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Development of anti- atherosclerotic drugs using deep learning- based image analysis

Research Project

Project/Area Number 19K08549
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 53020:Cardiology-related
Research InstitutionKeio University

Principal Investigator

KUSUMOTO Dai  慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 助教 (70571727)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords血管老化 / 細胞老化 / 人工知能 / 畳み込みニューラルネットワーク / 新規評価指標 / 細胞形態 / Deep-SeSMo / 血管内皮細胞 / 動脈硬化 / 薬剤スクリーニング / 深層学習 / 抗老化
Outline of Research at the Start

近年わが国でも動脈硬化を基盤とした心筋梗塞や脳梗塞への罹患率は上昇している。動脈硬化の進展において、血管内皮細胞の細胞老化が重要であることが近年数多く報告されている。本研究では、近年大発展を遂げている深層学習の技術をの用いて、細胞老化をを抑制できるような薬剤の開発を行い、動脈硬化を抑制可能な薬剤開発を目標としている。本研究の遂行により、動脈硬化のみならず、加齢関連疾患や老化などを抑制可能な薬剤開発につながる可能性もある。

Outline of Final Research Achievements

Recently, many reports showed that cellular senescence plays an important role in age-related diseases. In particular, senescence of endothelial cells involve in the pathology of organ dysfunction, and are focused as the novel therapeutic target. We developed an automated quantitative scoring system to evaluate the state of endothelial cells from cellular morphology using senescence probability output from pre-trained convolutional neural network, Deep Learning-Based Senescence Scoring System by Morphology (Deep-SeSMo). Deep-SeSMo can examine cellular senescence only using phase-contrast microscopy, without the use of molecular labels. We conducted label-free high-throughput drug screening by using Deep-SeSMo, and identified novel candidate drugs suppressing vascular senescence.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では畳み込みニューラルネットワークを用いて、細胞老化の程度を高い精度を持って定量的に評価可能であることが判明した。従来、画像解析を用いて疾患細胞を分類することは可能であったが、本研究では学習済みモデルを用いて確率分布に従って出力を行うことで、その病的中間状態に対して定量的な連続評価を可能にしたことは新規性が非常に高い。本技術は、病的細胞評価方法の基盤的技術となる可能性があり、さらなる発展が期待される。また血管老化による臓器障害は今後もさらに増加することが予想されることから、本技術を用いて血管老化抑制薬の探索が進むことが期待される。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2022 2021 2020 2019 Other

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Coupling of angiogenesis and odontogenesis orchestrates tooth mineralization in mice2022

    • Author(s)
      Matsubara T, Iga T, Sugiura Y, Kusumoto D, Sanosaka T, Tai-Nagara I, Takeda N, Fong GH, Ito K, Ema M, Okano H, Kohyama J, Suematsu M, *Kubota Y.
    • Journal Title

      J Exp Med

      Volume: 219 Issue: 4

    • DOI

      10.1084/jem.20211789

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Tumor-specific inter-endothelial adhesion mediated by FLRT2 facilitates cancer aggressiveness2022

    • Author(s)
      Ando T, Tai-Nagara I, Sugiura Y, Kusumoto D, Okabayashi K, Kido Y, Sato Kohji, Saya H, Navankasattusas S, Li DY, Suematsu M, Kitagawa Y, Seiradake E, Yamagishi S, *Kubota Y.
    • Journal Title

      J Clin Invest

      Volume: 132 Issue: 6 Pages: 153626-153626

    • DOI

      10.1172/jci153626

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Anti-senescent drug screening by deep learning-based morphology senescence scoring2021

    • Author(s)
      Kusumoto Dai、Seki Tomohisa、Sawada Hiromune、Kunitomi Akira、Katsuki Toshiomi、Kimura Mai、Ito Shogo、Komuro Jin、Hashimoto Hisayuki、Fukuda Keiichi、Yuasa Shinsuke
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 257-257

    • DOI

      10.1038/s41467-020-20213-0

    • Related Report
      2021 Annual Research Report 2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The application of convolutional neural network to stem cell biology.2019

    • Author(s)
      Kusumoto D, Yuasa S
    • Journal Title

      Inflamm Regen.

      Volume: 39 Issue: 1

    • DOI

      10.1186/s41232-019-0103-3

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Artificial Intelligence for Vascular biology2022

    • Author(s)
      楠本 大
    • Organizer
      血管生物若手研究会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Anti-senescent drug screening by deep learning-based morphology senescence scoring2020

    • Author(s)
      Dai Kusumoto, Tomohisa Seki, Hiromune Sawada, Toshiomi Katsuki, Mai Kimura, Shogo Itoh, Jin Komuro, Hisayuki Hashimoto, Keiichi Fukuda, and Shinsuke Yuasa
    • Organizer
      American Heart Association Scientific Sessions 2020
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Deep learning-based drug screening system to develop novel cardiovascular treatment2020

    • Author(s)
      Dai Kusumoto
    • Organizer
      第4回日本循環器学会基礎研究フォーラム
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 深層学習を用いた画像解析による抗血管老化薬スクリーニングと新規抗老化薬の同定2019

    • Author(s)
      楠本 大、 澤田 拓宗、関 倫久、勝木 俊臣 木村 舞、小室 仁、橋本 寿之、湯浅 慎介、福田 恵一
    • Organizer
      日本血管生物医学会学術集会.
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 深層学習を用いた画像認識システムの疾患創薬への応用.2019

    • Author(s)
      楠本 大、 湯浅 慎介、福田 恵一
    • Organizer
      日本循環制御医学会.
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Remarks] AI画像認識により細胞の老化度をスコア化、血管老化を抑制する薬剤候補同定に成功

    • URL

      https://www.keio.ac.jp/ja/press-releases/2021/1/12/28-77467/

    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] プログラム、スクリーニング方法、至適濃度の特定方法、薬剤剤造方法、モデル生成方法、情報処理方法、及び情報処理装置2022

    • Inventor(s)
      楠本 大
    • Industrial Property Rights Holder
      株式会社Heartseed社
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2022
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Overseas

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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