• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Establishment of the method fine-tuning response to environmental stress through chemical and genetic manipulation of HDAC activity

Research Project

Project/Area Number 19K05960
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38060:Applied molecular and cellular biology-related
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

Ueda Minoru  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 研究員 (30632541)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 工藤 紀雄  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 上級研究員 (80632421)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Keywordsヒストンアセチル化修飾 / ヒストン脱アセチル化酵素 / HDAC阻害剤 / シロイヌナズナ / 環境ストレス応答 / 環境ストレス耐性強化 / アセチル化修飾 / 環境ストレス耐性強 / ヒストン脱アセチル化酵 / HDA19 / 稔性回復 / ケミカルスクリーニング / 環境ストレス耐性 / ケミカルデザイン / 人工合成HDAC
Outline of Research at the Start

結晶構造解析やケミカルスクリーニングにより新規に開発した化合物の利用や、人工的に改変したHDACをコードする遺伝子を利用することで、植物が環境ストレス耐性を保持しつつ、稔性を維持できる手法の開発を目指す。

Outline of Final Research Achievements

Histone proteins act to package DNA encoding genetic information of living organisms, which wraps around the eight core histones. N-terminus of histone proteins are subjected to a variety of chemical modifications such as acetylation and methylation. These chemical modifications play a pivotal role in response to environmental stresses in plants. Representative researcher has already revealed that the inhibition of HDA19 (an isoform in histone deacetylase gene family) increased tolerance to abiotic stress in Arabidopsis. In this study, the alteration of genomic primary structure of HDA19 increased tolerance to salinity stress with fertility. Establishment of in vivo and in vitro systems measuring inhibitory effect of chemical compounds on HDA19 or class I HDAC activity enables to find novel compounds for the manipulation of response to abiotic stress in plants.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

化合物処理という一過的な活性調節は、不稔などの農業上の不良形質の顕出を抑制する効果が期待できる。本研究で確立したin vivoやin vitroでのアッセイ系を利用することで、新規の化合物探索が可能となった、今後はよりオフターゲットの少ない、植物HDACにのみ作用する化合物の探索を進め、より緻密なストレス耐性操作方法の確立が期待できる。また、本研究期間内に国際共同研究も展開できており、HDA19が非ヒストンタンパク質の脱アセチル化修飾にも関与することが示唆されている。更なる解析を進めることで、新規のストレス耐性付与機構の同定が期待できる。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2022 2021 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] ミュンスター大学(ドイツ)

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] ミュンスター大学(ドイツ)

    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Journal Article] Sustained defense response via volatile signaling and its epigenetic transcriptional regulation2022

    • Author(s)
      Onosato, Haruki; Fujimoto, Genya; Higami, Tomota; Sakamoto, Takuya; Yamada, Ayaka; Suzuki, Takamasa; Ozawa, Rika; Matsunaga, Sachihiro; Seki, Motoaki; Ueda, Minoru; Sako, Kaori; Galis, Ivan; Arimura, Gen-ichiro
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: - Issue: 2 Pages: 922-933

    • DOI

      10.1093/plphys/kiac077

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Histone modifications form epigenetic regulatory networks to regulate abiotic stress response2020

    • Author(s)
      Ueda, M. and Seki, M.
    • Journal Title

      Plant Physiol.

      Volume: 182 Issue: 1 Pages: 15-26

    • DOI

      10.1104/pp.19.00988

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Transcriptome analysis of the hierarchical response of HDAC proteins that respond in an antagonistic manner to salinity stress.2019

    • Author(s)
      Ueda, M., Matsui, A., Watanabe, S., Kobayashi, M., Saito, K., Tanaka, M., Ishida, J., Kusano, M., Seo, M. and Seki, M.
    • Journal Title

      Front. Plant Sci.

      Volume: 10 Pages: 1323-1323

    • DOI

      10.3389/fpls.2019.01323

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] HDAC阻害剤のシロイヌナズナHDACに対する選択性評価と可視化2022

    • Author(s)
      上田 実、工藤 紀雄、松井 章浩、中田 明子、田中 真帆、高橋 聡史、石田 順子、佐々木 卓、吉田 稔、関 原明
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Transcriptome characterization of salinity stress response coordinated by histone deacetylase proteins that respond in an antagonistic manner2021

    • Author(s)
      上田 実、松井 章浩、渡邊 俊介、小林 誠、 斉藤 和季、 田中 真帆、石田 順子、草野 都、瀬尾 光範、関 原明
    • Organizer
      31st International Conference on Arabidopsis Research
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 相反する塩ストレス応答を担うヒストン脱アセチル化酵素群による階層的制御の解明に向けたトランスクリプトーム解析2021

    • Author(s)
      上田 実、松井 章浩、渡邊 俊介、小林 誠、 斉藤 和季、 田中 真帆、石田 順子、草野 都、瀬尾 光範、関 原明
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2023-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi