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Elucidation of the mechanisms of action of the anti-rheumatic drug MTX in the inflammatory signaling pathway based on its target protein structure information

Research Project

Project/Area Number 19K07011
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 47020:Pharmaceutical analytical chemistry and physicochemistry-related
Research InstitutionAkita University

Principal Investigator

Matsumura Hirotoshi  秋田大学, 理工学研究科, 准教授 (60741824)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 面川 歩  秋田大学, 医学部附属病院, 助教 (80722066)
刈屋 佑美  秋田大学, 産学連携推進機構, 講師 (10779002)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywordsメトトレキサート / 抗リウマチ薬 / 炎症性疾患 / マクロファージ遊走阻止因子 / 中性子結晶構造解析 / X線結晶構造解析 / 分子動力学シミュレーション / 中性子構造解析 / マクロファージ遊走阻害因子 / 抗関節リウマチ薬 / X線構造解析 / タンパク質相互作用
Outline of Research at the Start

メトトレキサート (MTX)は、関節リウマチ治療のアンカードラッグとして、現在広く用いられており、その薬効は免疫抑制及び免疫調節効果に基づくと考えられているが、その作用機序の詳細は解明されていない。本研究は、MTXの作用機序を解明するために、炎症性サイトカインであるマクロファージ遊走阻害因子とその受容体タンパク質CD74複合体形成に及ぼすMTXの阻害作用を、タンパク質間相互作用解析、結晶構造解析により分子レベルで明らかにすることを目的とする。本研究により、免疫調節系におけるMTXの作用機序の理解を深め、より効果的な関節リウマチ治療のための学術的基礎知見が得られると期待できる。

Outline of Final Research Achievements

Methotrexate (MTX) is currently used as the anchor drug in the treatment of rheumatoid arthritis (RA). However, the mechanisms of action of MTX in the RA therapy are not fully understood. We have previously identified macrophage migration inhibitory factor (MIF) as a novel MTX-binding protein. MIF is a widely expressed pro-inflammatory cytokine that plays crucial roles in the regulation of inflammation. MIF signal transduction is initiated by binding to CD74 and stimulates ERK1/2 MAPK cascade, resulting in the production of various inflammatory cytokines such as TNF-a. In this study, we report effects of MTX on the formation of MIF-CD74 complex. MD simulations and MM-GBSA calculations with the MTX-MIF complex and the extracellular domain of CD74 structures showed the MTX binding decreased the stability of the MIF-CD74 complex. Neutron structure of MIF reveals two hydrogen bonding networks for the MTX binding in the MIF structure.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

関節リウマチ治療におけるMTXの作用機序の一つとして、MTXがMIF-CD74複合体の形成を阻害し、その結果、抗炎症作用を発揮する可能性を示すことができた。今後更に研究を発展させ、MTXの作用機序の理解が進めば、MTXの改良と治療効果の早期評価系の確立に貢献できると考えられる。また、中性子結晶構造解析により、水素原子を含む原子レベルでMIFの立体構造を明らかにすることができた。MIFは多くの炎症性疾患に関与することから、潜在的な治療標的となっている。本研究で得られたMIFの精微な構造情報に基づき、MIFを標的とする新規薬剤開発が可能となることから、国民の健康維持への貢献が期待できる。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2021 2020 2019 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (16 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Multiple Myeloma-Associated Ig Light Chain Crystalline Cast Nephropathy2020

    • Author(s)
      Matsumura, H., Furukawa, Y.,Nakagaki, T., Furutani, C., Osanai, S., Noguchi, K., Odaka, M., Yohda, M., Ohtani, H., Michishita, Y., Kawabata, Y., Kitabayashi, A., Ikeda, S., Nara, M., Komatsuda, A., Takahashi, N., Wakui, H.
    • Journal Title

      Kidney International Reports

      Volume: 5 Issue: 9 Pages: 1595-1602

    • DOI

      10.1016/j.ekir.2020.06.026

    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Neutron crystallography of macrophage migration inhibitory factor for antiinflammatory drug design2021

