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Molecular biological study on the virulence property of Campylobacter based on the infection biology

Research Project

Project/Area Number 19K06432
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 42020:Veterinary medical science-related
Research InstitutionNational Institute of Health Sciences

Principal Investigator

Asakura Hiroshi  国立医薬品食品衛生研究所, 食品衛生管理部, 部長 (40370936)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中村 寛海  地方独立行政法人 大阪健康安全基盤研究所, 微生物部, 主幹研究員 (00332445)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywordsカンピロバクター / 食中毒 / NGS解析 / ゲノム解析 / 細菌叢解析 / 腸内細菌叢 / 菌叢解析 / Campylobacter / 生体内挙動 / RNAseq / Microbiota
Outline of Research at the Start

本研究では,食品媒介性感染症として世界中で多発するカンピロバクターがヒト生体内での感染過程で顕す遺伝子発現及び腸内細菌叢の動態を発症患者由来検体を研究対象にプロファイル化し,疫学情報及び原因菌株のゲノム特性と融合を通じ,本菌感染に伴う病態発現の分子基盤に係る基礎知見の集積を図ることを目的としている。ヒト腸管環境において本菌が顕す病態形成機構は依然として不明な点が多く、主たる病原因子の同定並びに微生物間クロストークに関する分子解明,ひいては予防治療に資する標的分子の特定や腸管環境下の細菌叢調節を通じた感染制御策の構築等へと波及することが期待される。

Outline of Final Research Achievements

Here we investigated the dynamics of genetics and microbiota in humans following infection with Campylobacter jejuni to better understanding its pathogenesis in human. Metagenomic analyses suggested less impact of the Campylobacter infection on the microbiota composition. Whole genome sequencing analysis of the causative C. jejuni isolates revealed genomic variations even in the case with identical source, suggesting in vivo genomic alteration during infection. Transcriptome analyses showed that increased expression of a series of bacterial genes both in humans and in vitro cell culture, which were considered to be one of the hallmark for the development of Campylobacter infection in humans.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

食品媒介性に多発するカンピロバクターによる感染における細菌側因子の挙動に着目した検討を進めた。同研究を通じ、本菌感染に伴う菌叢への影響は大きくはない可能性が示唆され、菌叢管理による本菌感染症対策の効果は限定的と推察された。また、食中毒原因菌株のSNP解析結果から、食中毒事例における原因菌株の同一性を判断する上での指標となるSNP数に関する知見を得ることができ、本菌による食中毒時の集団感染であるかを見極める際の根拠として活用するための基礎的知見を収集できた。Transcriptome解析では本菌感染時の機能性が示唆される遺伝子群をスクリーニングでき、診断等でのマーカーとしての活用が期待される。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (34 results)

All 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (13 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 13 results,  Open Access: 6 results) Presentation (20 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 8 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Bacterial Distribution and Community Structure in Beef Cattle Liver and Bile at Slaughter.2022

    • Author(s)
      Asakura H, Yamamoto S, Sasaki Y, Okada Y, Katabami S, Fujimori A, Munakata K, Shiraki Y, Nishibu H, Hisamoto C, Kawase J, Ojima Y, Kiyoshima A, Shiroma K.
    • Journal Title

      J Food Prot.

      Volume: 85 Issue: 3 Pages: 424-434

    • DOI

      10.4315/jfp-21-288

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Draft Genome Sequence of Campylobacter jejuni ST-508 Strain Shizu21005, Isolated from an Asymptomatic Food Handler in Japan, 2021.2022

    • Author(s)
      Ogawa A, Nagaoka H, Asakura H.
    • Journal Title

      Microbiol Resour Announc.

      Volume: Epub ahead of print Issue: 6

    • DOI

      10.1128/mra.00316-22

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Retraction: Development and Evaluation of Fluorescence Immunochromatography for Rapid and Sensitive Detection of Thermophilic <i>Campylobacter</i>2021

    • Author(s)
      Asakura H, Sakata J, Sasaki Y, Kawatsu K.
    • Journal Title

      Food Safety

      Volume: 9 Issue: 3 Pages: 81-87

    • DOI

      10.14252/foodsafetyfscj.D-21-00006

    • NAID

      130008091473

    • ISSN
      2187-8404
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  • [Journal Article] 食肉・食鳥肉製品のハザードとその管理2021

