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Analysis of yeast TRPY1 channel which convert physical stimulations into biochemical signals.

Research Project

Project/Area Number 19K05823
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38030:Applied biochemistry-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Hamamoto Shin  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特任助教 (10533812)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywordsイオン輸送 / チャネル / オルガネラ / 出芽酵母 / 液胞 / イオンチャネル / Ca2+ / 浸透圧 / 高浸透圧 / 高浸透圧ストレス応答 / TRPチャネル / 電気生理学
Outline of Research at the Start

高浸透圧ストレスにさらされた出芽酵母は、液胞膜局在性陽イオンチャネルTRPY1を介して液胞内のCa2+を細胞質に放出してストレスに応答している。しかし、TRPY1チャネルへの高浸透圧ストレスのシグナル伝達機構の詳細は不明である。本研究では、①出芽酵母の巨大化法と細胞内小器官パッチクランプ法を併用して出芽酵母TRPY1の高浸透圧応答機構の解明をめざす。さらに、②酵母液胞膜を発現系としたオルガネラ膜局在性イオンチャネルの機能解析系を構築する。この成果は、真核生物に広く保存されている高浸透圧ストレス・物理的刺激をイオンチャネルによって化学シグナルに変換する環境適応機構の解明につながる。

Outline of Final Research Achievements

Saccharomyces cerevisiae possesses a transient receptor potential (TRP) channel homolog TRPY1 in its vacuolar membrane. So far, studies have focused on the channel properties of TRPY1, but its regulation and physiological role remained to be elucidated. TRPY1 can be activated by hyperosmotic shock in vivo and release Ca2+ from the vacuole into the cytolplasm, which can be measured by expressing aequorin in cytoplasm. To gain further observation of TRPY1 at a molecular level, we screened the collection of yeast single gene deletants for alterations in hyperosmotic response in an attempt to find factor that regulates the activity of TRPY1. We have identified several deletion mutant strains which shows decreased response against to hyperosmotic condition. Some of the deleted gene encoded organelle membrane protein and suggested a novel mechanism to activate TRPY1.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究における成果は、他の生体膜と比較して研究が遅れているオルガネラ膜に局在性を示すイオンチャネルの活性制御機構の一端を明らかにしたことである。出芽酵母は、発酵生産環境では高浸透圧ストレスに晒されているため、高浸透圧ストレスで活性化するTRPY1の研究で得られた知見の出芽酵母の発酵生産環境への応用が期待される。さらに、TRPY1と類似のイオンチャネルは広く高等生物に保存されており、多くの疾病をも関わっていることが知られているため、これらの疾病の原因解明へのが期待される。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Current Methods to Unravel the Functional Properties of Lysosomal Ion Channels and Transporters.2022

    • Author(s)
      Margherita Festa, Velia Minicozzi, Anna Boccaccio, Laura Lagostena, Antonella Gradogna, Tianwen Qi, Alex Costa, Nina Larisch, Shin Hamamoto, Emanuela Pedrazzini, Stefan Milenkovic, Joachim Scholz-Starke, Matteo Ceccarelli, Alessandro Vitale, Petra Dietrich, Nobuyuki Uozumi, Franco Gambale, Armando Carpaneto
    • Journal Title

      Cells.

      Volume: 6 Issue: 6 Pages: 921-921

    • DOI

      10.3390/cells11060921

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Loss of cell wall integrity genes cpxA and mrcB causes flocculation in Escherichia coli2021

    • Author(s)
      Sugawara Keita、Toyoda Hayato、Kimura Mami、Hayasaka Shunsuke、Saito Hiromi、Kobayashi Hiroshi、Ihara Kunio、Ida Tomoaki、Akaike Takaaki、Ando Eiji、Hyodo Mamoru、Hayakawa Yoshihiro、Hamamoto Shin、Uozumi Nobuyuki
    • Journal Title

      Biochemical Journal

      Volume: 478 Issue: 1 Pages: 41-59

    • DOI

      10.1042/bcj20200723

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Evidence for potassium transport activity of Arabidopsis KEA1-KEA6.2019

    • Author(s)
      Masaru Tsujii, Kota Kera, Shin Hamamoto, Takashi Kuromori, Toshiharu Shikanai, Nobuyuki Uozumi
    • Journal Title

      Scientific Report

      Volume: 9 (1), 10040 Issue: 1 Pages: 10040-10040

    • DOI

      10.1038/s41598-019-46463-7

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The mechanosensitive channel YbdG from Escherichia coli has a role in adaptation to osmotic up-shock.2019

    • Author(s)
      Shun Amemiya, Hayato Toyoda, Mami Kimura, Hiromi Saito, Hiroshi Kobayashi, Kunio Ihara 3 , Kiyoto Kamagata 4 , Ryuji Kawabata 5 , Setsu Kato, Yutaka Nakashimada, Tadaomi Furuta, Shin Hamamoto, Nobuyuki Uozumi
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 294 (33) Issue: 33 Pages: 12281-12292

    • DOI

      10.1074/jbc.ra118.007340

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ER 局在性陽イオン輸送体 Spo75 の欠損は酸化還元状態の乱れを引き起こす2020

    • Author(s)
      上原千央,柴田あすか,浜本晋,辻井雅,石丸泰寛,笠原紳,魚住信之
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム 第53回研究報告会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 酵母の 4 種類の Ca2+ 輸送体の生理的役割2019

    • Author(s)
      上原千央,柴田あすか,浜本 晋,笠原 紳,吉見 啓,阿部敬悦,高木智子,永田典子,魚住信之
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム 第52回研究報告会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 出芽酵母の Ca2+ 輸送体 酵母 OSCAs によるストレス応答への寄与2019

    • Author(s)
      上原千央,柴田あすか,浜本晋,笠原紳,魚住信之
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム 第52回研究報告会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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