Discovery of novel BM and pathogenesis in COPD by trans-omics
Project/Area Number |
19K08650
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 53030:Respiratory medicine-related
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Research Institution | Osaka University |
Principal Investigator |
Takeda Yoshito 大阪大学, 大学院医学系研究科, 准教授 (40452388)
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Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2023-03-31
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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Keywords | バイオマーカー / 個別化医療 / プロテオミクス / エクソソーム / トランスオミクス / COPD / 創薬開発 / マルチオミクス / メタボローム / トランスクリプトーム / バイオインフォマティクス / 慢性炎症性呼吸器疾患 / オミクス / 呼吸器疾患 |
Outline of Research at the Start |
本研究では、当教室にて構築した疾患モデル動物と豊富な臨床検体を活用して、各種オミクス・データを取得するとともに、最新イメージング技術を用いるマルチモーダルな病態把握(フェノタイピング)に挑戦する。これらフェノタイピングデータと各種オミクスを統合解析し、複雑多様なCOPDの個別化医療を目指したBM開発だけでなく、病態解明や創薬開発に挑戦する。
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Outline of Final Research Achievements |
There is an unmet need for novel biomarkers in the diagnosis of multifactorial COPD. We applied next-generation proteomics to serum extracellular vesicles (EVs) to discover novel COPD biomarkers. This is a novel strategy not only for biomarker discovery but also for clarification of pathogenesis.
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Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
申請者は、オミクス専門家と最新テクノロジーを駆使して、難関オミクスとされるプロテオミクスを克服した。本研究では、豊富な臨床検体と独自のモデル動物を駆使して、各階層オミクスとバイオインフォマティクスチームの専門家で構成する異分野連携チームにより、個別化医療を目指した炎症性呼吸器疾患のBM開発と病態解明を目指した。 本法の妥当性が検証されたことから、今後、種々の炎症性疾患へのアプローチが可能である。さらに、血清由来エクソソームを用いたオミクスから、新規治療薬開発を示唆する知見も得られため、創薬開発のストラテジーになりうる。
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Report
(5 results)
Research Products
(48 results)
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[Journal Article] WT1 Trio Peptide-Based Cancer Vaccine for Rare Cancers Expressing Shared Target WT12023
Author(s)
Oji Y, Kagawa N, Arita H, Naka N, Hamada KI, Outani H, Shintani Y, Takeda Y, Morii E, Shimazu K, Suzuki M, Nishida S, Nakata J, Tsuboi A, Iwai M, Hayashi S, Imanishi R, Ikejima S, Kanegae M, Iwamoto M, Ikeda M, Yagi K, Shimokado H, Nakajima H, Hasegawa K, Morimoto S, Fujiki F 他
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Journal Title
Cancers
Volume: 15
Issue: 2
Pages: 393-393
DOI
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Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Multi-trait and cross-population genome-wide association studies across autoimmune and allergic diseases identify shared and distinct genetic component2022
Author(s)
Shirai Y, Nakanishi Y, Suzuki A, Konaka H, Nishikawa R, Sonehara K, Namba S, Tanaka H, Masuda T, Yaga M, Satoh S, Izumi M, Mizuno Y, Jo T, Maeda Y, Nii T, Oguro-Igashira E, Morisaki T, Kam, Nakayamada S, Nishigori C, Tanaka Y, Takeda Y, Yamamoto K, Kumanogoh A, Okada Y, The Biobank Japan Project
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Journal Title
Annals of the Rheumatic Diseases
Volume: 81
Issue: 9
Pages: 1301-1312
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] CD14 and lipopolysaccharide-binding protein as novel biomarkers for sarcoidosis by proteomics of serum extracellular vesicles.2022
Author(s)
Futami Y, Takeda Y, KobaT, Narumi R, Nojima Y, Ito M, Nakayama M, Ishida M,Yoshimura H, Naito Y, Fukushima K, Takimoto T, Edahiro R, Matsuki T, Nojima S, Hirata H, Koyama S, Iwahori K, Nagatomo I, Shirai Y, Suga Y, Satoh S, Futami S, Miyake K, Shiroyama T, Inoue Y, Adachi J, Tomonaga T, Ueda K, Kumanogoh A.
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Journal Title
International immunology
Volume: -
Issue: 6
Pages: 1-1
DOI
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[Journal Article] IL-33 Induces Sema4A Expression in Dendritic Cells and Exerts Antitumor Immunity2021
Author(s)
Suga Y, Nagatomo I, Kinehara Y, Koyama S, Okuzaki D, Osa A, Naito Y, Takamatsu H, Nishide M, Nojima S, Ito D, Tsuda T, Nakatani T, Nakanishi Y, Futami Y, Koba T, Satoh S, Hosono Y, Miyake K, Fukushima K, Shiroyama T, Iwahori K, Hirata H, Takeda Y, Kumanogoh A.
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Journal Title
The Journal of Immunology
Volume: 207
Issue: 5
Pages: 1456-1467
DOI
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Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Proteomics of serum extracellular vesicles identifies a novel COPD biomarker, fibulin-3 from elastic fibres.2021
Author(s)
Koba, Takeda, Narumi, Shiromizu, Nojima, Ito, Kuroyama, Futami, Takimoto, Matsuki, Edahiro, Nojima, Hayama, Fukushima, Hirata, Koyama, Iwahori, Nagatomo, Suzuki, Shirai, Murakami, Nakanishi, Nakatani, Suga, Miyake, Shiroyama, Kida, Sasaki, Ueda, Mizuguchi, Adachi, Tomonaga, Kumanogoh
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Journal Title
ERJ open research.
Volume: 7(1)
Issue: 1
Pages: 00658-2020
DOI
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Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Monitoring Antibody Binding to T Cells in a Pembrolizumab-Treated Patient With Lung Adenocarcinoma on Hemodialysis2019
Author(s)
Akio Osa, Takeshi Uenami, Yujiro Naito, Haruhiko Hirata, Shohei Koyama, Takayuki Takimoto, Takayuki Shiroyama, Shinji Futami, Saeko Nakatsubo, Nobuhiko Sawa, Yukihiro Yano, Izumi Nagatomo, Yoshito Takeda, Masahide Mori, Hiroshi Kida, Atsushi Kumanogoh
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Journal Title
Thorac Cancer
Volume: 11
Issue: 11
Pages: 2183-2187
DOI
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Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] A lung abscess caused by secondary syphilis - the utility of polymerase chain reaction techniques in transbronchial biopsy: a case report.2019
Author(s)
Futami S, Takimoto T, Nakagami F, Satoh S, Hamaguchi M, Kuroyama M, Miyake K, Koyama S, Iwahori K, Hirata H, Nagatomo I, Takeda Y, Kida H, Kumanogoh A.
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Journal Title
BMC Infect Dis.
Volume: 19(1):598.
Issue: 1
Pages: 598-598
DOI
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Author(s)
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第61回呼吸器学会学術講演会
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Yuko Abe, Yoshito Takeda, Hanako Yoshimura, Taro Koba, Yasuhiko Suga, Kiyoharu Fukushima, Takayuki Shiroyama, Syohei Koyama, Haruhiko Hirata, Kota Iwahori, Izumi Nagatomo, Atsushi Kumanogoh
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Organizer
ATS 2021
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