    • Author(s)
      朝倉宏
    • Journal Title

      保健医療科学

      Volume: 70 Pages: 100-106

    • NAID

      130008057061

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  • [Journal Article] Phylogeny, prevalence, and shiga toxin (Stx) production of clinical Escherichia coli O157 clade 2 strains isolated in Shimane Prefecture, Japan2021

    • Author(s)
      Kawase J, Hirai S, Yokoyama E, Hayashi F, Kurosaki M, Kawakami Y, Fukuma A, Sakai T, Kotani M, Asakura H
    • Journal Title

      Current Microbiology

      Volume: 78 Issue: 1 Pages: 265-273

    • DOI

      10.1007/s00284-020-02252-4

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  • [Journal Article] Draft genome sequences of non-H2S-producing strains of Salmonella enterica serovars Infantis, Enteritidis, Berta, and Kiambu in Japan2020

    • Author(s)
      Asakura H, Sakata J, Yamamoto S, Igimi S
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 9 Issue: 30

    • DOI

      10.1128/mra.00335-20

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Attributing human foodborne diseases to food sources and water in Japan using analysis of outbreak surveillance data2020

    • Author(s)
      Kumagai Y, Pires SM, Kubota K, Asakura H
    • Journal Title

      Journal of Food Protection

      Volume: 83 Issue: 12 Pages: 2087-2094

    • DOI

      10.4315/jfp-20-151

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  • [Journal Article] 牛胆嚢内胆汁のカンピロバクター汚染状況と分離株の性状2020

    • Author(s)
      佐々木貴正, 岩田剛敏, 上間匡, 朝倉宏
    • Journal Title

      食品衛生学雑誌

      Volume: 61 Issue: 4 Pages: 126-131

    • DOI

      10.3358/shokueishi.61.126

    • NAID

      130007921906

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  • [Journal Article] Prevalence of Yersinia among wild sika deer (Cervus nippon) and boars (Sus scrofa) in Japan2020

    • Author(s)
      Takahashi T, Kabeya H, Sato S, Yamazaki A, Kamata Y, Taira K, Asakura H, Sugiyama H, Takai S, Maruyama S
    • Journal Title

      J Wildlife Dis

      Volume: 56 Issue: 2 Pages: 270-277

    • DOI

      10.7589/2019-04-094

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  • [Journal Article] Phylogenetic Diversity and Antimicrobial Resistance of <i>Campylobacter coli</i> from Humans and Animals in Japan2019

    • Author(s)
      Asakura H, Sakata J, Nakamura H, Yamamoto S, Murakami S.
    • Journal Title

      Microbes and Environments

      Volume: 34 Issue: 2 Pages: 146-154

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME18115

    • NAID

      130007668533

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
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      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Kuma Bamboo Grass (<i>Sasa veitchii</i>) Extracts Exhibit Protective Effects Against Atypical <i>Aeromonas salmonicida</i> Infection in Goldfish (<i>Carassius auratus</i>)2019

    • Author(s)
      Asakura H, Makino SI, Watanabe K, Tuchida Y, Kawabe M, Sakurai D.
    • Journal Title

      Biocontrol Science

      Volume: 24 Issue: 3 Pages: 145-154

    • DOI

      10.4265/bio.24.145

    • NAID

      130007706841

    • ISSN
      1342-4815, 1884-0205
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      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] カンピロバクター感染症の疫学,病原性および診断治療2019

    • Author(s)
      朝倉 宏
    • Journal Title

      感染制御と予防衛生

      Volume: 3 Pages: 87-93

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      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection of <i>Sarcocystis</i> spp. and Shiga toxin-producing <i>Escherichia coli</i> in Japanese sika deer meat using a loop-mediated isothermal amplification-lateral flow strip2019

    • Author(s)
      Sugita-Konishi Y, Kobayashi N, Takasaki K, Kanno T, Itoh M, Riztyan, Futo S, Asakura H, Taira K, Kawakami Y.
    • Journal Title

      Journal of Veterinary Medical Science

      Volume: 81 Issue: 4 Pages: 586-592

    • DOI

      10.1292/jvms.18-0372

    • NAID

      130007632969

    • ISSN
      0916-7250, 1347-7439
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  • [Presentation] Microbiological Risk Assessment Framework and Process Flow: JEMRA Approach2022

