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Mathematical modeling of a continuous system of cells growing on an elastic substrate

Research Project

Project/Area Number 19K03629
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 12040:Applied mathematics and statistics-related
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

Kobayashi Yasuaki  北海道大学, 電子科学研究所, 准教授 (50455622)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywordsパターン形成 / 形態形成 / 反応拡散系 / 数理モデリング / 分岐 / 幹細胞 / 幹細胞ダイナミクス / 分岐理論
Outline of Research at the Start

生物の形態形成においては、細胞が周りの組織との接着によって束縛されつつ増殖していくことで特徴的なパターンが生じる。細胞増殖が周辺組織の変形を促すと同時に、増殖能をもつ細胞の密度分布も周辺組織の変形にともなって変化していくため、増殖細胞の層と周辺組織の間には双方向の相互作用が存在する。したがって形態形成を理解するためには、この双方向の相互作用を考慮した理論的な枠組みが必要である。そこで本研究ではやわらかい組織の上で増殖する細胞系における、理論的に扱いやすい一般的な連続体モデルを構築する。モデルの解析を通して、増殖細胞系の形態形成を支配する原理の解明を目指す。

Outline of Final Research Achievements

We have constructed mathematical models to analyze the pattern formation caused by cell systems proliferating on soft substrates like epidermal cells. We successfully incorporated cell division on the basement membrane indirectly as an adhesion strength field, and derived a mathematical model that can describe membrane deformation due to increased adhesion strength. Through the analysis of the model, we clarified that an upward protrusion is formed where the adhesion strength is large. We also extended the model and carried out numerical simulations of the basement membrane model describing plastic deformation and of the TJ expression layer in the epidermal granular layer. In both cases, we obtained results supporting the experimental findings.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究で提案する数理モデルは増殖細胞系の一般的な性質に基づくものであり,3次元の形態形成や多種の化学濃度場とのカップリングなど多くの系に拡張可能なモデルとなっている。従って様々な応用の可能性がある.また生命現象におけるパターン形成の一般的な原理の解明に寄与すると期待でき る。また皮膚科学の実験研究者に対して,数理モデルの予測に基づくフィードバックも与えており,生命科学や医学における学術的波及効果も期待できる。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2023 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] Zonula occludens‐1 distribution and barrier functions are affected by epithelial proliferation and turnover rates2023

    • Author(s)
      Imafuku Keisuke、Iwata Hiroaki、Natsuga Ken、Okumura Makoto、Kobayashi Yasuaki、Kitahata Hiroyuki、Kubo Akiharu、Nagayama Masaharu、Ujiie Hideyuki
    • Journal Title

      Cell Proliferation

      Volume: - Issue: 9

    • DOI

      10.1111/cpr.13441

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A reaction?diffusion particle model for clustering of self-propelled oil droplets on a surfactant solution2021

    • Author(s)
      Kim Minsoo、Okamoto Mamoru、Yasugahira Yusuke、Tanaka Shinpei、Nakata Satoshi、Kobayashi Yasuaki、Nagayama Masaharu
    • Journal Title

      Physica D: Nonlinear Phenomena

      Volume: 425 Pages: 132949-132949

    • DOI

      10.1016/j.physd.2021.132949

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 塑性変形可能な基底膜モデルを用いた毛包形成メカニズムの数理的考察2022

    • Author(s)
      奥村 真善美, 小林 康明, 長山 雅晴, 藤原 裕展, 安ヶ平 裕介,大野 航太
    • Organizer
      第27回計算工学講演会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 塑性変形可能な基底膜モデルを用いた毛包のシリンダー構造の再現2022

    • Author(s)
      奥村真善美,小林康明,長山雅晴,藤原裕展,安ヶ平祐介,大野 航太
    • Organizer
      2022年度日本数学会秋季総合分科会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] A computational model of the epidermis with the deformable dermis and its application to skin diseases2021

    • Author(s)
      Yasuaki Kobayashi, Kota Ohno, Masaaki Uesaka, Takeshi Gotoda, Mitsuhiro Denda, Hideyuki Kosumi, Mika Watanabe, Ken Natsuga, Masaharu Nagayama
    • Organizer
      The 22nd RIES-Hokudai International Symposium
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 真皮形状変形を考慮した表皮の数理モデルと皮膚疾患への応用2021

    • Author(s)
      小林康明
    • Organizer
      第7回北海道大学部局横断シンポジウム
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 真皮の塑性変形と形態形成の数理モデル構築2021

    • Author(s)
      小林康明,大野航太,長山雅晴
    • Organizer
      第26回計算工学講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 真皮形状変形の数理モデリング2021

    • Author(s)
      小林康明,安ヶ平祐介,長山雅晴
    • Organizer
      医学研究における数理的方法
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 真皮の塑性変形と形態形成の数理モデル構築2020

    • Author(s)
      小林康明,安ヶ平祐介,大野航太,長山雅晴
    • Organizer
      日本応用数理学会2020年度年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 真皮の塑性変形と形態形成の数理モデル構築2020

    • Author(s)
      小林康明,安ヶ平祐介,長山雅晴
    • Organizer
      2020年度応用数学合同研究集会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Mathematical modeling of plastic deformation of the basement membrane2020

    • Author(s)
      Yasuaki Kobayashi, Yusuke Yasugahira, Masaharu Nagayama
    • Organizer
      The 21st RIES-Hokudai International Symposium
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Interplay between epidermal stem cells and dermal deformation2019

    • Author(s)
      Yasuaki Kobayashi, Yusuke Yasugahira, Hiroyuki Kitahata, Mika Watanabe, Ken Natsuga, Masaharu Nagayama
    • Organizer
      Japan-Singapore Skin Research Conference 2019
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 表皮幹細胞ダイナミクスと真皮形状変形の相互作用2019

    • Author(s)
      小林康明,安ヶ平祐介,北畑裕之,渡邉美佳,夏賀健,長山雅晴
    • Organizer
      皮膚科学と数理科学の接点
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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