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Analysis of reaction network from the loading to unloading of the DNA damage checkpoint clamp 9-1-1 onto DNA

Research Project

Project/Area Number 19K06613
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43050:Genome biology-related
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

Ohashi Eiji  九州大学, 理学研究院, 講師 (90378951)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
KeywordsDNA損傷 / チェックポイント / DNA修復 / シグナル伝達 / 二本鎖DNA切断 / 削り込み / DNA損傷チェックポイント / DNA損傷応答 / タンパク質間相互作用
Outline of Research at the Start

細胞内でDNAが損傷を受けると、それを感知して伝える仕組み(DNA損傷チェックポイント)とその損傷を取り除く仕組み(DNA修復)が働く。その両方に機能すると考えられている9-1-1(Rad9-Hus1-Rad1)複合体は、DNA損傷に応じてDNAを取り囲む形で装着される。この9-1-1のDNA装着反応と、9-1-1によるDNA損傷チェックポイントやDNA修復の促進反応については、これまで別々に研究されていた。本研究では、9-1-1がDNAに装着されてから脱装着されるまでに起こる一連の反応ネットワークを理解することを目的とし、精製したタンパク質や細胞抽出液を用いた試験管内再構成系を確立する。

Outline of Final Research Achievements

The DNA damage checkpoint clamp 9-1-1 (Rad9-Hus1-Rad1) participates in multiple aspects in response to DNA damage. In this study, we analyzed the roles of 9-1-1 upon the most severe DNA damage, double-stranded DNA breaks (DSBs), and found that 9-1-1 and another multifunctional complex, Mre11-Rad50-Nbs1 (MRN), redundantly activate the DNA damage signaling pathway that recognizes single-stranded (ss) DNA exposure. They also redundantly promote DSB end resection, an initial stage of homology-directed DNA repair. We further clarified the key factors and molecular mechanisms that activate the signaling pathway and facilitate the end-resection in response to DSBs. This study contributes to understanding of the mechanism how 9-1-1 and MRN complexes simultaneously activate the signaling pathway and stimulate the end-resection, and the mechanism of switching from the pathway that recognizes DSBs to the one that recognizes ssDNA exposure as resection proceeds.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

我々は現在、抗がん剤や農薬、環境汚染物質などDNA損傷を生じるような様々な化学物質に晒されている。また近年CRISPR-Casシステムなどを用いたゲノム編集が盛んに行われており、効率よくゲノム編集するために二重鎖切断が用いられている。このように、さまざまなDNA損傷や、二重鎖切断後に細胞内で起こる反応を正確に知ることは非常に重要である。これまで、損傷後のチェックポイント応答や、二重鎖切断後の反応は、別々に解析されることがほとんどであったが、本研究ではこれらを同時に調べる系が確立できた。また、それらの両反応に2つの多機能複合体が重複して機能することを示すことができた点は大変意義深い。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2023 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] The 9-1-1 DNA clamp subunit RAD1 forms specific interactions with clamp loader RAD17, revealing functional implications for binding-protein RHINO2023

    • Author(s)
      Hara Kodai、Hishiki Asami、Hoshino Takako、Nagata Kiho、Iida Nao、Sawada Yukimasa、Ohashi Eiji、Hashimoto Hiroshi
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 299 Issue: 4 Pages: 103061-103061

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.103061

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structure of the RAD9-RAD1-HUS1 checkpoint clamp bound to RHINO sheds light on the other side of the DNA clamp2019

    • Author(s)
      Hara Kodai、Iida Nao、Tamafune Ryota、Ohashi Eiji、Sakurai Hitomi、Ishikawa Yoshinobu、Hishiki Asami、Hashimoto Hiroshi
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 295 Issue: 4 Pages: 899-904

    • DOI

      10.1074/jbc.ac119.011816

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Specific basic patch‐dependent multimerization of Saccharomyces cerevisiae ORC on single‐stranded DNA promotes ATP hydrolysis.2019

    • Author(s)
      Kawakami Hironori、Muraoka Ryuya、Ohashi Eiji、Kawabata Kenta、Kanamoto Shota、Chichibu Takeaki、Tsurimoto Toshiki、Katayama Tsutomu
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 24 Issue: 9 Pages: 608-618

    • DOI

      10.1111/gtc.12710

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 9-1-1とMRNはDNA二重鎖切断のシグナリングと削り込みに重複した機能を持つ2022

    • Author(s)
      達川絢介, 高橋達郎, 大橋英治
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] DNA二重鎖切断後の削り込みとチェックポイント活性化の連携機構2021

    • Author(s)
      達川絢介、高橋達郎、○大橋英治
    • Organizer
      第26回 DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] DNA損傷チェックポイントクランプ9-1-1のリング部分の役割2021

    • Author(s)
      達川絢介、橋本博、高橋達郎、○大橋英治
    • Organizer
      第44回 日本分子生物学会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 9-1-1とMRNは独立した経路でDNA二重鎖切断末端の削り込みを促進する2021

    • Author(s)
      ○達川絢介、高橋達郎、大橋英治
    • Organizer
      第44回 日本分子生物学会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 9-1-1とMRNは独立した経路で DNA二重鎖切断末端の削り込みを促進する2021

    • Author(s)
      ○達川絢介、高橋達郎、大橋英治
    • Organizer
      第39回染色体ワークショップ・ 第20回核ダイナミクス研究会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] DNA損傷チェックポイントクランプ9-1-1によるATR活性化機構2021

    • Author(s)
      達川 絢介、橋本 博、釣本 敏樹、高橋 達郎、大橋 英治
    • Organizer
      第38回染色体ワークショップ・第19回核ダイナミクス研究会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] チェックポイントセンサー9-1-1とMRNによる二重鎖切断後の損傷応答制御2020

    • Author(s)
      達川 絢介、釣本 敏樹、高橋 達郎、大橋 英治
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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