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Elucidation of biodiversity formation mechanism in an ancient lake of Myanmar: an approach from the evolutionary history of freshwater fish

Research Project

Project/Area Number 19J23130
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Review Section Basic Section 45040:Ecology and environment-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

福家 悠介  京都大学, 理学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2019-04-25 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
Fiscal Year 2021: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2020: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2019: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywords生物相形成 / 古代湖 / 淡水魚 / ミャンマー / MIG-seq / 集団構造 / インレー湖 / Inle Lake / mitochondrial genome / phylogeny / endemic species / biodiversity
Outline of Research at the Start

本研究はミャンマーの古代湖・インレー湖周辺域における生物多様性の創出機構の解明を目的としている。本地域で特に多様性の高い淡水魚類に注目し、2つのアプローチから目的の達成を試みる。1)インレー湖固有種について網羅的な分子系統解析および分岐年代推定を行い、本地域における魚類相形成プロセスの概観を明らかにする。2)本地域で特に多様化しているコイ科魚類について、適応進化と種分化に注目して固有種の創出機構を明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

本年度は、本地域固有のコイ科魚類の1種であるMicrorasbora rubescensについて、形態解析およびMIG-seq法によるゲノムワイドな多型解析に基づいて、河川で繋がっている地域間における形態的非分化を伴わない遺伝的分化を明らかにした。この現象は、本種の止水環境への適応とそのニッチの保守性によって説明できるかもしれない。この成果はJournal of Fish Biology誌に発表した。
また、初年度に行ったタイワンドジョウ科の固有種の研究について、追加の遺伝解析および共同研究者との議論を行った。その結果、現在インレー湖周辺域でみられる遺伝的・形態的に分化した2系統の共存は、近縁種の二次的接触と異なる環境への適応によって形作られたことが示唆された。この成果は、論文にまとめ、現在国際学術誌に投稿中である。
さらに、改良MIG-seq法で得られたゲノムワイド多型データおよびミトコンドリアゲノムデータに基づいて、インレー湖とその周辺に広く分布する固有種8種群について、近縁種からの分岐および種内分岐の年代、遺伝的集団構造、地点間の遺伝子流動を推定した。その結果、固有種の近縁種からの分岐は、長期に渡って断続的に生じており、本地域の地理的隔離が厳密ではないことを強く示唆した。一方で、多数の固有種の存在は、近縁種との遺伝子流動が制限されていたことを示し、本地域の中程度の隔離が高い種多様性と固有性の形成に貢献したことが示唆された。固有種の集団構造には複数のパターンが認められた。一部の種間で認められた集団構造パターンの共通性は、その種の分散能力の程度やハビタットの類似性によって部分的に説明が可能であった。これらの成果は、現在投稿準備中である。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2023 2022 2021 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 2 results) Presentation (3 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] ミャンマー森林局/タウンジー大学(ミャンマー)

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      2021 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] カセサート大学(タイ)

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  • [Journal Article] Diversification in ancient Lake Biwa: integrative taxonomy reveals overlooked species diversity of the Japanese freshwater snail genus Semisulcospira (Mollusca: Semisulcospiridae)2023

    • Author(s)
      Sawada Naoto、Fuke Yusuke
    • Journal Title

      Contributions to Zoology

      Volume: 92 Pages: 1-37

    • DOI

      10.1163/18759866-bja10035

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Fish diversity of a spring field in Hopong Town, Taunggyi District, Shan State, Myanmar (the Salween River Basin), with genetic comparisons to some “species endemic to Inle Lake”2022

    • Author(s)
      Kano Yuichi、Fuke Yusuke、Musikasinthorn Prachya、Iwata Akihisa、Soe Tin Mya、Tun Sein、Yun LKC、Win Seint Seint、Matsui Shoko、Tabata Ryoichi、Watanabe Katsutoshi
    • Journal Title

      Biodiversity Data Journal

      Volume: 10

    • DOI

      10.3897/bdj.10.e80101

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Cryptic genetic divergence of the red dwarf rasbora, <i>Microrasbora rubescens</i> , in and around Inle Lake: implications for the origin of endemicity in the ancient lake in Myanmar2022

    • Author(s)
      Fuke Yusuke、Kano Yuichi、Tun Sein、Yun LKC、Win Seint Seint、Watanabe Katsutoshi
    • Journal Title

      Journal of Fish Biology

      Volume: 101 Issue: 5 Pages: 1235-1247

    • DOI

      10.1111/jfb.15195

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Rediscovery of a native freshwater shrimp, Neocaridina denticulata, and expansion of an invasive species in and around Lake Biwa, Japan: genetic and morphological approach2022

    • Author(s)
      Onuki Keisuke、Fuke Yusuke
    • Journal Title

      Conservation Genetics

      Volume: 23 Issue: 5 Pages: 967-980

    • DOI

      10.1007/s10592-022-01467-1

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Systematic revision of the Japanese freshwater snail2022

    • Author(s)
      Sawada Naoto、Fuke Yusuke
    • Journal Title

      Invertebrate Systematics

      Volume: 36 Issue: 12 Pages: 1139-1177

    • DOI

      10.1071/is22042

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Annandale’s collection of freshwater fishes from Inle Lake, Myanmar, housed in the Kyoto University Museum2021

    • Author(s)
      Yusuke Fuke, Takashi P. Satoh, Yuichi Kano, Katsutoshi Watanabe
    • Journal Title

      Ichthyological Research

      Volume: 68 Issue: 4 Pages: 556-560

    • DOI

      10.1007/s10228-021-00806-5

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ミャンマーの古代湖・インレー湖における魚類相形成:系統・集団遺伝学的アプローチ2021

    • Author(s)
      福家悠介・鹿野雄一・Prachya Musikasinthorn・渡辺勝敏
    • Organizer
      日本生態学会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] ミャンマー・インレー湖における固有コイと外来コイの交雑の遺伝的・形態的証拠2020

    • Author(s)
      福家悠介・小泉佳祐・Prachya Musikasinthorn・鹿野雄一・渡辺勝敏
    • Organizer
      日本生態学会
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      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] ミャンマーの古代湖・インレー湖における固有淡水魚類の起源2019

    • Author(s)
      福家悠介・Prachya Musikasinthorn・鹿野雄一・松井彰子・田畑諒一・岩田明久・渡辺勝敏
    • Organizer
      日本陸水学会
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      2019 Annual Research Report
  • [Remarks] 琵琶湖流域におけるカワリヌマエビ類の実態を解明―1世紀ぶりの在来種の発見と外来種の分布拡大を報告―

    • URL

      https://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research-news/2022-08-31-2

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      2021 Annual Research Report
  • [Remarks] 琵琶湖から現生カワニナの3新種を発見―古代湖における巻貝の種多様性を再評価―

    • URL

      https://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research-news/2022-08-31-1

    • Related Report
      2021 Annual Research Report

URL: 

Published: 2019-05-29   Modified: 2024-03-26  

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