    • Author(s)
      江澤 理徳,石田 卓也,山田 貢,玉田 太郎,涌井 秀樹,尾高 雅文,松村 洋寿
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      令和3年度化学系学協会東北大会
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      江澤 理徳,石田 卓也,山田 貢,玉田 太郎,尾高 雅文,涌井 秀樹,松村 洋寿
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      宮部 真美,野口 恵一,養王田 正文,尾高 雅文,涌井 秀樹,松村 洋寿
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      江澤 理徳,石田 卓也,山田 貢,玉田 太郎,尾高 雅文,涌井 秀樹,松村 洋寿
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      第47回生体分子科学討論会
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      江澤 理徳,石田 卓也,山田 貢,玉田 太郎,涌井 秀樹,尾高 雅文,松村 洋寿
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      生物工学若手研究者の集い 第二回オンラインセミナー
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      Ezawa, T., Ishida, T., Yamada, M., Tamada, T., Wakui, H., Odaka, M., Matsumura, H.
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      2020 Research-status Report
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      Nakagaki, T., Matsumura, H., Odaka, M., Wakui, H.
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      令和2 年度化学系学協会東北大会
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      Matsumura, H., Ezawa, T., Nakagaki, T., Sugishima, K., Omokawa, A., Nagatoishi, S., Tsumoto, K., Tamada, T., Kusaka, K., Shigeta, Y., Odaka, M., Hirokawa, M., Wakui, H.
    • Organizer
      2020年度化学系学協会東北大会
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  • [Presentation] 中性子線回析によるマクロファージ遊走阻害因子の詳細構造の解明2020

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      江澤 理徳,石田 卓也,山田 貢,玉田 太郎,涌井 秀樹,尾高 雅文,松村 洋寿
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  • [Presentation] 抗リウマチ薬とMIFサイトカインファミリーD-Dopachrome tautomeraseの相互作用解析2020

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      中垣 尊,尾高 雅文,涌井 秀樹,松村 洋寿
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      第14回バイオ関連化学シンポジウム2020
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  • [Presentation] 抗リウマチ薬メトトレキサートとマクロファージ遊走阻害因子の 相互作用解析2020

    • Author(s)
      松村 洋寿,杉島 小雪,面川 歩,長門石 曉,津本 浩平,重田 育照,尾高 雅文,廣川 誠,涌井 秀樹
    • Organizer
      第14回バイオ関連化学シンポジウム2020
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] マクロファージ遊走阻害因子(MIF-1)とD-Dopachrome tautomerase(MIF-2)に対する関節リウマチ治療薬メトトレキサートの相互作用2019

    • Author(s)
      中垣 尊、出茂 鮎美、杉島 小雪、面川 歩、松村 洋寿、尾高 雅文、涌井 秀樹
    • Organizer
      第46 回生体分子科学討論会
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      2019 Research-status Report
  • [Presentation] MIFスーパーファミリータンパク質に対する抗リウマチ薬メトトレキサートの構造・機能解析2019

    • Author(s)
      中垣 尊、出茂 鮎美、杉島 小雪、面川 歩、松村 洋寿、尾高 雅文、涌井 秀樹
    • Organizer
      第71回生物工学会大会
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      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 抗リウマチ薬メトトレキサート標的タンパク質マクロファージ遊走阻害因子の中性子結晶構造解析2019

    • Author(s)
      江澤 理徳、杉島 小雪、松村 洋寿、面川 歩、尾高 雅文、廣川 誠、山田 貢、石田 卓也、玉田 太郎、涌井 秀樹
    • Organizer
      日本生物工学会北日本支部2019札幌シンポジウム
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      2019 Research-status Report
  • [Remarks] 秋田大学 大学院理工学研究科 生命科学専攻 生物分子科学研究室

    • URL

      https://www.gipc.akita-u.ac.jp/~biomolsci/

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  • [Remarks] 秋田大学 大学院理工学研究科 生命科学専攻 生物分析化学・生物構造化学研究室

    • URL

      http://www.gipc.akita-u.ac.jp/~bioanal-str-chem/index.html

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      2020 Research-status Report 2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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