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Molecular basis of 3'-5' polymerase in a diverse RNA recognition

Research Project

Project/Area Number 19K06519
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43020:Structural biochemistry-related
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

NAKAMURA Akiyoshi  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (10583891)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
KeywordsX線結晶構造解析 / tRNA修飾 / アミノアシルtRNA合成酵素 / DNA/RNAポリメラーゼ / 核酸 / タンパク質 / 鋳型依存塩基伸長 / 3'-5'方向塩基伸長 / 鋳型依存伸長反応 / 逆向き重合 / 酵素 / タンパク質-核酸相互作用 / tRNA
Outline of Research at the Start

核酸合成を担う酵素は全て5′-3′方向に塩基伸長するというのは長らく定説であったが、近年逆向きの3′-5′方向へ塩基伸長する酵素Thg1が発見された。しかし、なぜThg1には逆方向の塩基伸長活性が現存するのか、その生物学的意義の解明には至っていない。そこで本研究では、ランダムRNAライブラリーからThg1の基質となりうる新規RNAを探索し、Thg1との複合体の構造解析を行うことで、Thg1のRNA認識における多様性を解明することを目的とする。最終的には、得られた構造情報から、Thg1が制御する生体内RNAを同定し、生命現象における逆方向の塩基伸長の意義を明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

Thg1 is an enzyme that extends nucleotide in the reverse direction. Its biological significance is not fully understood. In our study, we discovered two mechanisms of base recognition in Human Thg1. One mechanism involves the formation of a U:A base pair in tRNA, which has been reported to function as piRNA in breast cancer cells, suggesting a new biological role for reverse polymerization activity. Additionally, the binding between Thg1 and mitochondrial tRNA was found to play a role in base recognition.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究ではThg1の逆向きの3’-5’方向へ塩基伸長活性がpiRNA合成と関与することを明らかにし、新たな生体内機能を示唆することができた。さらに、ヒトThg1が様々な修飾塩基をRNAの5’末端に付加できることを明らかにしたことから、ヒトThg1を活用した新たなRNAラベリング技術開発も期待できる。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] Analysis of GTP addition in the reverse (3′-5′) direction by human tRNA(His) guanylyltransferase2021

    • Author(s)
      Nakamura Akiyoshi、Wang Daole、Komatsu Yasuo
    • Journal Title

      RNA

      Volume: 27 Issue: 6 Pages: 665-675

    • DOI

      10.1261/rna.078287.120

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] ヒト由来tRNAHisグアニルトランスフェラーゼによる逆方向(3′-5′)の塩基付加反応の解析とRNA5’末端修飾への応用2021

    • Author(s)
      中村 彰良、汪 道楽、小松 康雄
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Human tRNAHis guanylyltransferaseのヌクレオチド認識機構の解明2021

    • Author(s)
      中村 彰良、汪 道楽、小松 康雄
    • Organizer
      令和3年(2021年)度日本結晶学会年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] ヒト由来tRNAHis guanylyltransferaseのヌクレオチド認識機構2021

    • Author(s)
      中村 彰良
    • Organizer
      2020年度量子ビームサイエンスフェスタ
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Nucleotide recognition mechanism of human tRNAHis guanylyltransferase and its application to RNA 5′-modification2020

    • Author(s)
      中村 彰良、汪 道楽、小松 康雄
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 2-セレノウリジン合成酵素SelUのtRNA選択性2020

    • Author(s)
      碓井 拓哉, 大江 花, 中村 彰良, 尾瀬 農之, 姚 閔
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Human tRNAHis guanylyltransferaseのRNA複合体構造解析2020

    • Author(s)
      中村彰良、汪道楽、小松 康雄
    • Organizer
      2019年度量子ビームサイエンスフェスタ
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] ヒト由来tRNAHis guanylyltransferaseによるミトコンドリアtRNAHisの5′末端修飾反応の解析2019

    • Author(s)
      中村彰良、汪道楽、小松 康雄
    • Organizer
      第21回日本RNA学会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] The nucleotide recognition mechanism of human tRNAHis guanylyltransferase in 3′-5′ nucleotide addition reaction2019

    • Author(s)
      Akiyoshi Nakamura, Daole Wang, Yasuo Komatsu
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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