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Study on the mechanism of thermospermine-enhanced mRNA translation in plants

Research Project

Project/Area Number 19K06724
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 44030:Plant molecular biology and physiology-related
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

Takahashi Taku  岡山大学, 自然科学学域, 教授 (20271710)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywordsシロイヌナズナ / ポリアミン / サーモスペルミン / 維管束 / mRNA翻訳 / 植物ホルモン / 遺伝子翻訳 / 植物発生
Outline of Research at the Start

サーモスペルミンは,植物と一部の細菌が持つポリアミンの一つで,高等植物では維管束木部分化の抑制に関わる。シロイヌナズナの変異体を用いた解析から,サーモスペルミンが転写因子遺伝子の翻訳促進に働くことを突き止めたが,その分子機構は明らかでない。また,外的なサーモスペルミンは木部分化を抑制するが,その取り込み,輸送機構は不明である。本研究では,シロイヌナズナのサーモスペルミン非感受性変異,およびサーモスペルミンが翻訳促進する遺伝子群の応答解析から,サーモスペルミンが細胞内に輸送される過程,直接相互作用する標的分子の同定,特定mRNAを翻訳促進する分子機構の解明を目指す。

Outline of Final Research Achievements

Four mutants of Arabidopsis that are insensitive to high concentrations of thermospermine were isolated and named its1, 3, 7, and 11. Genetic experiments revealed that the genes responsible for its1, 3, 7, and 11, encode an RNA methyl transferase, an RNA splicing-related enzyme, an RNA-binding protein, and a pseudo-uridine synthase, respectively. These results suggest the involvement of RNA processing or modification in the action of thermospermine.
Furthermore, SAC51, a target of thermospermine-enhanced mRNA translation, was identified as the gene responsible for the sac503 mutation that suppresses the phenotype of a thermospermine-deficient mutant, acl5.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ポリアミンはあらゆる生き物がもつ低分子塩基性化合物で,多様な生理活性を持つ。シロイヌナズナの解析から,オーキシンによる維管束分化の誘導をポリアミンの1つであるサーモスペルミンが抑えるという機能を明らかにしたが,その作用機構は不明である。本研究では,サーモスペルミン非感受性変異株itsを単離し,its1, its3, its7, its11がそれぞれRNAメチル化酵素,RNAスプライシング関連タンパク,RNA結合タンパク,RNAシュードウリジン化酵素をコードする遺伝子に変異を持つことを突き止め,サーモスペルミンの作用にRNA修飾が深く関わることを明らかにした。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 6 results) Presentation (10 results)

  • [Journal Article] Responses of Polyamine-Metabolic Genes to Polyamines and Plant Stress Hormones in Arabidopsis Seedlings2021

    • Author(s)
      Yariuchi Yusaku、Okamoto Takashi、Noutoshi Yoshiteru、Takahashi Taku
    • Journal Title

      Cells

      Volume: 10 Issue: 12 Pages: 3283-3283

    • DOI

      10.3390/cells10123283

    • NAID

      120007183230

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 植物ポリアミンの代謝と機能2021

    • Author(s)
      高橋卓・本瀬宏康
    • Journal Title

      『化学と生物』 日本農芸化学会会誌 (2021) 6月号

      Volume: 59 Pages: 290-297

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Journal Article] Chemical synthesis and biological effect on xylem formation of xylemin and Its analogues2020

    • Author(s)
      Hiroyoshi Takamura, Hiroyasu Motose, Taichi Otsu, Shiori Shinohara, Ryugo Kouno, Isao Kadota, Taku Takahashi
    • Journal Title

      Eur. J. Org. Chem.

      Volume: 2020 Issue: 18 Pages: 2745-2753

    • DOI

      10.1002/ejoc.202000322

    • NAID

      120006999366

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Easy-to-Use InDel Markers for Genetic Mapping between Col-0 and Ler-0 Accessions of Arabidopsis thaliana2020

    • Author(s)
      Tanaka Takahiro、Nishii Yuichi、Matsuo Hirotoshi、Takahashi Taku
    • Journal Title

      Plants

      Volume: 9 Issue: 6 Pages: 779-779

    • DOI

      10.3390/plants9060779

    • NAID

      120006877070

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Plant Polyamines2020

    • Author(s)
      Takahashi Taku
    • Journal Title

      Plants

      Volume: 9 Issue: 4 Pages: 511-511

    • DOI

      10.3390/plants9040511

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Complexity and Conservation of Thermospermine-Responsive uORFs of SAC51 Family Genes in Angiosperms2019

    • Author(s)
      Soichi Ishitsuka, Mai Yamamoto, Minaho Miyamoto, Yoshitaka Kuwashiro, Akihiro Imai, Hiroyasu Motose, Taku Takahashi
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 564 Pages: 1-9

    • DOI

      10.3389/fpls.2019.00564

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  • [Journal Article] Salt hypersensitivity is associated with excessive xylem development in a thermospermine-deficient mutant of Arabidopsis thaliana2019

    • Author(s)
      Shinohara S, Okamoto T, Motose H, Takahashi T
    • Journal Title

      Plant J.

      Volume: 100 Issue: 2 Pages: 374-383

    • DOI

      10.1111/tpj.14448

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effect of thermospermine on the growth and expression of polyamine-related genes in rice seedlings2019

    • Author(s)
      Miyamoto M, Shimao S, Tong W, Motose H, Takahashi T
    • Journal Title

      Plants

      Volume: 8 Issue: 8 Pages: 296-296

    • DOI

      10.3390/plants8080269

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  • [Presentation] サーモスペルミン非感受性を示すシロイヌナズナの変異株の単離と解析2021

    • Author(s)
      高橋卓・田中貴啓・岡本崇・本瀬宏康
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会(松江)2021年3月14日
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      小山大輝・田中貴啓・高橋卓
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会(東京)2021年9月16日
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      西井裕一・高橋卓
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      日本植物学会第85回大会(東京)2021年9月16日
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  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるサーモスペルミン非感受性変異の原因遺伝子の単離2021

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      高橋卓・田中貴啓・岡本崇・本瀬宏康
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      第12回日本ポリアミン学会年会(東京)2021年12月18日
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  • [Presentation] シロイヌナズナのサーモスペルミン欠損変異に対する新奇抑圧変異の原因遺伝子同定2021

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      西井裕一・高橋卓
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      第12回日本ポリアミン学会年会(東京)2021年12月18日
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  • [Presentation] オーキシンによるサーモスペルミン合成酵素遺伝子の発現制御2020

    • Author(s)
      松尾拓俊・田中貴啓・本瀬宏康・高橋卓
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      日本ポリアミン学会第11回年会(東京)
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  • [Presentation] 植物における外的なサーモスペルミンの作用の保存性2020

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      宮本みなほ・本瀬宏康・高橋卓
    • Organizer
      日本ポリアミン学会第11回年会(東京)
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  • [Presentation] 外的なサーモスペルミンに対する植物の応答機構の解析2020

    • Author(s)
      宮本みなほ・田中貴啓・松尾拓俊・岡本崇・本瀬宏康・高橋卓
    • Organizer
      第61回日本植物生理学会年会(大阪)
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるサーモスペルミン非感受性変異体の単離と遺伝子解析2020

    • Author(s)
      田中貴啓・本瀬宏康・高橋卓
    • Organizer
      日本植物学会第84回大会(名古屋)
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるサーモスペルミン非感受性変異体の単離と解析2019

    • Author(s)
      田中貴啓・本瀬宏康・高橋卓
    • Organizer
      日本植物学会第83回大会(仙台)2019年9月16日
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      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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