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Molecular mechanism of Type III plasmid segregation

Research Project

Project/Area Number 19K05774
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

Hayashi Ikuko  横浜市立大学, 生命医科学研究科, 准教授 (80464527)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywords細胞骨格 / 微小管 / プラスミド / 微生物 / トレッドミル / 線維構造 / 遺伝子分配 / 毒素遺伝子 / チューブリン / 動態 / タンパク質 / 立体構造解析 / 動態解析 / 可視化 / 生体分子 / 高分子構造・物性 / 細菌
Outline of Research at the Start

病原性バクテリアの毒素の多くは、染色体とは独立した複製・分配機構をもつプラスミドにより産生される。病原性バチルス属の毒素プラスミドの分配にはチューブリン相同タンパク質TubZが必須である。TubZはGTPの加水分解に依存して動的な繊維構造を形成するが、その詳細な分子機構は不明である。本研究ではTubZ繊維により制御されるプラスミド分配装置について分子解析を行う。

Outline of Final Research Achievements

The FtsZ/tubulin-like GTPase TubZ was identified as a segregation factor of the virulence plasmids pXO1 in Bacillus cereus and Bacillus anthracis. TubZ exhibits high GTPase activity and assembles into polymers both in vivo and in vitro, and its treadmilling movement is required for stable maintenance of the plasmid in the cell. We determined the crystal structures of two TubZ regulators, TubR and TubY. DNase 1 footprinting analysis demonstrated that TubR and TubY regulate the expression of their own genes and that TubY associates with the promoter region of tubRZ cooperatively with TubR. TubY belongs to the MerR family transcriptional factor which functions as a dimeric protein. However, the C-terminal domain of TubY forms a tetrameric parallel four-helix bundle that differs from the typical MerR proteins. Moreover, we have analyzed the dynamics of TubZ filament using high-speed atomic force microscopy and found that TubZ filaments exhibit both treadmilling and dynamic instability.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

病原菌の毒素遺伝子の多くはプラスミドによって分配されることが知られる。本研究では炭疽症を引き起こす炭疽菌の近縁種セレウス菌の毒素プラスミドpXO1の分配に必須なTubZタンパク質とその制御因子について分子機構の解析を行った。TubZはプラスミド分配因子の中で最も最近に見つかったIII型の分配因子であり、その分子機構は明らかになっていない。本研究によってバクテリアのもつ新しい細胞骨格因子の分子制御機構を明らかにするとともに、病原性細菌に対する創薬の分子基盤を構築することができた。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2023 2022 2021 2020

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] The C-terminal region of the plasmid partitioning protein TubY is a tetramer that can bind membranes and DNA2020

    • Author(s)
      Hayashi Ikuko
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 295 Issue: 51 Pages: 17770-17780

    • DOI

      10.1074/jbc.ra120.014705

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 毒素遺伝子分配を司るチューブリン様タンパク質 TubZ のトレッドミル運動2023

    • Author(s)
      林郁子、渋谷颯人、古寺哲幸
    • Organizer
      生体運動研究合同班会議
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] AFMイメージングにおける微小管マイナス端の標識2022

    • Author(s)
      渋谷颯人,樋口雄希,古寺哲幸,林郁子
    • Organizer
      生体運動研究合同班会議
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 植物由来の微小管マイナス端結合タンパク質Spiral2の微小管結合能の解析2021

    • Author(s)
      山井和音、樋口雄希、林郁子
    • Organizer
      日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 高速AFMにおける微小管の極性の判別法の確立2021

    • Author(s)
      渋谷颯人,樋口雄希,古寺哲幸,林郁子
    • Organizer
      日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 微小管末端標識と高速AFMによる可視化2021

    • Author(s)
      樋口雄希、古寺哲幸、林郁子
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] III型プラスミド分配因子TubYは膜結合能をもつ2020

    • Author(s)
      林 郁子
    • Organizer
      日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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