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Culture collection of terrestrial cyanobacteria related to black stains on Okinawa buildings

Research Project

Project/Area Number 19K06090
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 39060:Conservation of biological resources-related
Research InstitutionUniversity of the Ryukyus

Principal Investigator

Suda Shoichiro  琉球大学, 理学部, 教授 (00359986)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywordsシアノバクテリア / ラン藻 / 気生 / カルチャーコレクション / 分子系統解析 / 未記載分類群 / 分類 / 16S rRNA / 16S-23S ITS / 形態 / 系統分類
Outline of Research at the Start

沖縄の琉球石灰岩製の石垣や石積みの黒い着色の主な原因は気生シアノバクテリアの生育であることが知られているが,どの様な種類が,どの様な生育過程を経て黒い着色に至っているのかに関する情報はほとんどなく,世界的にも情報は少ない。本研究は,琉球大学構内から確立した気生シアノバクテリア株をもとに新たな株の採集・分離も行い,分子系統解析(特に16S rRNA遺伝子塩基配列に基づく)と詳細な形態観察(光学・電子顕微鏡観察)による多相分類法により分類し,正確で利用可能な分類・培養情報を付与した,気生シアノバクテリア株コレクションを確立する。

Outline of Final Research Achievements

Terrestrial cyanobacteria grew very slowly, were difficult to purify , and took time to eliminate contaminating fungi. It was revealed that the established strains are highly diverse, with the majority of taxa not described in molecular phylogenetically. Nostoc-like, Scytonema-like, and unicellular taxa are necessary to do taxonomic studies. Although the establishments of terrestrial cyanobacteria strains were successful. It is necessary to examine the secondary metabolites for them before deposition. So we postponed deposit the strains to the public culture collection.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

沖縄の建造物の黒い着色のもとは、気生シアノバクテリアの増殖で、分子遺伝学的に非常に多様で未記載分類群が含まれ、世界的にほとんど利用できる培養株がないことから学術的には分類学的な研究材料として、有効利用の点では紫外線吸収物質や生理活性物質などの有用物質の利用研究に用いることが可能となる培養保存株の確立に成功した。さらに、登録分子情報から、人類が火星で暮らすための研究を行っている米国研究グループからも連携依頼があるなど広がりを見せ、将来にも重要な研究となった。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Revealing the species diversity of Neolyngbya (Cyanobacteria, Oscillatoriales) from subtropical coastal regions of Okinawa, Japan, with descriptions of Neolyngbya intertidalis sp. nov. and Neolyngby latusa sp. nov.2022

    • Author(s)
      Handung Nuryadi, Shoichiro Suda
    • Journal Title

      Phycological Research

      Volume: 70 Issue: 2 Pages: 69-80

    • DOI

      10.1111/pre.12482

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] シアノバクテリア/ラン藻の分類の現状と今後2022

    • Author(s)
      須田彰一郎、Philipus Uli Basa Hutabarat, Nuryadi Handung, 上原洋志
    • Journal Title

      藻類

      Volume: 70 Pages: 13-23

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 琉球大学で確立されたVioletonostoc属に近縁な分離培養株について2022

    • Author(s)
      上原洋志、澄本慎平、須田彰一郎
    • Organizer
      日本藻類学会大46回大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Undescribed speices of Nodisilinea isolated from terrestrial habitat in University of the Ryukyus campus area, Okinawa2021

    • Author(s)
      Handung Nuryadi, Shipei Sumimoto, Shoichiro Suda
    • Organizer
      12th International Phycological Congress
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 琉球大学構内から分離培養された単細胞ラン藻 Ru3-11株について2020

    • Author(s)
      須田彰一郎、Hutabarat P.U.B., Nuryadi H., 澄本晋平
    • Organizer
      日本藻類学会第44回大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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