• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Applications to the topological computation for coupled network dynamical systems of Large degrees of freedom

Research Project

Project/Area Number 19K03644
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 12040:Applied mathematics and statistics-related
Research InstitutionRyukoku University

Principal Investigator

岡 宏枝 (國府宏枝)  龍谷大学, 公私立大学の部局等, 研究員 (20215221)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2021: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Keywords力学系 / 位相的計算理論 / 大域的構造 / モース理論 / パーシシステント・ホモロジー / パーシステント・ホモロジー / モース分解 / ネットワーク結合力学系 / 大自由度
Outline of Research at the Start

生命科学などにみられる遺伝子制御ネットワークは,多数のノードからなる大自由度ネットワー ク結合力学系として捉えられ、その数学的理解は応用上極めて重要である。計算機性能の向上により,高次元の変数や多くのパラメータを含む微分方程式の数値シミュレーションにより大量の数値テータを得られるようになったが、それを解析して数学的な結果を導くためには,従来の 数学解析の手法には限界かあり,新しい発想に基つく理論手法が望まれる。
申請者は,位相的方法と計算機援用解析を融合させて力学系の位相的計算理論の研究を進めてきたが、この方法を大自由度ネットワー ク結合力学系に適用するために整備・拡張する。

Outline of Annual Research Achievements

本年度の実績は以下の通りである:1) switching systemは生命科学で扱われる生体分子の制御ネットワーク結合系を区分線形な常備分方程式とその連続系への摂動として捉え、数学的な性質を抽出したものである。研究代表者たちは、今までの科研費研究でこの対象を研究し、かなり広範囲に適用できるようになった。この定式化は、この科研費研究の始まった当初より少しずつ進化しており、この2024年3月のRutgers University の出張で共同研究者との議論でほぼ完成され、論文は1、2ヶ月中に投稿予定である。 2) Rutgers Universityに出張し、論文(Global Dynamics of Ordinary Differential Equations: Wall Labelings, Conley Complexes and Ramp Systems, Mischaikow, Gameiro, Gedeon, Kokubu, Oka, 他)をほぼ完成させた。また、共同研究者であるM.Gameiro氏たちの作ったコンピュータソフトDSGRN (dynamic signatures generated by regulatory networks)の使い方を学び、今後具体的なネットワークについて計算を試みるつもりである。3) いくつかの国際学会TDAweek2023(京都大学)、iciam2023(早稲田大学), KiPDD(慶応義塾大学)、オーストラリア Creswickでの研究会Dynamics and Computationに参加した。これまで、コロナ禍で制限されていた海外渡航の制限がなくなり多くの国際学会が開催され多くの情報交換が出来た。
4) 研究協力者である中川晃成氏と河川測量図のデータを整理した。パーシステント・ホモロジーを用いて解析する予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

本研究課題:大自由度結合ネットワークのための位相計算理論の整備と応用は平成28年度から令和元年の生命科学における結合力学系の大域的構造解明のための位相計算理論を集大成する目的で始めている。前年度も遅れを本年度も引きずっているが、次年度で集大成できる予定である。遅れている理由としては、前年度の遅れ挽回しきれていないことが大きい。(昨年度の理由は以下のようなものである:引き続くコロナ禍で海外渡航を控えており、オンラインによる共同研究も何度か試みているが、時間調整が難しいこと、コミュニケーション手段に視覚的なものが使いにくく音声による対話が中心であり、Rutgers Univ.において進展している内容を理解するのに手間取り、十分な進展を見るまでに至っていない。国内の研究会においても、議論の回数が減っており、活発な議論ができず、進展に影響していると思われる。)また、個人的なことであるが、申請者は、3月に退職し、生活環境が大きく変わり、コンピュータネットワークの構築等、諸々時間がかかったことなどがある。

Strategy for Future Research Activity

論文”Global Dynamics of Ordinary Differential Equations: Wall Labelings, Conley Complexes and Ramp System”は本年度中にまとめる予定である。また、この研究を通じて出てきた新たなアイデアは、2023度から始まった科研費研究にて展開するつもりである。

Report

(5 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2024 2022 2021 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Open Access: 2 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Remarks (3 results)

  • [Int'l Joint Research] Rutgers University/Montana state university(米国)

    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] Rutgers University/Montana state university(米国)

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] Rutgers University/Montana state university(米国)

    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] Rutgers University/Montana state university(米国)

    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] Rutgers University/Montana State University(米国)

    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] 國立交通大學(その他の国・地域)

    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Journal Article] オランダ人水理工師の来日から淀川修築工事の創始まで -淀川資料館所蔵史料と公文書に見る人々と事跡2024

    • Author(s)
      中川晃成
    • Journal Title

      龍谷大学 里山学研究センター 2023年度 年次報告書

      Volume: - Pages: 137-156

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Open Access
  • [Journal Article] Equilibria and their stability in networks with steep sigmoidal nonlinearities2021

    • Author(s)
      William Duncan, Tomas Gedeon, Hiroshi Kokubu, Konstantin Mischaikow, Hiroe Oka,
    • Journal Title

      SIAM J. Applied Dynamical Systems

      Volume: 20 Issue: 4 Pages: 2108-2141

    • DOI

      10.1137/21m1398331

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Equilibria and their Stability in Networks with Steep Sigmoidal Nonlnearities2022

    • Author(s)
      Hiroe Oka
    • Organizer
      日本数学会2022、応用数学分科会(札幌)
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Stability of circular Persistence2020

    • Author(s)
      Hiroe Oka
    • Organizer
      力学系冬の力学系冬の研究集会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Morse decomposition of switching systems2019

    • Author(s)
      Hiroe Oka
    • Organizer
      9th International Congress on Industrial and Applied Mathematics (ICIAM 2019)
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] KOKUBU Hiroe(OKA Hiroe)

    • URL

      https://www.rikou.ryukoku.ac.jp/en/teachers/math05.html

    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Remarks] KOKUBU HiroeOKA Hiroe)

    • URL

      https://www.rikou.ryukoku.ac.jp/en/teachers/math05.html

    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Remarks]

    • URL

      https://whale.math.ryukoku.ac.jp/~oka/

    • Related Report
      2019 Research-status Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi