• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Screening for factors that enhance HDR by CRISPR-Cas9

Research Project

Project/Area Number 19K06631
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43060:System genome science-related
Research InstitutionTokyo Metropolitan Institute of Medical Science

Principal Investigator

KATO-INUI Tomoko  公益財団法人東京都医学総合研究所, 疾患制御研究分野, 研究員 (10638802)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords相同組換え修復 / HDR / CRISPR-Cas9 / スクリーニング / DNA修復 / HDR亢進因子 / NHEJ抑制因子 / CRISPR/Cas9 / HDR亢進 / NHEJ抑制 / 相同組み換え / HDR因子
Outline of Research at the Start

世界に蔓延する多くの遺伝性疾患が点変異を起因とするものである。近年のゲノム編集技術の台頭により、これまで以上に自在にゲノムの改変が行えるようになり、さらにオフターゲットがなく、安全性が担保されれば、ゲノム編集による治療の実用化が可能な段階となってきた。代表者の研究室では、より高効率に正確なゲノム編集を誘導できるシステムを開発している。本研究では、医療応用に向けたゲノム編集による治療の実現を目指し、これまでの知見に囚われずにHDRを亢進すると同時にNHEJを阻害する因子を、cDNAライブラリを利用して新たに開拓することを目的とする。

Outline of Final Research Achievements

CRISPR-Cas9 is a versatile technology that can be applied to medical treatment. Between the repair pathway that occur after DNA double-stranded breaks, repair by homologous recombination with template DNA (HDR) contributes to precise editing, but at the same time NHEJ, which involves in base deletions or insertions, also occurs at a high frequency. I performed the cell-based screening for HDR-enhancing factors using the Traffic Light Reporter system, which can simultaneously detect cells with HDR and NHEJ, and identified several genes that are highly expressed in HDR-derived cells compared to NHEJ-derived cells. Further gene ontology analysis of these genes suggested that they are related to DNA repair and the cell cycle.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は正確なゲノム編集技術の確立を目指すと同時に、CRISPR-Cas9の分子機構の解明を更に加速させる可能性を秘めている。特に、HDR効率の高い哺乳類細胞からcDNAライブラリを用いたゲノムワイドな研究と、HDRとNHEJの同時検出を可能にするレポーター遺伝子を用いたスクリーニングの組み合わせによる研究は画期的な研究手法である。既存の概念を打破した研究への展開には、CRISPRスクリーニングは必須のツールであり、本研究により正確なゲノム編集が達成できれば、国内外問わず、ゲノム編集の実用化に向けての礎となる重要な成果となる。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] PACT/PRKRA and p53 regulate transcriptional activity of DMRT12020

    • Author(s)
      Fujitani K, Otomo A, Nagayama Y, Tachibana T, Kato R, Kawashima Y, Kodera Y, Kato T, Takada S, Tamura K, Takamatatsu N and Ito M.
    • Journal Title

      Genetics and Molecular Biology

      Volume: 43

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Comparative analysis demonstrates cell type-specific conservation of SOX9 targets between mouse and chicken.2019

    • Author(s)
      Yamashita S, Kataoka K, Yamamoto H, Kato T, Hara S, Yamaguchi K, Renard-Guillet C, Katou Y, Shirahige K, Ochi H, Ogino H, Uchida T, Inui M, Takada S, Shigenobu S, and Asahara H
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Issue: 1 Pages: 12560-12560

    • DOI

      10.1038/s41598-019-48979-4

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Expression of progesterone receptor, estrogen receptors α and β, and kisspeptin in the hypothalamus during perinatal development of gonad-lacking steroidogenic factor-1 knockout mice2019

    • Author(s)
      Ikeda Yayoi、Kato-Inui Tomoko、Tagami Ayako、Maekawa Mamiko
    • Journal Title

      Brain Research

      Volume: 1712 Pages: 167-179

    • DOI

      10.1016/j.brainres.2019.02.016

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] CRISPR-Cas9システムを基盤とした相同組換えによる修復(HDR)亢進因子の新規探索2021

    • Author(s)
      加藤 朋子
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会(横浜・オンラインのハイブリッド開催)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Book] ゲノム編集技術を応用した製品開発とその実用化2021

    • Author(s)
      執筆者:96名(乾 雅史、乾ー加藤朋子(分担執筆))、技術情報協会
    • Total Pages
      602
    • Publisher
      技術情報協会
    • ISBN
      9784861048272
    • Related Report
      2020 Research-status Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi