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α-ヒドロキシ酸を利用した微生物による有用ペプチド生産系の開発

Research Project

Project/Area Number 19K05821
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38030:Applied biochemistry-related
Research InstitutionWaseda University (2023)
Institute of Physical and Chemical Research (2019-2022)

Principal Investigator

大竹 和正  早稲田大学, 理工学術院, 助教 (80593631)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords応用生物化学 / タンパク質工学 / バイオテクノロジー / 微生物工学 / 非天然型アミノ酸 / 人工アミノ酸 / 拡張遺伝暗号
Outline of Research at the Start

申請者らはタンパク質工学と改変型微生物の融合により、微生物生体内で非天然型アミノ酸導入タンパク質を高効率で生産することを可能としている。
本課題ではこの手法を拡張し、微生物と非天然型アミノ酸誘導体を利用した有用ペプチドの高効率な生産系の確立を第一の目標とする。また、簡便で低コストな生産系を実現するため、微生物自身が非天然型アミノ酸誘導体を産生できるように改変することを第二の目標とする。

Outline of Annual Research Achievements

申請者らはタンパク質工学と改変型微生物の融合により、微生物生体内で非天然型アミノ酸導入タンパク質を高効率で生産することを可能としてきた。
本課題ではこの手法を拡張し、微生物と非天然型アミノ酸誘導体を利用した有用ペプチドの高効率な生産系の確立を第一の目標とする。また、簡便で低コストな生産系を実現するため、微生物自身が非天然型アミノ酸誘導体を産生できるように改変することを第二の目標とする。
本研究課題では、申請者らが保持するα-ヒドロキシ酸(AHA)特異的改変型酵素や大腸菌コドン再定義株などのタンパク質工学、合成生物学的な知見や技術に代謝工学的観点からのアプローチを取り入れることにより、安価な化合物から細胞内のマシーナリーを用いて有用ペプチドを効率的に生産する系を開発することを目的とする。第一段階として非天然型の側鎖をもつAHAであるAlocLysOHと組換えタンパク質発現・精製手法を利用し通常は細菌で生産することが困難な抗菌性ペプチドの生産系の構築を目指している。大腸菌コドン再定義株を用いたAlocLysOHの導入法については確立している。具体的な抗菌ペプチドのターゲットを選定
し、発現コンストラクトについても複数のパターンを設定して検討を行った。ペプチド-キャリアタンパク質の融合体を封入体として発現し、可溶化、塩基性条件下での切断、ニッケルカラムによるキャリアタンパク質除去を行い精製ペプチドを得る手法について一定の目処がついた。修飾ペプチドを含む他種のペプチドにも応用すべく展開を検討中である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

COVID-19の影響及び研究代表者の研究箇所の移転により研究計画に遅れが出ている。
また、当初の研究計画のうちAHA導入酵素の改変並びにペプチド発現コンストラクトについては当初想定していた計画の変更を余儀なくされたため遅延に繋がっている。

Strategy for Future Research Activity

大腸菌とAlocLysOHを用いたペプチド生産系を確立し、修飾ペプチドも含め生産できるペプチド種を増やしていきたい。
AHA導入酵素の改変についても異なるアプローチにより実現可能性を引き続き模索する。

Report

(5 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2024 2023 2022 2021 2019

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 5 results) Presentation (3 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Correlation between in vitro and in vivo gene-expression strengths is dependent on bottleneck process2024

    • Author(s)
      Toshihiko Enomoto, Kazumasa Ohtake, Naoko Senda, and Daisuke Kiga
    • Journal Title

      New Generation Computing

      Volume: -

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Site‐specific photo‐crosslinking/cleavage for protein?protein interface identification reveals oligomeric assembly of lysosomal‐associated membrane protein type 2A in mammalian cells2023

    • Author(s)
      Terasawa Kazue、Seike Tatsuro、Sakamoto Kensaku、Ohtake Kazumasa、Terada Tohru、Iwata Takanori、Watabe Tetsuro、Yokoyama Shigeyuki、Hara‐Yokoyama Miki
    • Journal Title

      Protein Science

      Volume: 32 Issue: 12

    • DOI

      10.1002/pro.4823

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The two domain architecture of LAMP2A regulates its interaction with Hsc702022

    • Author(s)
      Yuta Ikami, Kazue Terasawa, Kensaku Sakamoto, Kazumasa Ohtake, Hiroyuki Harada Tetsuro Watabe, Shigeyuki Yokoyama, Miki Hara-Yokoyam
    • Journal Title

      Experimental Cell Research

      Volume: 411 Issue: 1 Pages: 112986-112986

    • DOI

      10.1016/j.yexcr.2021.112986

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] An expanded genetic code facilitates antibody chemical conjugation involving the lambda light chain2021

    • Author(s)
      Kato Akifumi、Ohtake Kazumasa、Tanaka Yoshitaka、Yokoyama Shigeyuki、Sakamoto Kensaku、Shiraishi Yasuhisa
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 546 Pages: 35-39

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.02.005

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Direct homophilic interaction of LAMP2A with the two-domain architecture revealed by site-directed photo-crosslinks and steric hindrances in mammalian cells2021

    • Author(s)
      Terasawa Kazue、Kato Yuji、Ikami Yuta、Sakamoto Kensaku、Ohtake Kazumasa、Kusano Seisuke、Tomabechi Yuri、Kukimoto-Niino Mutsuko、Shirouzu Mikako、Guan Jun-Lin、Kobayashi Toshihide、Iwata Takanori、Watabe Tetsuro、Yokoyama Shigeyuki、Hara-Yokoyama Miki
    • Journal Title

      Autophagy

      Volume: 17 Issue: 12 Pages: 1-19

    • DOI

      10.1080/15548627.2021.1911017

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Variants of the industrially relevant protease KP-43 with suppressed activity under alkaline conditions developed using expanded genetic codes2019

    • Author(s)
      Osamura Tatsuya、Okuda Mitsuyoshi、Yamaguchi Atsushi、Ohtake Kazumasa、Sakamoto Kensaku、Takimura Yasushi
    • Journal Title

      Biochemistry and Biophysics Reports

      Volume: 17 Pages: 93-96

    • DOI

      10.1016/j.bbrep.2018.12.001

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 非アミノ酸をコード化した遺伝暗号の下での大腸菌進化2023

    • Author(s)
      坂本健作、大竹和正、芝井厚、古澤力
    • Organizer
      第45 回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 新型コロナウイルス変異株に対応する次世代型ACE2-Fc 製剤の開発2023

    • Author(s)
      高田理彩、尾上遥南、鈴木喬 介、石本憲司、大竹和正、坂本健作、吉岡靖雄、中川晋作、樋野展正
    • Organizer
      第45 回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 非アミノ酸を含む遺伝暗号の開発と大腸菌進化への影響2022

    • Author(s)
      大竹和正
    • Organizer
      第16回無細胞生命科学研究会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] タンパク質における別のタンパク質と相互作用する部分の特定方法2023

    • Inventor(s)
      横山三紀、寺澤和恵、横山茂之、坂本健作、大竹和正
    • Industrial Property Rights Holder
      横山三紀、寺澤和恵、横山茂之、坂本健作、大竹和正
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2023-098438
    • Filing Date
      2023
    • Related Report
      2023 Research-status Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2024-12-25  

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