    • Author(s)
      Hiroshi Asakura
    • Organizer
      ILSI ASEAN Workshop on Microbiological Risk Assessment
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  • [Presentation] 鶏肉等におけるカンピロバクター汚染低減対策とその有効性評価について2021

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      朝倉宏
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      食の安全を確保するための微生物検査協議会2021年度講演会
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      朝倉宏
    • Organizer
      第42回日本食品微生物学会学術総会共催セミナー
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      朝倉宏
    • Organizer
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      朝倉宏, 中山達哉, 山本詩織, 伊澤和輝, 川瀬遵, 鳥居恭司, 村上覚史
    • Organizer
      第164回日本獣医学会学術集会
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  • [Presentation] 南九州で製造加工される生食用食鳥肉製品における衛生指標菌汚染分布と工程管理との関連性に関する検討2021

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      朝倉宏, 山本詩織, 町田李香, 中馬猛久
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      第42回日本食品微生物学会学術総会
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  • [Presentation] 国内流通鶏肉におけるカンピロバクターの定量的汚染実態に関する検討2021

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      朝倉宏, 山本詩織, 佐々木貴正, 池田徹也, 阿部光一朗, 山田和弘, 中村寛海, 野本竜平, 川瀬遵
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      第14回日本カンピロバクター研究会総会
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  • [Presentation] 市販鶏レバーにおけるカンピロバクター汚染の定量調査2020

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      米満研三,佐々木貴正,上間匡,朝倉宏
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      日本カンピロバクター研究会第13回総会
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  • [Presentation] 市販鶏肉から分離されるCampylobacter jejuniの血清遺伝子型分布調査2020

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      山田和弘,續木洋一,佐藤克彦,朝倉宏
    • Organizer
      日本カンピロバクター研究会第13回総会
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] カンピロバクター食中毒の食品寄与率に関する研究2020

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      熊谷優子,窪田邦宏,朝倉宏
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      日本カンピロバクター研究会第13回総会
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  • [Presentation] Campylobacter 定量試験における自動生菌数測定装置 TEMPOとmCCDA 培地との比較2020

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      渡部百合,関口幸恵,内田和之,朝倉宏
    • Organizer
      日本カンピロバクター研究会第13回総会
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  • [Presentation] Does Campylobacter jejuni paves the way for host switching from wild bird to poultry in coincidence with genomic recombination?2020

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      Asakura H, Kawase J, Okamura M, Yamamoto S, Chuma T
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      International Union of Microbiological Societies 2020 Annual Congresses (IUMS 2020)
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  • [Presentation] Current progress on the HACCP introduction in Japan2020

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      Asakura H
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  • [Presentation] 鶏の生産・食鳥処理・消費段階におけるCampylobacter spp.の動態解析2020

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      朝倉宏,山本詩織,中山達哉,佐々木貴正,中村寛海
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      第93回日本細菌学会学術総会
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  • [Presentation] Distribution and phylogenetic diversity of Campylobacter jejuni HS:19 in Japan2019

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      Asakura H, Sakata J, Akase S, Yamamoto S, Kawase J
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      日本微生物生態学会第33回大会
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  • [Presentation] 自動生菌数測定装置TEMPOを用いたCampylobacter定量法とmCCDA培地との比較2019

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      渡部百合,関口幸恵,内田和之,朝倉宏
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  • [Presentation] 鶏の生産段階におけるカンピロバクター動態解析2019

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      中山達哉,山本詩織,朝倉宏,村上覚史,鳥居恭司
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      第40回日本食品微生物学会学術総会
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  • [Presentation] 大阪市内の食中毒患者から分離された Campylobacter jejuni の分子疫学解析2019

    • Author(s)
      中村寛海,野本竜平,山本香織,朝倉宏,梅田薫,小笠原準
    • Organizer
      第40回日本食品微生物学会学術総会
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  • [Presentation] 食中毒細菌2019

    • Author(s)
      朝倉宏
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      日本防菌防黴学会第 46 回年次大会
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  • [Presentation] Campylobacter jejuniの細菌学的特性,並びにその制御に関する研究2019

    • Author(s)
      朝倉宏
    • Organizer
      第40回日本食品微生物学会学術総会
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    • Invited
  • [Book] 臨床検査(カンピロバクターによる食中毒の項を担当)2022

    • Author(s)
      朝倉宏
    • Total Pages
      7
    • Publisher
      医学書院
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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