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Functional analysis of CCDC26, a noncoding RNA related to myeloid leukemia, and search of a target for treatment of tumor

Research Project

Project/Area Number 19K07667
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 50010:Tumor biology-related
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

Hirano Tetsuo  広島大学, 統合生命科学研究科(総), 助教 (50228805)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 原田 浩徳  東京薬科大学, 生命科学部, 教授 (10314775)
山崎 岳  広島大学, 統合生命科学研究科(総), 教授 (30192397)
根平 達夫  広島大学, 統合生命科学研究科(総), 准教授 (60321692)
石田 敦彦  広島大学, 統合生命科学研究科(総), 教授 (90212886)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords非コードRNA / 骨髄性白血病細胞 / 遺伝子発現調節 / グロビン / ノンコーディングRNA / RNA-タンパク質相互作用 / 白血病細胞 / 分子生物学 / 細胞分化 / 赤芽球分化 / noncoding RNA / leukemia / differentiation / globin / developmental regulation / 骨髄性白血病 / ヘモグロビン
Outline of Research at the Start

CCDC26は小児骨髄性白血病においてコピー数変動の見られる遺伝子であり、また、脳腫瘍やすい臓がん、消化器がんとの関連も示されている。CCDC26遺伝子は,他の哺乳類との間で一定の保存性が見られるものの,タンパク質はコードされておらず,長鎖非コードRNA (LncRNA)の一種であると考えられる。LncRNAは通常のメッセンジャーRNAとは異なり、タンパク質に翻訳されず、RNA自身が一定の構造をとり、機能を発現する生体高分子であり、様々な生物学的機能を持っていると思われる。本研究はこの機能未知のLncRNA, CCDC26の機能を解明し、新しいがんの治療戦略に貢献しようとするものである。

Outline of Final Research Achievements

Analysis of proteins that interact with CCDC26 revealed that these were identified as Vimentin (a cytoskeletal protein), HNRNPC (splicing-related RNA-binding protein), and CBX1 (heterochromatin-associated protein). Specific binding of Vimentin and CCDC26 RNA was confirmed by RNA immunoprecipitation. In order to identify the RNA sequence required for binding, three separate regions of CCDC26 RNA were tested for their ability to bind in vitro to Vimentin protein. As a result, the region of 428-1076 base of CCDC26-RNA is found to bind to Vimentin protein.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

細胞局在の異なる複数のタンパク質と相互作用する単独で様々な機能を有する多機能lncRNAであると考えられるが、我々が知る限り、これまでにそのようなlncRNAの概念はまだ提唱されておらず、この点で大きな学術的な意義がある。また、lncRNAによるがん関連遺伝子及びグロビンタンパク質群の発現制御に関する知見は、基礎から臨床応用に至るまで、与える影響は大きい。非コードRNA CCDC26による遺伝子発現制御機構がいっそう明らかになることにより、白血病治療及び異常ヘモグロビン症の治療戦略に役立つ可能性が示された。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2021

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Long noncoding RNA CCDC26 as a modulator of transcriptional switching between fetal and embryonic globins2021

    • Author(s)
      Hirano Tetsuo、Tsuruda Tomomi、Tanaka Yuka、Harada Hironori、Yamazaki Takeshi、Ishida Atsuhiko
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research

      Volume: 1868 Issue: 3 Pages: 118931-118931

    • DOI

      10.1016/j.bbamcr.2020.118931

    • Related Report
      2022 Annual Research Report 2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Long noncoding RNA CCDC26 as a modulator of transcriptional switching between fetal and embryonic globins2021

    • Author(s)
      Tetsuo Hirano, Tomomi Tsuruda, Yuka Tanaka, Hironori Harada, Takeshi Yamazaki, Atsuhiko Ishida
    • Journal Title

      BBA - Molecular Cell Research

      Volume: 1868 Pages: 118931-118931

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 長鎖非コードRNA CCDC26の胚性、胎児性間グロビン転写切り替え調節因子としての役割2021

    • Author(s)
      平野哲男、鶴田智美、田中佑佳、原田 浩徳、山崎岳、石田敦彦
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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