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Pressure effects on the cyanobacterial circadian clock

Research Project

Project/Area Number 19K06530
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43020:Structural biochemistry-related
Research InstitutionRitsumeikan University

Principal Investigator

Kitahara Ryo  立命館大学, 薬学部, 教授 (70512284)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywords概日時計 / シアノバクテリア / 高圧 / ATPase / 圧力 / ATPase活性 / NMR / 概日周期
Outline of Research at the Start

概日周期は、細胞や個体で見られ、細胞分裂、行動や睡眠など重要な生命活動を制御している。本研究では、シアノバクテリアおよびヒトの概日時計の圧力応答について研究し、概日周期(システム、個体)と周期長を制御する酵素活性(分子)に圧力補償性(耐性)があるのかを解明する。幅広い圧力・温度範囲での周期長、酵素活性の測定を行い、周期長-酵素活性相関を検証する。また、耐圧製の発光観測装置を作製し、シアノバクテリア個体内(in vivo)での周期長観測を行う。細胞の概日周期を圧力や温度により制御できれば、新しい科学技術の創出につながる

Outline of Final Research Achievements

Despite broad-scale adaptations of organisms across domains (from bacteria to animals) to various environmental conditions such as temperature, pressure, pH, and salt concentrations, the circadian clock is a shared characteristic as a fundamental timing device. However, the detailed molecular mechanism of each autonomously operating circadian clock remains unclear. The circadian clock of cyanobacteria is controlled by three proteins, KaiA, KaiB, KaiC, and ATP. While the circadian rhythm is inherently robust to temperature change, we found that KaiC phosphorylation cycles were accelerated from 22 h at 1 bar to 14 h at 200 bar and to 11 h at 400 bar, decreasing circadian-period length. This reduction resulted from pressure-induced enhancement of KaiC ATPase activity and allosteric effects. This relashionship was also investigated in the KaiC mutants, R393C and F470Y.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ヒトを含めた地球上の生物は地球の自転に同調した生物リズムを有する。本研究では、最も構造生物学的研究が進んでいるシアノバクテリアの概日時計をモデルとして、その圧力効果を調べた。概日時計は3つのタンパク質KaiA, KaiB, KaiCとATPからなり、KaiCのリン酸化脱リン酸化のサイクルが約24時間の周期を示す。加圧により周期長が短縮すること、短縮はKaiCの有するATP加水分解活性(ATPase活性)の上昇と相関があることを見出した。活性化体積が負であること、つまり反応の遷移状態で体積が収縮することを示す。深海(高圧)など極限環境での生命現象の理解やその環境適応についての知見となる。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2021 2020 2019 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] 高圧力が蛋白質に及ぼす影響~圧力で早まるシアノバクテリアの概日時計~2020

    • Author(s)
      三橋景汰、北原亮
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 58 Pages: 579-584

    • NAID

      130008095498

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pressure accelerates the circadian clock of cyanobacteria2019

    • Author(s)
      Ryo Kitahara, Katsuaki Oyama, Takahiro Kawamura, Keita Mitsuhashi, Soichiro Kitazawa, Kazuhiro Yasunaga, Natsuno Sagara, Megumi Fujimoto, and Kazuki Terauchi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Issue: 1 Pages: 12395-12395

    • DOI

      10.1038/s41598-019-48693-1

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 高圧下で早くなるシアノバクテリア概日時計2021

    • Author(s)
      原菜々花、三橋景汰、北沢創一郎、北原亮
    • Organizer
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] シアノバクテリ概日時計のpH依存性2021

    • Author(s)
      宮本正洋、三橋景汰、北沢創一郎、北原亮
    • Organizer
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Pressure accelerates the circadian clock of cyanobacteria2021

    • Author(s)
      Ryo Kitahara, Keita Mitsuhashi, Soichiro Kitazawa, Kazuki Terauchi
    • Organizer
      65th Biophysical Society Annual Meeting
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Pressure-induced acceleration of the cyanobacterial circadian clock2020

    • Author(s)
      Keita Mitsuhashi, Rina Sakurai, Soichiro Kitazawa, and Ryo Kitahara
    • Organizer
      第20回蛋白質科学会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Pressure-induced acceleration of the cyanobacterial circadian clock2020

    • Author(s)
      Keita Mitsuhashi, Rina Sakurai, Soichiro Kitazawa, Kazuki Terauchi and Ryo Kitahara
    • Organizer
      第58回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] シアノバクテリアの概日時計の圧 力応答研究2020

    • Author(s)
      三橋景汰、櫻井里菜、北沢創一郎、寺内一姫、北原亮
    • Organizer
      第70回日本薬学会関西支部大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 圧力で早まるシアノバクテリアの 概日時計2020

    • Author(s)
      三橋景汰、北沢創一郎、 寺内一姫、北原亮
    • Organizer
      第61回高圧討論会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 極限環境と概日時計2020

    • Author(s)
      三橋景汰、北沢創一郎、寺内一姫、北原亮
    • Organizer
      第140回日本薬学会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] シアノバクテリアの生物時計は高圧力下でどうなる?2019

    • Author(s)
      三橋景汰、大山克明、川村宇宙、北沢創一郎、安永和寛、相良夏乃、藤本恵、寺内一姫、北原亮
    • Organizer
      第19回蛋白質科学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Pressure accelerates the circadian clock of cyanobacteria2019

    • Author(s)
      Ryo Kitahara, Katsuaki Oyama, Takahiro Kawamura, Keita Mitsuhashi, Soichiro Kitazawa, Kazuhiro Yasunaga, Natsuno Sagara, Megumi Fujimoto, and Kazuki Terauchi
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] シアノバクテリア概日時計の圧力依存性 ー野生型KaiC および周期長変異型KaiC のリン 酸化サイクルについてー2019

    • Author(s)
      櫻井里菜、三橋景汰、北沢創一郎、寺内一姫、北原 亮
    • Organizer
      第69回日本薬学会関西支部会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Remarks] 立命館大学薬学部 生体分子構造学研究室ホームページ

    • URL

      http://www.ritsumei.ac.jp/pharmacy/kitahara/kitahara_lab.html#

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Remarks] 立命館大学薬学部 生体分子構造学研究室(北原研究室)

    • URL

      http://www.ritsumei.ac.jp/pharmacy/kitahara/kitahara_lab.html

    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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