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Functional analysis and application of sulfoglycosidase from mucin-assimilating bacteria

Research Project

Project/Area Number 19K05789
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Katoh Toshihiko  京都大学, 生命科学研究科, 助教 (40724612)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 伏信 進矢  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 教授 (00302589)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2020: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywordsムチン / Bifidobacterium bifidum / 糖鎖 / スルフォグリコシダーゼ / グライコミクス / CBM / GH20 / O-glycan / 腸内細菌 / BbhII / GH / Bfidobacterium bifidum / ビフィズス菌 / sulfoglycosidase / Bifidobacterium / sulfated glycan
Outline of Research at the Start

腸内細菌とヒトの健康との関連はすでに広く知られるところである。腸内細菌は食物由来食物繊維や宿主から分泌されるムチン分子からエネルギーを得るとともに、様々な二次代謝物を産生し宿主の免疫や代謝に影響を及ぼす。本研究は、腸内細菌がムチン分子を分解する際の、スルフォグリコシダーゼを介した新規のメカニズムについて明らかにするとともに、その酵素を改変して有効に利用しようとするものである。

Outline of Final Research Achievements

Degradation of host glycoproteins by human intestinal bacteria is closely related to the formation and maintenance of flora and production of beneficial metabolites, as well as to mucosal homeostasis and disease. In this study, we investigated the mechanism of sulfated mucin glycan degradation by Bifidobacterium bifidum, using the membrane-bound extracellular sulfoglycosidase BbhII as an example, through structural biology, enzymatic biochemical analyses, and omics analyses. In particular, we succeeded in demonstrating that this bacterium has a carbohydrate-binding module-dependent mucin degradation mechanism.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は、腸内細菌によるムチン分解の詳細なメカニズムを明らかにしたものである。ムチンの硫酸化は潤滑物質としての効果の他にも、粘膜・粘液バリア機能に寄与することが知られている。従ってムチン分解の亢進は上皮と腸内細菌の直接接触する機会を増してしまうことから慢性的な炎症(炎症性腸疾患)につながると考えられている。本研究から得られた糖質分解酵素に関連する様々な基盤的知見は、過剰なムチン分解を抑制するような炎症性腸疾患の治療法の開発においても有益な情報となると期待される。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (25 results)

All 2022 2021 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (19 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 8 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] The University of Western Australia/School of Molecular Sciences(オーストラリア)

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  • [Int'l Joint Research] Wageningen University/Lab. of Systems and Synthetic Biology(オランダ)

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  • [Journal Article] Diversification of a Fucosyllactose Transporter within the Genus Bifidobacterium2022

    • Author(s)
      Ojima Miriam N.、Asao Yuya、Nakajima Aruto、Katoh Toshihiko、Kitaoka Motomitsu、Gotoh Aina、Hirose Junko、Urashima Tadasu、Fukiya Satoru、Yokota Atsushi、Abou Hachem Maher、Sakanaka Mikiyasu、Katayama Takane
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology

      Volume: 88 Issue: 2

    • DOI

      10.1128/aem.01437-21

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    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Innovative Preparation of Biopharmaceuticals Using Transglycosylation Activity of Microbial Endoglycosidases2021

    • Author(s)
      Katoh Toshihiko、Yamamoto Kenji
    • Journal Title

      Journal of Applied Glycoscience

      Volume: 68 Issue: 1 Pages: 1-9

    • DOI

      10.5458/jag.jag.JAG-2020_0013

    • NAID

      130007996786

    • ISSN
      1344-7882, 1880-7291
    • Year and Date
      2021-03-11
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Enzymatic Adaptation of Bifidobacterium bifidum to Host Glycans, Viewed from Glycoside Hydrolyases and Carbohydrate-Binding Modules2020

    • Author(s)
      Katoh Toshihiko、Ojima Miriam N.、Sakanaka Mikiyasu、Ashida Hisashi、Gotoh Aina、Katayama Takane
    • Journal Title

      Microorganisms

      Volume: 8 Issue: 4 Pages: 481-481

    • DOI

      10.3390/microorganisms8040481

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 酵素特性から視る腸内細菌によるムチン糖鎖分解の異なる2様式2022

    • Author(s)
      加藤 紀彦
    • Organizer
      日本農芸化学会2022年大会
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    • Invited
  • [Presentation] 環境中の希少種の検出を可能とする16Sメタゲノム-DRIP法2022

    • Author(s)
      中島 有登、後藤 愛那、加藤 紀彦、尾島 望美、阪中 幹祥、吉田 圭佑、小田巻 俊孝、片山 高嶺
    • Organizer
      日本農芸化学会2022年大会
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  • [Presentation] Carbohydrate-binding module-dependent mucin degradation by Bifidobacterium bifidum2021

