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Structural separation analysis of co-crystallized organic molecules and utilization of crystal sponge laser desorption ionization mass spectrometry

Research Project

Project/Area Number 19K05447
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 33010:Structural organic chemistry and physical organic chemistry-related
Research InstitutionTokushima Bunri University

Principal Investigator

YAMAGUCHI Kentaro  徳島文理大学, 薬学部, 教授 (50159208)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
KeywordsX線解析 / 質量分析 / 結晶スポンジ / 共結晶 / ホスト-ゲスト化学 / ベンゾフェノンテトラカルボン酸 / ピラジン / テトラジン / 環状化合物 / アダマンタン / 包接 / イメージング質量分析 / ホストーゲスト相互作用 / レーザー脱離イオン化質量分析 / 単結晶X線構造解析 / MALDI / 分子計算 / レーザー脱離イオン化
Outline of Research at the Start

我々はアダマンタンの剛直性とその強い配向性を利用して2脚型アダマンタン分子が結晶中で2量体環状超分子を形成し,その内部に選択的にパラコートカチオン1分子を包接することを報告した.さらに,Hirshfeld表面解析により,このときの包摂のドライビングフォースは分散力であると推察された.これらの先行研究に基づき種々の有機化合物の構造決定および分離を実現する手法を構築する.
結晶スポンジにゲストを取り込み,X線解析と同時に、この結晶によるレーザー脱離イオン化質量分析法(CSI-LDI/MS)を用いて構造を解析する手法は独自の手法であり,共結晶を利用した新しい構造分離分析法の確立する.

Outline of Final Research Achievements

We synthesized several stable cyclic adamantane crystal sponges and established a method for soaking guest molecules into the crystal sponge (host molecule). On the other hand, various experiments were conducted on the single-crystal to single-crystal guest inclusion method, and the optimum conditions were found. For single crystal X-ray structure analysis methods including disorder treatment, we investigated microcrystals using high-sensitivity X-ray detectors and high-power X-ray sources, and established related techniques and means.
In mass analysis, we established a laser desorption ionization method for guest inclusion crystal sponges. Furthermore, we have found an interaction evaluation method by DFT calculation of the interaction between the guest molecule in the crystal sponge and the frame structures.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究により,種々の有機化合物の構造決定および分離を実現することができた.特にX線結晶解析に適さない油状または液体分子の解析に成功した.これはホスト-ゲスト化学の新たな活用に繋がり、共結晶化の機構解明に一歩近づいた.さらに医薬品の共結晶体を構築することによりプロドラッグなど結晶製剤における溶解度や安定性の制御にも応用できる.今後,ホスト分子とゲスト分子の共結晶体の形成をとおして,生理活性物質のホストとの相互作用が分子レベル(原子分解能)で解析され,創薬研究をさらに活性化することができる.X線解析と質量分析の連携によって当該分野の研究に貢献することが期待できるため社会的意義は大きい.

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (20 results)

All 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (11 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Structure analysis of inclusion crystals of diimide-based macrocycles with halocarbons2022

    • Author(s)
      Tominaga, M.; Kondo, S.; Hyodo, T.; Kawahata, M.; and Yamaguchi, K.
    • Journal Title

      CrystEngComm

      Volume: 24 Issue: 17 Pages: 3113-3308

    • DOI

      10.1039/d2ce00118g

    • Related Report
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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Combined Analysis Based on a Crystalline Sponge Method2021

    • Author(s)
      Ohara, K.; and Yamaguchi, K.
    • Journal Title

      Analytical Sciences

      Volume: 37 Issue: 1 Pages: 167-175

    • DOI

      10.2116/analsci.20SAR07

    • NAID

      130007966705

    • ISSN
      0910-6340, 1348-2246
    • Year and Date
      2021-01-10
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Guest-dependent single-crystal-to-single-crystal transformations in porous adamantane-bearing macrocycles2021

    • Author(s)
      Hyodo Tadashi、Tominaga Masahide、Yamaguchi Kentaro
    • Journal Title

      CrystEngComm

      Volume: 23 Issue: 7 Pages: 1539-1543

    • DOI

      10.1039/d0ce01782e

    • Related Report
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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Selective alkane co-inclusion by methylene- and adamantane-bridged macrocycle with biphenyl units2021

    • Author(s)
      Tominaga, M.; Fujimaru, K.; Hyodo, T.; and Yamaguchi, K.
    • Journal Title

      CrystEngComm.

      Volume: 23 Issue: 30 Pages: 5157-5163

    • DOI

      10.1039/d1ce00722j

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Solvent-dependent alignments and halogen-related interactions in inclusion crystals of adamantane-based macrocycle with pyridazine moieties2021

    • Author(s)
      *Tominaga Masahide、Hyodo Tadashi、Hikami Yuya、*Yamaguchi Kentaro
    • Journal Title

      CrystEngComm

      Volume: 23 Issue: 2 Pages: 436-442

    • DOI

      10.1039/d0ce01576h

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      2020 Research-status Report
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  • [Journal Article] Co-Inclusion of cyclic ethers and chloroform by a macrocycle with benzophenone-3,3′,4,4′-tetracarboxylic diimide units2020

    • Author(s)
      Tominaga Masahide、Mizuno Kosuke、Yamamoto Haruka、Hyodo Tadashi、Yamaguchi Kentaro
    • Journal Title

      CrystEngComm

      Volume: 22 Issue: 17 Pages: 2964-2969

    • DOI

      10.1039/d0ce00221f

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  • [Journal Article] Laser Desorption Ionization-Mass Spectrometry of Linear Diphenylenes Encapsulated in Crystalline Sponge2020

    • Author(s)
      Ohara Kazuaki、Hayashi Yukako、Yamaguchi Kentaro
    • Journal Title

      Bulletin of the Chemical Society of Japan

      Volume: 93 Issue: 8 Pages: 963-968

    • DOI

      10.1246/bcsj.20200062

    • NAID

      130007888003

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  • [Journal Article] One-Step Synthesis of Cyclophanes as Crystalline Sponge and Their [2]Catenanes through SNAr Reactions2020

    • Author(s)
      Masahide Tominaga,Tadashi Hyodo, Yumi Maekawa, Masatoshi Kawahata,Kentaro Yamaguchi
    • Journal Title

      Chemistry―A European Journal

      Volume: 26 Issue: 23 Pages: 5157-5161

    • DOI

      10.1002/chem.201905854

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    • Author(s)
      Kawahata, M.; Tominaga, M.; Fujimaru, K.; Hyodo, T.; Yamaguchi, K.
    • Journal Title

      Tetrahedron

      Volume: 75 Pages: 130576-130580

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      山口健太郎
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      兵頭直,富永昌英,山口健太郎
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      杉本美久,富永昌英,兵頭直,山口健太郎
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      林侑加子,小原一朗,山口健太郎
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      有機微量分析研究懇談会第37回合同シンポジウム
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      富永昌英,兵頭直,山口健太郎
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      日本化学会第100春季年会
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      矢野紋音,林侑加子,小原一朗,山口健太郎
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      日本薬学会第140年会
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      小原一朗,林侑加子,山口健太郎
    • Organizer
      第28回有機結晶シンポジウム
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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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