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Identification of the minimal requirements for the recognition of transport vesicles

Research Project

Project/Area Number 19K06559
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43030:Functional biochemistry-related
Research InstitutionUniversity of Toyama (2020-2022)
The University of Tokyo (2019)

Principal Investigator

Koike Seiichi  富山大学, 学術研究部工学系, 特命助教 (10431686)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
KeywordsSNAREタンパク質 / Rab GTPase / ホスホイノシチド / VPS13B / エンドソーム / 輸送小胞 / 膜融合 / テザリング因子 / 細胞内小胞輸送 / SNARE / Rab / Vps13B / スペクトリン / リサイクリングエンドソーム / Vps13 / Rab14 / マイクロインジェクション / 合成生物学 / 細胞内輸送
Outline of Research at the Start

オルガネラが「輸送小胞」を用いて互いに情報や物質のやり取りを行うことは、細胞内の恒常性維持に必須である。では輸送小胞は無数に存在するオルガネラの中からどのように正しい標的のみに運ばれ、認識されるのだろうか?
これまでに、既知の因子のみで作製した人工輸送小胞を細胞内に導入し、その行き先を調べることで、小胞膜上のSNAREタンパク質がそれぞれの小胞のアイデンティティを決める重要な因子であることを明らかにした。そこで、本研究では、標的膜がどのように小胞のSNAREタンパク質を認識するのか、その分子実体を同定することによって、標的膜と小胞が特異的に認識しあうための必要最小構成因子を明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

So far, we have elucidated the sufficient conditions for the "Zip-codes" information that targets transport vesicles to be targeted to specific organelles within living cells by introducing (proteo)liposomes resembling transport vesicles made in vitro. As a result, we have revealed that SNARE proteins play a central role in this process. In this study, we were able to elucidate how Rab GTPases and phosphoinositides (other Zip-code molecules) are involved in enhancing the specificity of targeting. Additionally, we successfully revealed the molecular mechanism by which target organelles receive the Zip-code information present on transport vesicles.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

細胞内には無数のオルガネラが隙間なく配置されており、その合間をかい潜るように輸送小胞が行き来することで、オルガネラ間での情報や物質のやり取りが行なわれている。ただ、その行き先がどのように正しく決められているのかはよく分かっていなかった。本研究では、そのための十分条件とその分子メカニズムを明らかにすることに成功した。これは、細胞内小胞輸送の理解について大きな進歩であるとともに、十分条件を明らかにできたことは、今後人為的に細胞内輸送を制御・改変できる可能性を秘めている。今後この知見を用いることで、特定のオルガネラにのみ薬剤を届ける新規技術の開発につながる可能がある。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2023 2022 2019 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Max Planck Institute(ドイツ)

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] Max Planck Institute for Biophys. chem.(ドイツ)

    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] Max Planck Institute(ドイツ)

    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Journal Article] SNARE proteins: zip codes in vesicle targeting?2022

    • Author(s)
      Koike Seiichi、Jahn Reinhard
    • Journal Title

      Biochemical Journal

      Volume: 479 Issue: 3 Pages: 273-288

    • DOI

      10.1042/bcj20210719

    • Related Report
      2022 Annual Research Report 2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] SNAREs define targeting specificity of trafficking vesicles by combinatorial interaction with tethering factors.2019

    • Author(s)
      Seiichi koike, Jahn Reinhard
    • Journal Title

      Nature communications

      Volume: 10 Issue: 1

    • DOI

      10.1038/s41467-019-09617-9

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] スペクトリンβIIはエンドソーム膜の変形を抑制することで小胞輸送を制御する2023

    • Author(s)
      北川大智, 黒澤信幸, 磯部正治, 小池誠一
    • Organizer
      第41回日本生化学会北陸支部大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞内小胞輸送におけるスペクトリンの機能解明2022

    • Author(s)
      北川大智, 黒澤信幸, 小池誠一
    • Organizer
      第40回日本生化学会北陸支部大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] βスペクトリンはアイソフォーム特異的に膜のダイナミクスを制御する2022

    • Author(s)
      北川大智, 磯部正治, 黒澤信幸, 小池誠一
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 輸送小胞の細胞内再構成2022

    • Author(s)
      小池誠一、Reinhard Jahn
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Spectrin βII suppresses endosomal vesicle trafficking by regulating membrane dynamics2022

    • Author(s)
      Daichi KITAGAWA, Seiichi KOIKE
    • Organizer
      XXII GEM CONGRESS,INTERACTIONS LIPIDS/POLYMERS/MEMBRANE PROTEINS
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] SNAREタンパク質が輸送小胞の行き先を決定する2019

    • Author(s)
      小池誠一
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] SNAREタンパク質による小胞ターゲティングメカニズムの解明2019

    • Author(s)
      小池誠一
    • Organizer
      第3回オルガネラゾーン研究会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Remarks] 研究室ホームページ

    • URL

      http://enghp.eng.u-toyama.ac.jp/labs/lb13/

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      2022 Annual Research Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2025-03-27  

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