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Development of protein production system by using translation system from mesophilic methanogen

Research Project

Project/Area Number 19K05692
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 37010:Bio-related chemistry
Research InstitutionGifu University

Principal Investigator

Yokogawa Takashi  岐阜大学, 工学部, 教授 (90242304)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywords無細胞タンパク質合成系 / 遺伝子工学 / メタン生成アーキア / 翻訳 / tRNA / 不活化tRNA / ジスルフィド結合 / tRNAの不活性化 / メタン / アーキア / ラジカルSAM酵素 / 無酸素環境
Outline of Research at the Start

常温で成育するアーキアを培養し、その細胞抽出液を用いた無細胞タンパク質合成系を構築する。アーキアは培養することが難しいので、翻訳の個々の反応は十分に理解されていない。そこで、アーキア無細胞タンパク質合成系を利用して、生化学的な研究を行い、翻訳過程への理解を深める。また、これまで合成することが難しかったタンパク質を、無酸素環境下で反応するなど、アーキアの特徴を活かすことで、合成できるようにならないか検討する。
またアーキアの遺伝子工学を確立し、生細胞を用いたタンパク質産生系を構築することにも並行して取り組む。アーキアの遺伝子工学により得られる知見は、地球温暖化対策等の環境問題にも資する。

Outline of Final Research Achievements

Microgram-scale chloramphenicol acetyltransferase synthesis was successfully achieved by using cell-free translation system with the cell extract anaerobically prepared from 1.5 liters culture of mesophilic methanogen, Methanosarcina acetivorans. However, the extract was unstable. The reasons of its instability appeared to be inactivation of tRNAs and oxidative disulfide bond formations of translation factors. The author also successfully introduced a vector DNA into M. acetivorans cells and confirmed the expression of
puromycin N-acetyltransferase gene in the cells.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ヒトには多くの機能未知タンパク質が存在する。機能未知タンパク質の機能を調べることが現代の課題だが、そのためには天然の状態に近いタンパク質が必要となる。ヒトの全塩基配列がわかっているので、大腸菌に遺伝子を導入してタンパク質を生産させることが多いが、大腸菌細胞内で沈殿してしまうことも多い。アーキアは見た目が大腸菌に似ていても細胞の成分は真核生物に近いと考えられるので、天然に近い状態のタンパク質が得られる可能性がある。この技術は、タンパク質を生産するための選択肢の一つとなりうる。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Boosting Auto-Induction of Recombinant Proteins in Escherichia coli with Glucose and Lactose Additives2021

    • Author(s)
      Tahara Nariyasu、Tachibana Itaru、Takeo Kazuyo、Yamashita Shinji、Shimada Atsuhiro、Hashimoto Misuzu、Ohno Satoshi、Yokogawa Takashi、Nakagawa Tsutomu、Suzuki Fumiaki、Ebihara Akio
    • Journal Title

      Protein & Peptide Letters

      Volume: 28 Issue: 10 Pages: 1180-1190

    • DOI

      10.2174/0929866528666210805120715

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Application of solid-phase DNA probe method with cleavage by deoxyribozyme for analysis of long non-coding RNAs2020

    • Author(s)
      Arakawa Shizuka、Kamizaki Kohsuke、Kuwana Yusuke、Kataoka Naruki、Naoe Chieko、Takemoto Chie、Yokogawa Takashi、Hori Hiroyuki
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 168 Issue: 3 Pages: 273-283

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa048

    • NAID

      40022375426

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reconstituted cell-free protein synthesis using in vitro transcribed tRNAs2020

    • Author(s)
      Hibi Keita、Amikura Kazuaki、Sugiura Naoki、Masuda Keiko、Ohno Satoshi、Yokogawa Takashi、Ueda Takuya、Shimizu Yoshihiro
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 3 Issue: 1 Pages: 350-350

    • DOI

      10.1038/s42003-020-1074-2

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification of a radical SAM enzyme involved in the synthesis of archaeosine2019

    • Author(s)
      Yokogawa Takashi、Nomura Yuichiro、Yasuda Akihiro、Ogino Hiromi、Hiura Keita、Nakada Saori、Oka Natsuhisa、Ando Kaori、Kawamura Takuya、Hirata Akira、Hori Hiroyuki、Ohno Satoshi
    • Journal Title

      Nature Chemical Biology

      Volume: 15 Issue: 12 Pages: 1148-1155

    • DOI

      10.1038/s41589-019-0390-7

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] アーキア由来 RNA free RNase P の基質特異性2022

    • Author(s)
      横川 隆志、小川 純平、石田 祥輝、尾木野 弘実、大野 敏
    • Organizer
      第16回 無細胞生命科学研究会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] メタン生成アーキアMethanosarcina acetivoransの無細胞タンパク質合成系の構築2021

    • Author(s)
      横川 隆志、平沼 芳哉、大平 翼、林 蒔歩、尾木野 弘実、大野 敏
    • Organizer
      第15回無細胞生命科学研究会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] アーキア特異的修飾ヌクレオシド、アーケオシンの合成に関わる新奇ラジカルSAM酵素2019

    • Author(s)
      ○横川 隆志、能村 友一朗、安田 旭宏、尾木野 弘実、日浦 恵太、仲田 沙織、岡 夏央、安藤 香織、河村 卓哉、平田 章、堀 弘幸、大野 敏
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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