    • Author(s)
      Toshihiko Katoh, Moe Arai, Aina Gotoh, Chihaya Yamada, Takako Maeshibu, Ayako Yoshida, Makoto Nishiyama, Shinya Fushinobu, and, Takane Katayama
    • Organizer
      ACLAB11-The 11th Asian Conference on Lactic Acid Bacteria
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ムチンコア構造に作用するBifidobacterium bifidum由来β-N-acetylglucosaminidase2021

    • Author(s)
      高田紘翠、加藤紀彦、阪中幹祥、片山高嶺
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
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  • [Presentation] 新規H抗原認識ドメインを有するビフィズス菌1,2-α-L-fucosidaseを介したムチン糖鎖クロスフィーディング2021

    • Author(s)
      堀田 真、 加藤 紀彦、 丹沢 充裕、桑場 潮音、 後藤 愛那、Miriam N. Ojima、村上 隆太、吉田 圭佑、小田巻 俊孝、片山 高嶺
    • Organizer
      日本応用糖質科学会第47回近畿支部会
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  • [Presentation] ムチン糖鎖の構造的・機能的多様性の解析と微生物酵素の応用による糖鎖合成研究2021

    • Author(s)
      加藤紀彦
    • Organizer
      日本応用糖質科学会第47回近畿支部会
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      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] B. bifidumの2種のβ-N-acetylglucosaminidaseは協調的にムチンコア構造を分解する2021

    • Author(s)
      高田紘翠、加藤紀彦、阪中幹祥、片山高嶺
    • Organizer
      第40回 日本糖質学会年会
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  • [Presentation] セマンティックウェブ技術を用いた微生物糖鎖関連データベース「MicroGlycoDB」の開発2021

    • Author(s)
      Miyuki Kikuchi, Kazuhiro Aoki, Christine Szymanski, Yann Guerardel, Louis-David Leclercq, Tamara Doering, Thomas Hurtaux, Kiyotaka Fujita, Takane Katayama, Toshihiko Katoh and Kiyoko Aoki-Kinoshita
    • Organizer
      IIBMP2021
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  • [Presentation] 腸内細菌によるムチン分解機構2021

    • Author(s)
      加藤 紀彦
    • Organizer
      第62回 日本生化学会 中国・四国支部例会 シンポジウム:「糖鎖生物学のフロンティア」
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    • Invited
  • [Presentation] ムチン糖鎖の構造的・機能的多様性の解析と微生物酵素の応用による糖鎖合成研究2021

    • Author(s)
      加藤紀彦
    • Organizer
      日本応用糖質科学会2021年度大会
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      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ウェルシュ菌Clostridium perfringens が持つ1,2-α-L-フコシダーゼの機能解析2021

    • Author(s)
      中島有登、加藤紀彦、片山高嶺
    • Organizer
      第21回関西グライコサイエンスフォーラム
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      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Bifidobacterium bifidumのマウス経口投与による糞便中ムチン糖鎖の分解2021

    • Author(s)
      加藤紀彦、後藤愛那、荒井萌、片山高嶺
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Bifidobacterium bifidumによるムチン糖鎖分解と硫酸化糖の代謝2021

    • Author(s)
      加藤紀彦
    • Organizer
      ビフィズス菌研究会設立記念第1回シンポジウム
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      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] ムチン分解性ビフィズス菌由来スルフォグリコシダーゼの構造・機能解析2020

    • Author(s)
      加藤紀彦、荒井萌、山田千早、前渋貴子、吉田彩子、後藤愛那、西山真、伏信進矢、片山高嶺
    • Organizer
      第39回日本糖質学会年会(誌上開催)
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Bifidobacterium bifidum由来スルフォグリコシダーゼBbhIIの構造・機能解析2020

    • Author(s)
      荒井萌、加藤紀彦、前渋貴子、山田千早、吉田彩子、西山真、伏信進矢、片山高嶺
    • Organizer
      日本応用糖質科学会第46回近畿支部会
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Bifidobacterium bifidum由来スルフォグリコシダーゼBbhIIの糖鎖結合ドメインの機能解析2019

    • Author(s)
      荒井 萌、加藤 紀彦、山田 千早、 前渋 貴子、 吉田 彩子、西山 真、 伏信 進矢、 片山 高嶺
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
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  • [Presentation] ビフィズスフローラ形成に関与するオリゴ糖分解酵素群2019

    • Author(s)
      加藤紀彦
    • Organizer
      京都バイオ計測センター研究交流会
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    • Invited
  • [Presentation] 宿主由来オリゴ糖利用によるビフィズス菌叢形成メカニズム2019

    • Author(s)
      加藤紀彦
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会
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    • Invited
  • [Presentation] ビフィズス菌のオリゴ糖資化・代謝メカニズム2019

    • Author(s)
      加藤紀彦
    • Organizer
      おかやまバイオアクティブ研究会第55回シンポジウム
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    • Invited
  • [Remarks] 京都大学大学院生命科学研究科 分子応答機構学分野 片山グループ

    • URL

      https://www.bunshioutou.lif.kyoto-u.ac.jp/katayama/Publications.html

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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