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Preliminary study for deep learning of MR images to predict maps for cerebral blood flow and metabolism

Research Project

Project/Area Number 19K08239
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 52040:Radiological sciences-related
Research InstitutionAkita Cerebrospinal and Cardiovascular Center

Principal Investigator

Keisuke Matsubara  秋田県立循環器・脳脊髄センター(研究所), 放射線医学研究部, 主任研究員 (40588430)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 茨木 正信  秋田県立循環器・脳脊髄センター(研究所), 放射線医学研究部, 主任研究員 (40360359)
篠原 祐樹  秋田県立循環器・脳脊髄センター(研究所), 放射線医学研究部, 主任研究員 (60462470)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Fiscal Year 2019: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Keywords深層学習 / PET / MRI / 脳循環代謝
Outline of Research at the Start

脳卒中で損傷した脳組織が治療可能かを見極めるバイオマーカーとして,PETやMRIを用いた脳循環の評価が行われているが,撮像時間の延長や被検者への負担など困難が伴う.
本研究課題ではルーチンで撮像されるMR画像をベースとした深層学習による脳循環画像の予測・生成を試み,簡便・正確に脳循環を評価できる方法の提案を目指す.

Outline of Final Research Achievements

We attempted to predict cerebral oxygen extraction fraction (OEF) maps by deep learning model trained with MR images, and propose a simple method for cerebral blood flow and metabolism with less burden for examinee.
We failed to predict OEF maps from only MR images. However, we demonstrated that OEF maps can be predicted by deep learning with cerebral blood flow (CBF) and cerebral blood volume (CBV) maps [intraclass correlation: 0.597 +/- 0.082]. These findings suggest deep learning model trained with MR and PET images can predict OEF maps, and shorten the examination time for 15O PET study.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

OEF画像の取得は酸素15 PET検査を行うことで可能だが、撮像時間が長くなるなど被検者への負担が大きい問題があった。本研究課題によりOEF画像の取得に必要な15O-O2ガスによる撮像だけでなく、CBV画像の取得に必要な15O-COガスによる撮像も省略可能であり、本法を用いることで酸素15 PET検査の検査時間を30分程度短縮できる可能性が示された。本研究課題の成果はPETの検査における被検者への負担軽減に大きく寄与し得るものである。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] A review on AI in PET imaging2022

    • Author(s)
      Matsubara Keisuke、Ibaraki Masanobu、Nemoto Mitsutaka、Watabe Hiroshi、Kimura Yuichi
    • Journal Title

      Annals of Nuclear Medicine

      Volume: 36 Issue: 2 Pages: 133-143

    • DOI

      10.1007/s12149-021-01710-8

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Prediction of an oxygen extraction fraction map by convolutional neural network: validation of input data among MR and PET images2021

    • Author(s)
      Matsubara Keisuke、Ibaraki Masanobu、Shinohara Yuki、Takahashi Noriyuki、Toyoshima Hideto、Kinoshita Toshibumi
    • Journal Title

      International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery

      Volume: 16 Issue: 11 Pages: 1865-1874

    • DOI

      10.1007/s11548-021-02356-7

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 畳み込みニューラルネットワークによるMR及びPET画像からの酸素摂取率画像の予測2020

    • Author(s)
      松原 佳亮, 茨木 正信, 篠原 祐樹, 高橋 規之, 豊嶋 英仁, 木下 俊文
    • Organizer
      第39回日本異様画像工学会大会 (JAMIT 2020)
    • Related Report
      2020 Research-status Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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