化させ、3量体Gタンパク質やアレスチンなどの細胞内の情報伝達を担う分子を活性化する。これまでに数多くのGPCR作動薬 (アゴニスト)が開発されたことにより、アゴニストの中には内在性基質とは異なるシグナル・プロファイルを示すもの(バイアスド・アゴニスト)があることが報告されてきた。しかしながら、これらのバイアスド・アゴニストが同一のGPCRに対してどのような構造変化を引き起こすのかは未だに解明されていない。本研究ではスフィンゴシン1-1リン酸 (S1P)を受容するS1PR3と様々なリガンドの複合体の構造を解析することで、バイアスド・アゴニストがどのように細胞内のシグナル伝達にバイアスを掛けているのか明らかにするとともに、目的のシグナルのみを伝えるバイアスド・アゴニストをデザインできるようにすることを目的としている。本年度は、昨年度まとめた論文が公開された。さらに、バイアスドアゴニストであるd16:1 S1Pの結合した状態のS1PR3を結晶構造解析で決定した。しかしながら、受容体側の構造は内在性アゴニストの結合した状態とほとんど同じで、バイアスの機構の構造生物学的解明には至らなかった。この原因はGタンパク質が結合するときに始めてリガンドによる構造の違いが見出せるのではないかと考えた。そこで、超低温電子顕微鏡を用いた単粒子解析によって、Gタンパク質複合体の構造解明を試みた。Gタンパク質が結合することで、リガンドと受容体単体の構造では見られなかった構造変化が確認された。これらの知見からバイアスドアゴニズム機構が解明されることが期待される。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2021 2020

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Endogenous agonist?bound S1PR3 structure reveals determinants of G protein?subtype bias2021

    • Author(s)
      Maeda Shintaro、Shiimura Yuki、Asada Hidetsugu、Hirata Kunio、Luo Fangjia、Nango Eriko、Tanaka Nobuo、Toyomoto Masayasu、Inoue Asuka、Aoki Junken、Iwata So、Hagiwara Masatoshi
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 7 Issue: 24

    • DOI

      10.1126/sciadv.abf5325

    • NAID

      120007052733

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Endogenous agonist-bound S1PR3 structure reveals determinants of G protein-subtype bias2021

    • Author(s)
      Shintaro Maeda , Yuki Shiimura , Hidetsugu Asada , Kunio Hirata , Fangjia Luo , Eriko Nango , Nobuo Tanaka , Masayasu Toyomoto , Asuka Inoue , Junken Aoki So Iwata and Masatoshi Hagiwara
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: -

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 活性型スフィンゴシン-1-リン酸受容体の結晶構造解析2021

    • Author(s)
      前田信太郎、椎村祐樹、浅田秀基、Fangkia Luo, 南後恵理子、井上飛鳥、岩田想、萩原正敏
    • Organizer
      第21回日本蛋白質学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Crystal structure of active Sphingosine-1-phosphate receptor 32021

    • Author(s)
      前田信太郎
    • Organizer
      The Lysophospholipid and Related Mediators Conference: From Bench to Clinic
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] スフィンゴシン-1-リン酸受容体におけるバイアスドアゴニズム機構2021

    • Author(s)
      前田信太郎、岩田想、萩原正敏
    • Organizer
      第94回日本生化学大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] アゴニスト結合型スフィンゴシン-1-リン酸受容体の結晶構造解析2021

    • Author(s)
      前田信太郎
    • Organizer
      第16回GPCR研究会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Crystal structure of natural agonist-bound lipid G protein-coupled receptor.2020

    • Author(s)
      Shintaro Maeda, Yuki Shiimura, Hidetsugu Asada, Kunio Hirata, Fangjia Luo, Eriko Nango, Masayasu Toyomoto, So Iwata, Masatoshi Hagiwara
    • Organizer
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] バイアスドリガンド2020

    • Inventor(s)
      萩原正敏、岩田想、前田信太郎
    • Industrial Property Rights Holder
      萩原正敏、岩田想、前田信太郎
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2020
    • Related Report
      2020 Annual Research Report

URL: 

Published: 2019-05-29   Modified: 2024-03-26  

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