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Development of ATP super-resolution imaging method using atomic force microscopy and chemiluminescent proteins

Research Project

Project/Area Number 19K06580
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43040:Biophysics-related
Research InstitutionKanazawa University

Principal Investigator

Ichikawa Takehiko  金沢大学, ナノ生命科学研究所, 特任助教 (10462201)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords原子間力顕微鏡 / 超解像顕微鏡 / ATP / ミトコンドリア / 化学発光タンパク質
Outline of Research at the Start

本研究ではサブナノスケールでイメージングが可能な原子間力顕微鏡(AFM)を用い、AFM探針にATPが結合すると発光を触媒するルシフェラーゼを結合することにより新たなアプローチ法によるATPの超解像顕微鏡を構築すること、そして構築した顕微鏡を用いてミトコンドリアの外膜表面のATP透過型チャネルの機能について明らかにする。ATP透過チャネルは抗がん剤の薬剤ターゲットとして注目されており本研究によって創薬に必要な基盤情報が得られる可能性がある。

Outline of Final Research Achievements

I have worked on developing microscopy capable of measuring the nanoscale distribution of adenosine triphosphate (ATP) using an atomic force microscope (AFM) and a luciferase protein. By using a focused ion beam system, I succeeded in developing a technique to bind the biosensor proteins only to a region of about 100 nm at the tip of the AFM cantilever. In addition, I incorporated a home-made AFM into a commercially available confocal microscope and constructed a confocal-AFM simultaneous measurement system for cells. I also developed a device to emit ATP-containing solution from a hole of less than 100 nm in diameter, which enabled us to verify the theory of this microscopy. On the other hand, it became clear that the biosensor initially planned to be used was not suitable for this technology.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究で開発したAFM探針先端へのタンパク質の局所的な吸着方法はrecognition imagingを始めとするAFM探針を用いたイメージング技術にとって基盤的技術になる可能性を持つ。現時点では化学的修飾方法を用いたセンサー付加が行われているが、本研究で開発した方法を用いることによって比較的簡便にしかも数十ナノメートルの精度で目的タンパク質を結合させることが可能になる。さらに本研究で構築した共焦点-AFM融合顕微鏡は近年増加しつつある細胞のAFM観察を行う上で基本的な機器となると考えられる。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (4 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Unraveling the host-selective toxic interaction of cassiicolin with lipid membranes and its cytotoxicity2022

    • Author(s)
      Ngo Kien Xuan、Nguyen Phuong Doan N.、Furusho Hirotoshi、Miyata Makoto、Shimonaka Tomomi、Chau Nguyen Ngoc Bao、Vinh Nguyen Phuong、Nghia Nguyen Anh、Mohammed Tareg Omer、Ichikawa Takehiko、Kodera Noriyuki、Konno Hiroki、Fukuma Takeshi、Quoc Nguyen Bao
    • Journal Title

      Phytopathology

      Volume: - Issue: 7 Pages: 000-000

    • DOI

      10.1094/phyto-09-21-0397-r

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Visualizing intracellular nanostructures of living cells by nanoendoscopy-AFM2021

    • Author(s)
      Penedo Marcos、Miyazawa Keisuke、Okano Naoko、Furusho Hirotoshi、Ichikawa Takehiko、Alam Mohammad Shahidul、Miyata Kazuki、Nakamura Chikashi、Fukuma Takeshi
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 7 Issue: 52

    • DOI

      10.1126/sciadv.abj4990

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Cell penetration efficiency analysis of different atomic force microscopy nanoneedles into living cells2021

    • Author(s)
      Penedo Marcos、Shirokawa Tetsuya、Alam Mohammad Shahidul、Miyazawa Keisuke、Ichikawa Takehiko、Okano Naoko、Furusho Hirotoshi、Nakamura Chikashi、Fukuma Takeshi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 7756-7756

    • DOI

      10.1038/s41598-021-87319-3

    • Related Report
      2021 Annual Research Report 2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Non-junctional role of Cadherin3 in cell migration and contact inhibition of locomotion via domain-dependent, opposing regulation of Rac12020

    • Author(s)
      Ichikawa Takehiko、Stuckenholz Carsten、Davidson Lance A.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Issue: 1 Pages: 7756-7756

    • DOI

      10.1038/s41598-020-73862-y

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 化学固定は膜タンパク質を凝集することにより細胞表面にナノスケールのクラスターを形成する2021

    • Author(s)
      市川 壮彦
    • Organizer
      学術変革領域(A)クロススケール新生物学キックオフミーティング
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 化学固定は膜タンパク質を凝集することによって細胞表面にナノスケールのクラスターを形成する2021

    • Author(s)
      市川 壮彦
    • Organizer
      第59回日本生物物理学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 原子間力顕微鏡と多孔窒化シリコン薄膜を用いた生きた細胞表面の高分解能観察方法の開発2020

    • Author(s)
      市川 壮彦
    • Organizer
      第58回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 肺がん細胞膜上の c-Met 受容体分子を原子間力顕微鏡で観察する方法の開発2020

    • Author(s)
      市川 壮彦
    • Organizer
      第72回日本細胞生物学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 走査型プローブ顕微鏡及びそれを用いた細胞表面の観察方法2019

    • Inventor(s)
      福間剛士
    • Industrial Property Rights Holder
      福間剛士
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2019
    • Related Report
      2019 Research-status Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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