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基質模倣物による水酸化酵素の制御を利用した菌体内物質変換系の開発

Research Project

Project/Area Number 19J23669
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

唐澤 昌之  名古屋大学, 理学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2019-04-25 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥3,100,000 (Direct Cost: ¥3,100,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Keywordsバイオ触媒 / 菌体触媒 / シトクロムP450 / 酸化反応 / デコイ分子 / 擬似基質 / 大腸菌 / ポリン
Outline of Research at the Start

ベンゼンに代表される不活性な石油由来炭化水素を、より有用な化合物へと変換する菌体触媒の開発を行う。シトクロムP450BM3は長鎖脂肪酸の水酸化酵素であり、基質模倣物(擬似基質)によって基質選択性を変換できる。本研究では、P450BM3を過剰発現させた大腸菌に擬似基質を取り込ませることで、菌体内で基質の水酸化が進行する新規反応系を構築する。また、擬似基質の構造を調整し、菌体反応に有効な擬似基質の創製や、菌体自身が擬似基質を生産する反応開発を目指す。

Outline of Annual Research Achievements

水酸化酵素であるP450BM3 (BM3) は、擬似基質(デコイ分子)によって基質特異性を変換できる。これまでに、BM3を発現させた大腸菌にデコイ分子を取り込ませることで、菌体内の補酵素再生系を利用して非天然基質の水酸化が進行することを明らかにしている。また、外膜タンパク質OmpFの変異体をBM3と共発現させることで、菌体反応が促進されることを見出している。OmpF変異体の機能を精査するため、ピレンを部分骨格として有するデコイ分子を模した蛍光分子を合成し、大腸菌への取り込みを評価した。蛍光分子を大腸菌の懸濁液に加えてインキュベートし、顕微鏡で観察したところ、OmpF変異体を発現させた大腸菌からのみ明瞭な蛍光が観測された。また、培養後の上清の紫外可視吸収スペクトルを測定し、蛍光分子の吸収から菌体への取り込み効率を算出したところ、野生型OmpFを発現させた大腸菌では取り込み効率が11%であったのに対し、OmpF変異体を発現させた場合では74%に増加した。以上の結果から、OmpF変異体が擬似基質の取り込みを促進していることが示唆された。また、天然物が擬似基質として機能するかを調査するため、アシルホモセリンラクトン(CnHSL)とアシルホモセリン(CnHS)の存在下、BM3によるベンゼンの水酸化を行った。AHSLの中では炭素鎖8のものが、AHSの中では9のものが酵素反応を効果的に促進し、C9HSの存在下、BM3は毎分24回ベンゼンを酸化した。X線結晶構造解析から、C12HSLのラクトン環はC16HSのカルボキシ基よりもBM3の基質結合部位の奥に固定化されていることが明らかとなり、酵素反応で観測された鎖長依存性の差は、両者の結合状態の違いに起因していると推測している。菌体自身がデコイ分子を生合成する新しい菌体触媒の開発につながることが期待される。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2022 2020 2019

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] Designer Outer Membrane Protein Facilitates Uptake of Decoy Molecules into a Cytochrome P450BM3-Based Whole-Cell Biocatalyst (English ver.)2022

    • Author(s)
      M. Karasawa, K. Yonemura, J. K. Stanfield, K. Suzuki, O. Shoji
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 64(7) Issue: 7

    • DOI

      10.1002/anie.202111612

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 外部添加物によるP450BM3の活性化を利用した菌体内での炭化水素の直接酸化2020

    • Author(s)
      唐澤昌之、米村開、鈴木和人、ジョシュア・カイル・スタンフィールド、柳澤颯太、渡辺芳人、荘司長三
    • Organizer
      日本化学会 第100春季年会 (2020)
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Direct Hydroxylation of Benzene to Phenol Catalyzed by the Whole-Cell Biocatalyst Utilizing Substrate Misrecognition of P450BM32019

    • Author(s)
      M. Karasawa, K. Suzuki, J. K. Stanfield, S. Yanagisawa, Y. Watanabe, O. Shoji
    • Organizer
      19th International Conference on Biological Inorganic Chemistry (ICBIC-19)
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Direct Hydroxylation of Benzene to Phenol Catalyzed by the Whole-Cell Biocatalyst Utilizing Substrate Misrecognition of P450BM32019

    • Author(s)
      M. Karasawa, K. Suzuki, J. K. Stanfield, S. Yanagisawa, Y. Watanabe, O. Shoji
    • Organizer
      15th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry (ISABC15)
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Designing the Whole-Cell Biocatalyst for Hydroxylation of Benzene to Phenol Utilizing the Malfunction of Cytochrome P450BM32019

    • Author(s)
      M. Karasawa, K. Suzuki, J. K. Stanfield, S. Yanagisawa, Y. Watanabe, O. Shoji
    • Organizer
      The 29th Symposium on Role of Metals in Biological Reactions, Biology and Medicine (SRM2019)
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 擬似基質による脂肪酸水酸化酵素の活性化法に基づく菌体触媒の開発2019

    • Author(s)
      唐澤昌之、鈴木和人、ジョシュア・カイル・スタンフィールド、柳澤颯太、渡辺芳人、荘司長三
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report

URL: 

Published: 2019-05-29   Modified: 2024-03-26  

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