ヘリコバクター・シネディの特定のクローンに存在する新規のゲノム修飾の役割解明
Project/Area Number |
19K07074
|
Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
|
Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 47030:Pharmaceutical hygiene and biochemistry-related
|
Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
Principal Investigator |
林原 絵美子 国立感染症研究所, 細菌第二部, 室長 (20349822)
|
Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2024-03-31
|
Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
|
Budget Amount *help |
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
|
Keywords | Phosphorothioate化修飾 / Helicobacter cinaedi / DNA修飾 / メチル化 / Helicobacter / Dnd遺伝子 / Restriction-Modification / Phosphorothioate DNA |
Outline of Research at the Start |
Helicobacter cinaediは菌血症や蜂窩織炎の原因菌として分離され,院内感染を起こす.申請者は,院内感染事例由来の特定のクローンにはDNAのPhosphorothioate(PT)化修飾を行うdnd遺伝子群が特異的に存在することを見出した.DNAのメチル化修飾は外来DNAから自己のDNAを守るRMシステムの一環であるだけでなく,遺伝子の発現調節を介して病原性や環境適応に寄与している.一方,PT化修飾は近年明らかになったDNA修飾であり,その役割には不明な点が多い.そこで,本研究ではH. cinaediの病原性や環境適応におけるPT化修飾の寄与を明らかにする.
|
Outline of Annual Research Achievements |
DNAのPhosphorothioate(PT)化修飾は最近近年明らかになった新規のDNA修飾であり,メチル化修飾では塩基がメチル化されるのに対し,PT化修飾ではデオキシリボースを繋ぐリン酸基の酸素が硫黄に置換される.メチル化修飾は外来DNAから自己のDNAを守るRestriction-Modification(RM)システムの一環であるだけでなく,遺伝子の発現調節を介して病原性や環境適応に寄与している.一方,PT化修飾の役割には不明な点が多い.そこで,本研究ではH. cinaediのPT化修飾が,病原性や環境適応においてどのような役割を果たしているのかに着目する. 今年度はCaco-2感染実験での評価とマウス感染実験での評価系を構築を行った。またSMRT法により同定したPT化の標的モチーフ(PT化されているのは一部のモチーフのみ)とトランスクリプトーム解析で発現変動のあった遺伝子について位置関係の解析を行った。
|
Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
評価系構築に時間を要したため。
|
Strategy for Future Research Activity |
病原性への影響の評価の結果を取りまとめ、Helicobacter属菌で初めてPT化標的部位を同定し、その役割について検討した報告として論文化する予定である。
|
Report
(4 results)
Research Products
(20 results)
-
-
-
-
[Journal Article] 2 Establishment of a reference panel of Helicobacter pylori strains for antimicrobial susceptibility testing.2022
Author(s)
Kenji Yokota, Takako Osaki, Shunji Hayashi, Shin-Ichi Yokota, Hiroaki Takeuchi, Emiko Rimbara, Hinako Ojima, Toyotaka Sato, Hideo Yonezawa, Keigo Shibayama, Kengo Tokunaga, Shigeru Kamiya, Kazunari Murakami, Mototsugu Kato, Toshiro Sugiyama
-
Journal Title
Helicobacter
Volume: Jun;27(3)
Issue: 3
Pages: 12874-12874
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
-
[Journal Article] Non-Helicobacter pylori Helicobacter (NHPH) positive gastric cancer2022
Author(s)
Yasuda Tomohiko、Lee Hyun Seok、Nam Su Youn、Katoh Hiroto、Ishibashi Yuko、Yamagata Murayama Somay、Matsui Hidenori、Masuda Hiroki、Rimbara Emiko、Sakurazawa Nobuyuki、Suzuki Hideyuki、Yoshida Hiroshi、Seto Yasuyuki、Ishikawa Shumpei、Jeon Seong Woo、Nakamura Masahiko、Nomura Sachiyo
-
Journal Title
Scientific Reports
Volume: 12
Issue: 1
Pages: 1-9
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
-
-
-
-
-
[Presentation] Characterization Of Helicobacter Suis Isolated From Human Stomach2022
Author(s)
Rimbara E, Suzuki M, H. Matsui, M. Nakamura, M. Morimoto, C. Sasakawa, H. Masuda, S. Nomura, T. Osaki, N. Nagata, K. Shibayama, K. Tokunaga
Organizer
World Microbe Forum
Related Report
Int'l Joint Research
-
-
-
[Presentation] Bacterial and genomic characteristics of non-Helicobacter pylori Helicobacter species, including Helicobacter suis2022
Author(s)
Rimbara E, Suzuki M, Tokunaga K, Mabe K, Nanjo S, Aoki S, Matsui H, Ohno K, Shibayama K, Kenri T.
Organizer
第27回日本ヘリコバクター学会学術集会
Related Report
Invited
-
[Presentation] 胃MALTリンパ腫におけるHelicobacter suis感染の関与2020
Author(s)
徳永 健吾 , 林原 絵美子 , 松井 英則 , 鈴木 仁人 , 大崎 敬子 , 井田 陽介 , 三好 佐和子 , 長濱 清隆 , 大野 亜希子 , 三好 潤 , 柴山 恵吾 , 久松 理一 , 岡本 晋
Organizer
第100回日本消化器内視鏡学会総会
Related Report
-
-
-
-
-
-