Modernized reconstruction of U's triangle of Brassica crops
| Project/Area Number |
19K05979
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 39010:Science in plant genetics and breeding-related
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| Research Institution | Kyoto Sangyo University |
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Principal Investigator |
Yamagishi Hiroshi 京都産業大学, 総合学術研究所, 科研費研究員 (10210345)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
寺地 徹 京都産業大学, 生命科学部, 教授 (90202192)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2021)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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| Keywords | 作物進化 / Uの三角形 / Brassica属作物 / ミトコンドリアゲノム / 種内変異 / 複２倍体 / Brassica属 / 複2倍体種 / ２倍体種 / Ｕの三角形 / 複2倍体 |
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| Outline of Research at the Start |
本研究では、次世代シークエンサー等、近年急速に発展したゲノム解析の手法を用いて、１つの研究拠点における統一的な方法によって、Brassica属の６種作物ならびに野生植物のミトコンドリアゲノム全塩基配列を明らかにすることにより、それぞれの植物のミトコンドリアゲノムの種内変異とそれらの種間関係を解明する。その結果に基づき、２倍体栽培種３種の栽培化の過程および複２倍体種の成立過程を明らかにする。この結果は、Brassica属作物の進化過程を明解に説明するものとなる。
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| Outline of Final Research Achievements |
Six crop species belonging to genus Brassica contribute as important food crops worldwide. In this project, we analyzed the mitochondrial genome of the 6 crop species and found the intraspecific variations. Based on the results, the process of domestication of the three diploid species and establishment of the three amphidiploid species were clarified. All the three diploids contained two or more mitotypes, the facts indicating that they were domesticated twice or more. Whereas, two of the three amphidiploid species possessed the two mitotypes identical to those of diploid mother species. Thus, the two species were estimated to be established at least twice. These findings enabled us to reconstruct the U’s triangle of Brassica crops with detailed structure.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
栽培植物の起源と進化を示す代表的な例である Brassica 属作物の種間関係が、種内変異にまで踏み込んで詳しく明らかにされた。この成果は他の多くの植物種に応用され、今後の植物遺伝学、育種学の新しい発展に貢献する。また、本研究で見出されたミトコンドリアゲノムの種内変異は、将来の植物育種において、オルガネラゲノム内の未利用遺伝子を持つ植物を育種素材として活用する可能性を拓く。
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Report
(4 results)
Research Products
(30 results)
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[Journal Article] Mitochondrial orf463 causing male sterility in radish is possessed by cultivars belonging to the ‘Niger’group.2019
Author(s)
Yamagishi, H., Tanaka, Y., Shiiba, S., Hashimoto, A., Fukunaga, A., Terachi, T.
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Journal Title
Euphytica
Volume: 215
Issue: 6
Pages: 109-116
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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