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Analysis of starch biosynthesis with a novel rice dull mutant

Research Project

Project/Area Number 19K05989
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 39020:Crop production science-related
Research InstitutionHirosaki University

Principal Investigator

Hnamada Shigeki  弘前大学, 農学生命科学部, 准教授 (90418608)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Keywordsイネ / デンプン / 低アミロース / 突然変異 / アミロース / デンプン生合成
Outline of Research at the Start

米の胚乳デンプンのアミロース含量は、炊飯米の食味の良否はもちろんのこと、米加工食品の加工適性においても重要な形質である。申請者は自ら作製した突然変異米ライブラリーから、新たな特徴を持つ低アミロース米の選抜に成功した。本申請課題では、新奇な付加価値が期待される低アミロース選抜系統について、アミロース・アミロペクチンの分子量やグルカン鎖の解析などデンプンの特徴的な構造について明らかにするとともに、原因遺伝子の同定および機能を解析する。さらに、デンプン生合成関連遺伝子群の発現解析から形質発現の機序を解明する。得られた成果は、デンプン生合成メカニズムの解明と新規形質米育成の基盤となる。

Outline of Final Research Achievements

A new dull grain rice mutant with low amylose content, designated lowac1, has been isolated and characterized. Genotypes using the CAPS marker of the identified LowAC1 gene encoding an RNA recognition motif (RRM) protein were entirely consistent with low amylose phenotypes in BC1F2 progeny. lowac1 involves a single-nucleotide polymorphism from G to A within the gene, resulting in the stop codon generation. The RRM protein deletion in the mutant seed specifically affected the splicing efficiency of Waxyb (Wxb) in the 5′ splice site of intron 1, resulting in decreased protein levels of granule-bound starch synthase I (GBSSI) encoded by Wxb. Also, the mutation induced a little variation in the expression levels of some genes involved in starch biosynthesis. Aside from low amylose content, lowac1 seeds included an amylopectin structure reducing short chains compared to that of WT seeds. Overall, our data suggest that LowAC1 is a novel regulatory factor for starch synthesis in rice.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

食料自給率向上や安定的な食料生産の観点から、米の新規用途開発のために多様な形質をもった品種開発が望まれる。米の胚乳デンプンのアミロース含量は、炊飯米の食味の良否はもちろんのこと、米加工食品の加工適性においても重要な形質であることから、新たな付加価値が期待される低アミロース選抜系統について、原因遺伝子の同定および形質発現の機序を解明した。得られた成果は、デンプン生合成メカニズムの解明と新規形質米育成の基盤となる。さらには、加工適性や利用方法が見出されれば、米の新たな需要が開拓され農業や食品業界の活性化にも繋がり、次世代の食の多様性をもたらす農資源の開発に大きく貢献する。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (9 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] A novel rice dull gene, LowAC1, encodes an RNA recognition motif protein affecting Waxyb pre-mRNA splicing.2021

    • Author(s)
      Igarashi H., Ito H., Shimada T., Kang DJ., Hamada, S
    • Journal Title

      Plant Physiology and Biochemistry

      Volume: 162 Pages: 100-109

    • DOI

      10.1016/j.plaphy.2021.02.035

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biochemical analysis of a new sugary-type rice mutant, Hemisugary1, carrying a novel allele of the sugary-1 gene.2020

    • Author(s)
      Takahashi S., Kumagai Y., Igarashi, H., Horimai K., Ito H., Shimada T., Kato Y., Hamada S.
    • Journal Title

      Planta

      Volume: 251(1) Issue: 1 Pages: 29-29

    • DOI

      10.1007/s00425-019-03321-0

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 新たな簡易選抜法を用いた糖質米の向上2019

    • Author(s)
      濱田茂樹
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 57(9) Pages: 520-521

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 粉質米突然変異系統 FloTR1 の原因遺伝子同定および SNP の影響2021

    • Author(s)
      室山龍児,伊藤浩之,姜東鎮,濱田茂樹
    • Organizer
      日本育種学会第140回講演会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] イネ胚乳由来 D-cysteine desulfhydraseの同定および酵素学的諸性質の解析2021

    • Author(s)
      山澤 涼介、八嶋良樹、伊藤浩之、濱田 茂樹
    • Organizer
      日本農芸化学会東北支部第156回大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 外観品質の向上した新規糖質米の選抜および原因遺伝子の解明2021

    • Author(s)
      坂本和也、高橋すみれ、熊谷裕、五十嵐秀成、伊藤浩之、島田透、 濱田茂樹
    • Organizer
      日本農芸化学会東北支部第156回大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 米の低アミロース性を制御する新規遺伝子 LowAC1 の同定および機能解析2021

    • Author(s)
      五十嵐秀成,伊藤浩之,島田透,姜東鎮,濱田茂樹
    • Organizer
      日本育種学会第139回講演会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] ノングルテン米粉を使用した食品開発~グルテンフリー米粉パンの品質向上に向けた取り組み~2021

    • Author(s)
      濱田茂樹
    • Organizer
      第21回食物アレルギー研究会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 新規低アミロース米系統 Lowamy-1 の澱粉特性および遺伝子発現解析2019

    • Author(s)
      五十嵐秀成,伊藤浩之,濱田 茂樹
    • Organizer
      日本応用糖質科学会東北支部第11回大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] グルテンフリー米粉パンの膨らみを向上させる方法とメカニズムの解明2019

    • Author(s)
      南雲菜穂,濱田茂樹
    • Organizer
      日本応用糖質科学会東北支部第11回大会(秋田大)
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      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 米糠由来の新規フェルラ酸エステラーゼの精製及び同定2019

    • Author(s)
      柏木貴裕,濱田茂樹
    • Organizer
      日本農芸化学会東北支部第154回大会
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      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 青森県酒造好適米品種「華さやか」を用いた製パン適性の解明2019

    • Author(s)
      望月政利,山口知美,若本由加里,神田伸一郎,上村豊和,梶田啓,前田一春,濱田茂樹
    • Organizer
      日本農芸化学会東北支部第154回大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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