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Evaluation of bull fertility for bovine spermatozoa and embryos using differentially methylated CpG sites as biomarkers

Research Project

Project/Area Number 19K06362
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 42010:Animal production science-related
Research InstitutionNational Agriculture and Food Research Organization

Principal Investigator

Takeda Kumiko  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 畜産研究部門, 上級研究員 (60414695)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小林 栄治  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 畜産研究部門, グループ長 (00186727)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywordsウシ / 精子 / DNAメチル化 / 受胎性評価 / 受胎性 / 雄 / 人工授精 / 受胎率 / 全ゲノムバイサルファイトシークエンス / 牛 / メチル化
Outline of Research at the Start

精液性状検査による評価結果が良好でも受胎性の低いウシ精子が存在している。ウシでも精子核DNAのメチル化異常が不妊症や老化に関連する可能性がある。本研究では、次世代シークエンスを利用し受胎性の異なる精液のメチル化レベルの網羅的比較分析から受胎性評価の指標となり得るメチル化可変部位を選択することにより、精子核DNAメチル化可変部位を指標としたウシ凍結精液の受胎性予測法を開発する。

Outline of Final Research Achievements

Early detection of bulls with low conception rate after artificial insemination is an urgent issue. The purpose of this study was to find new biomarkers that predict bull fertility by the detection of differentially methylated regions (DMRs) where the methylation levels were related to sire conception rate (SCR). Frozen-thawed semen samples were collected from Japanese Black bulls with recorded SCR, and the DMRs were detected using methylation comprehensive analysis data. Then, for 10 DMRs that could be deployed to a simple detection system fertility-related methylation changes were confirmed by COBRA. Using the system, the methylation levels of frozen-thawed semen samples and in vitro fertilized embryos were clarified. Furthermore, it was concluded that the methylation levels of these 10 DMRs were useful as new biomarkers for predicting SCR.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

凍結精液を用いた牛の人工授精後の受胎率低下が世界的に問題となっている。雄側の問題として遺伝的評価は高くても受胎性が低い雄牛の存在が問題となっており、通常の精液検査で発見できない受胎性の低い精液を発見する新たな精液評価技術の開発が求められている。本研究成果は精子DNAメチル化率が黒毛和種雄牛の人工授精後の受胎性に関連するメチル化可変領域を抽出し、それらが雄牛の受胎性評価のバイオマーカーの一つとして有効であることを示した。早期に受胎性の担保された雄牛を選定することが可能になれば、種雄牛造成において大きな経済的損失が削減される他、雄側からの受胎率低下への対処が可能となる。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Differentially methylated CpG sites related to fertility in Japanese Black bull spermatozoa: epigenetic biomarker candidates to predict sire conception rate2021

    • Author(s)
      TAKEDA Kumiko、KOBAYASHI Eiji、OGATA Kazuko、IMAI Akira、SATO Shinya、ADACHI Hiromichi、HOSHINO Yoichiro、NISHINO Kagetomo、INOUE Masahiro、KANEDA Masahiro、WATANABE Shinya
    • Journal Title

      Journal of Reproduction and Development

      Volume: 67 Issue: 2 Pages: 99-107

    • DOI

      10.1262/jrd.2020-137

    • NAID

      130008028375

    • ISSN
      0916-8818, 1348-4400
    • Related Report
      2021 Annual Research Report 2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Age-related changes in DNA methylation levels at CpG sites in bull spermatozoa and <i>in vitro</i> fertilization-derived blastocyst-stage embryos revealed by combined bisulfite restriction analysis2019

    • Author(s)
      ①Kumiko Takeda, Eiji Kobayashi, Kagetomo Nishino, Akira Imai, Hiromichi Adachi, Yoichiro Hoshino, Satoshi Akagi, Masahiro Kaneda, Shinya Watanabe
    • Journal Title

      Journal of Reproduction and Development

      Volume: 65 Issue: 4 Pages: 305-312

    • DOI

      10.1262/jrd.2018-146

    • NAID

      130007689001

    • ISSN
      0916-8818, 1348-4400
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] ヒトメチル化アレイを用いたウシメチル化可変部位の網羅的解析2021

    • Author(s)
      小林栄治、緒方和子、武田久美子
    • Organizer
      第22回動物遺伝育種学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 精子核DNAメチル化可変領域を利用した黒毛和種凍結精液の人工授精後の受胎性予測の試み2021

    • Author(s)
      武田 久美子、緒方 和子、今井 昭、佐藤 伸哉、井上 真寛、木村 和輝、熊崎啓将、金田 正弘、小林栄治
    • Organizer
      第114回日本繁殖生物学会大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 黒毛和種雄牛の人工授精後の受胎性指標とする精子核DNAメチル化可変部位追加による評価精度の向上2020

    • Author(s)
      武田久美子、小林栄治、緒方和子、今井昭、佐藤伸哉、木村和輝、安達広通、井上真寛、金田正弘、渡邊伸也
    • Organizer
      第113回日本繁殖生物学会大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 受胎性と関連しうる精子核DNAメチル化可変部位の体外受精胚におけるメチル化状態2019

    • Author(s)
      武田 久美子、小林 栄治、西野 景知、星野 洋一郎、安達 広通、今井 昭、岩尾 健、緒方 和子、金田 正弘、渡邊 伸也
    • Organizer
      第112回日本繁殖生物学会大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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