Regulation of TE-derived non-coding RNAs in plant genomes
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19K06619
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 43050:Genome biology-related
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| Research Institution | Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University |
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Principal Investigator |
Hidetoshi Saze 沖縄科学技術大学院大学, 植物エピジェネティクスユニット, 准教授 (70510006)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2021)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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| Keywords | エピジェネティクス / トランスポゾン / 植物ゲノム / トランスポソン / エピゲノム / シロイヌナズナ / 非コードRNA / 転移因子 / RNA |
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| Outline of Research at the Start |
植物のゲノムでは遺伝子内部の非翻訳領域に転移因子（トランスポゾン）が大量に蓄積している。本研究は植物ゲノムの遺伝子内部に存在する転移因子由来の潜在的プロモーターから転写されるRNAの転写制御メカニズムをエピジェネティック制御の観点から明らかにすることを目的とする。
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| Outline of Final Research Achievements |
In plant genomes, many transposable elements (TEs) are accumulated in genic regions including intron and untranslated regions (UTR) of genes. In this study, we investigated cryptic promoters that are regulated by epigenetic modifications. In Arabidopsis thaliana, we identified more than 3000 novel transcription start sites (TSS) that are epigenetically regulated, most of which are derived from TE sequences.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
これまで理解されていなかった植物ゲノムにおける遺伝子の転写開始点制御と転移因子配列のエピジェネティック制御について本研究成果から明らかになった。
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Report
(4 results)
Research Products
(4 results)
