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Dynamics analysis of virus entry and budding by high speed AFM

Research Project

Project/Area Number 19K06583
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43040:Biophysics-related
Research InstitutionKyoto University (2020-2022)
Nagoya University (2019)

Principal Investigator

Usukura Eiji  京都大学, 医学研究科, 特定助教 (00643727)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywordsインフルエンザ / 高速原子間力源鼻鏡 / 電子顕微鏡 / インフルエンザウイルス / 高速走査型原子間力顕微鏡 / エンドサイトーシス / 1分子観察 / 原子間力顕微鏡 / living cell imaging / ウイルス
Outline of Research at the Start

本研究は、ウイルスの細胞への侵入と出芽を高速チップスキャニング型原子間力顕微鏡(高速AFM)と電子顕微鏡を用いて観察し、感染過程を形態的に行う研究である。細胞表面に接着したウイルスがどのように細胞へ侵入し、感染増殖後、細胞から出芽する様子を高速AFMでリアルタイム観察を行う。また、電子顕微鏡を用いて細胞内におけるウイルスの挙動を形態学的に解析する。

Outline of Final Research Achievements

In this research, I tried to observe the uptake and budding process of influenza virous by high speed scanning atomic force microscopy (high speed scanning AFM) and electron microscopy. Therefore, the real time imaging of the uptake and budding process from infected living cell could be observed by high speed scanning AFM. In addition, distributions of vRNP formed by RNA and proteins and M1 protein related with formation of the envelope in the cytoplasm and on the inner surface of plasma membrane were observed by immune-freeze etching replica after using unroofing method for exposing the inner surface of plasma membrane or Tokuyasu method for preparing the cytoplasm section. These methods and results make it possible to contribute to breakthrough of the motion and the structure formation process.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、まず原子間力顕微鏡を用いたインフルエンザウイルスの細胞への侵入と細胞からの出芽を観察する手法の確立をすることがきた。この手法は他のウイルスの観察にも活かすことを期待でき、ウイルスの侵入と出芽に関する新たな知見だけでなく、薬品開発につながる阻害剤のリアルタイムな効果の観察にも応用できると考えている。次に、電子顕微鏡による観察から、細胞内でのウイルス形成の過程に関係すると思われる形態を見ることができた。これにより、これまで不透明な細胞内でのウイルス形成の解明に寄与できると考えている。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (2 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] A cryo-TSEM with temperature cycling capability allows deep sublimation of ice to uncover fine structures in thick cells2021

    • Author(s)
      Usukura Jiro、Narita Akihiro、Matsumoto Tomoharu、Usukura Eiji、Sunaoshi Takeshi、Watanabe Syunya、Tamba Yusuke、Nagakubo Yasuhira、Mizuo Takashi、Azuma Junzo、Osumi Masako、Nimura Kazutaka、Tamochi Ryuichiro、Ose Yoichi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 21406-21406

    • DOI

      10.1038/s41598-021-00979-z

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Atomic Force Microscopy of the Cell2020

    • Author(s)
      臼倉 英治、臼倉 治郎
    • Journal Title

      KENBIKYO

      Volume: 55 Issue: 1 Pages: 31-36

    • DOI

      10.11410/kenbikyo.55.1_31

    • NAID

      130007840888

    • ISSN
      1349-0958, 2434-2386
    • Year and Date
      2020-04-30
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Improved unroofing protocols for cryo-electron microscopy, atomic force microscopy and freeze-etching electron microscopy and the associated mechanisms2020

    • Author(s)
      Morone Nobuhiro、Usukura Eiji、Narita Akihiro、Usukura Jiro
    • Journal Title

      Microscopy

      Volume: 69 Issue: 6 Pages: 350-359

    • DOI

      10.1093/jmicro/dfaa028

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 原子間力顕微鏡による細胞膜内面の構造解析を可能にしたアンルーフ法2019

    • Author(s)
      臼倉 英治, 成田 哲博, 臼倉 治郎
    • Journal Title

      生物物理誌

      Volume: 59 Pages: 208-211

    • NAID

      130007683543

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Motion Analysis Of Actin Oligomer In Lamellipodia By SiMS Microscopy2021

    • Author(s)
      臼倉英治
    • Organizer
      整体運動研究合同班会議
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] AFM細胞生物学の最先端、live cell imagingから免疫細胞化学まで2019

    • Author(s)
      臼倉英治
    • Organizer
      第124回日本解剖学会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Invited

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Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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