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Physiological function analysis of GOMED, a novel proteolytic degradation mechanism

Research Project

Project/Area Number 19K07382
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 49010:Pathological biochemistry-related
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

Yamaguchi HIrofumi  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助教 (50644241)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywordsオートファジー / ゴルジ体 / タンパク分解 / 神経変性 / ゴルジ / Wipi3
Outline of Research at the Start

(1) GOMEDの実行機構を明らかにする。また、(2)膵b細胞特異的にGOMED-1を欠損させた細胞やマウスを作製し、GOMEDが膵b細胞のインスリン分泌やviabilityに如何に関わっているかを解析する。(3) 神経特異的GOMED-1欠損マウスを解析する。さらに、(4) 神経細胞、膵細胞以外に、GOMEDが重要な役割を担っている細胞を同定する。

Outline of Final Research Achievements

Golgi membrane-associated degradation pathway (GOMED) is an Atg5/Atg7-independent type of autophagy that contributes to the degradation of the accumulated proteins when the transport of proteins from the Golgi to the extracellular or plasma membrane is impaired. Analysis of the GOMED-1, a molecule essential for GOMED revealed that GOMED-1 localizes from the cytoplasm to the trans-Golgi and regulates the formation of isolation membranes from trans-Golgi membranes. Furthermore, brain-specific GOMED-1-deficient mice show that abnormal accumulation of ceruloplasmin, an iron transport protein and a degradation substrate of GOMED, resulting in neurodegenerative disease-like symptoms from iron deposition. These indicate that GOMED-1 functions to maintain neuronal cells via mechanisms different from those of canonical autophagy.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

GOMEDを制御する分子GOMED-1の解析から、GOMEDの分子機構の一端を理解することができた。また、神経細胞を取り上げ、GOMEDが生体機能維持に不可欠な機能であることを示すことができた。GOMEDは分泌経路を遮断するときに誘導される機構であることを勘案すると、分泌を行っている細胞を中心に、多岐にわたる細胞で重要な役割を果たしているものと考えられる。また、糖尿病や神経変性疾患などの多くの疾患の発症に関わっている可能性が考えられる。従って、本研究は、様々な疾患の病態生理解明や疾患治療に波及効果をもたらすと期待される。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Wipi3 is essential for alternative autophagy and its loss causes neurodegeneration2020

    • Author(s)
      Yamaguchi Hirofumi、Honda Shinya、Torii Satoru、Shimizu Kimiko、Katoh Kaoru、Miyake Koichi、Miyake Noriko、Fujikake Nobuhiro、Sakurai Hajime Tajima、Arakawa Satoko、Shimizu Shigeomi
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 5311-5311

    • DOI

      10.1038/s41467-020-18892-w

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification of a phosphorylation site on Ulk1 required for genotoxic stress-induced alternative autophagy2020

    • Author(s)
      Torii Satoru、Yamaguchi Hirofumi、Nakanishi Akira、Arakawa Satoko、Honda Shinya、Moriwaki Kenta、Nakano Hiroyasu、Shimizu Shigeomi
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 1754-1754

    • DOI

      10.1038/s41467-020-15577-2

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Association Between Atg5-independent Alternative Autophagy and Neurodegenerative Diseases.2020

    • Author(s)
      Honda S, Arakawa S, Yamaguchi H, Torii S, Tajima Sakurai H, Tsujioka M, Murohashi M, Shimizu S.
    • Journal Title

      Journal of molecular biology

      Volume: 432 Issue: 8 Pages: 2622-2632

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2020.01.016

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Autophagy involvement in oncogenesis2020

    • Author(s)
      Torii Satoru、Honda Shinya、Murohashi Michiko、Yamaguchi Hirofumi、Shimizu Shigeomi
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 111 Issue: 11 Pages: 3993-3999

    • DOI

      10.1111/cas.14646

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] GOMED制御分子の機能解析2021

    • Author(s)
      山口啓史
    • Organizer
      2021年度 新学術領域「オルガネラゾーン」zoom班会議
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Wipi3 is essential for alternative autophagy and its loss causes neurodegeneration2021

    • Author(s)
      山口啓史
    • Organizer
      2019年度・2020年度難治疾患研究所発表会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Wipi3分子による新規オートファジー機構(GOMED)の制御とインスリン分泌への影響2021

    • Author(s)
      山口啓史
    • Organizer
      2021年度難治疾患研究所発表会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Wipi3 is essential for alternative autophagy and its loss causes neurodegeneration2021

    • Author(s)
      山口啓史
    • Organizer
      2019年度・2020年度難治疾患研究所研究発表会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 新規オートファジー制御分子の機能解析2020

    • Author(s)
      山口啓史、荒川聡子、清水重臣
    • Organizer
      第12回オートファジー研究会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] The membrane origin of mitophagy after enucleation in red blood cell.2020

    • Author(s)
      Satoko Arakawa, Shinya Honda, Hirofumi Yamaguchi and Shigeomi Shimizu
    • Organizer
      International Symposium for Female Researchers in Chromatin Biology (ISFRCB) 2020 (Satellite Symposium of the 43rd MBSJ), Session 2 “Scientific talks by young female researchers in epigenetics”
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] オルタナティブ・オートファジーの生理機能解析と通常型との機能分担についての解明2020

    • Author(s)
      荒川聡子・山口啓史・清水重臣
    • Organizer
      マルチモードオートファジー 第2回班会議
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 新規オートファジーを制御するAAG3の機能解析2019

    • Author(s)
      山口 啓史
    • Organizer
      第2回 オルガネラゾーン 若手の会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 新規オートファジーを制御するAAG3の機能解析2019

    • Author(s)
      山口 啓史、荒川 聡子、清水 重臣
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 新規オートファジー遺伝子欠損マウス(Aag3KO)と従来型オートファジー欠損マウス(Atg7KO)及び両オートファジー欠損マウス(Atg7/Aag3DKO)を比較した形態機能解析2019

    • Author(s)
      荒川 聡子、山口 啓史、清水 重臣
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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