紫外線による多段階皮膚発癌における網羅的遺伝子解析
Project/Area Number |
19K08749
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 53050:Dermatology-related
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Research Institution | Kobe University |
Principal Investigator |
国定 充 神戸大学, 医学研究科, 准教授 (80566969)
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Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2023: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2020: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2019: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
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Keywords | 紫外線皮膚発がん / 多段階発がん / Xpa-ノックアウトマウス / 炎症 / 次世代シーケンサー / 全エクソーム解析 / 紫外線皮膚発癌 |
Outline of Research at the Start |
本研究計画は紫外線発癌における多段階発癌の全容について明らかにしようとするものである。マウス動物実験において慢性長期間に紫外線を照射し、その経過で時系列に採取したDNAより次世代シークエンサーを用いて全癌遺伝子および癌抑制遺伝子に対して解析を行い、どの時期でどういった遺伝子発現の上昇が認められるかを検討する。また色素性乾皮症モデルマウスのXpaノックアウトマウスを用いて同様実験を施行して野生型と比較して如何に相違があるかの検討も加える。最後にヒトの皮膚腫瘍病理組織検体においてマウスで得られた実験結果の再現があるかの検討を行う。
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Outline of Annual Research Achievements |
紫外線発がんを若年時より多発する遺伝性疾患である色素性乾皮症のモデルマウス色素性乾皮症マウス(Xpaノックアウトマウス)において、紫外線UVBを照射し、段階的に皮膚と発生した腫瘍を採取して次世代シーケンサー(NGS)で遺伝子変異を網羅的に解析する。それらを野生型マウスの結果と比較することにより、色素性乾皮症でのヌクレオチド除去修復能が機能しなくなるがん/がん抑制遺伝子に対する影響を探索し、なぜ若年で多数の皮膚発がんが生じるかのメカニズムをより深掘りして明らかにする。 それらはどの段階でがん/がん抑制遺伝子に変異が起こるのか、腫瘍での変異の蓄積の多段階での評価を行う。その中でもXpaノックアウトマウスはただの1回のUVBの照射でも発がんを生じさせることが出来る。その腫瘍の変異遺伝子を解析することにより、いわゆるドライバー遺伝子を同定することに繋がる可能性がある。おそらくドライバー遺伝子は単一ではなく、複数存在すると考えられるので、がんにおけるシグナル経路にてそれらがどういった経路でお互い結びついているのかのクロストークも検討する。 また見いだした主要なドライバー遺伝子に対してヒト患者でのすでに採取された病理組織標本にてマウスの結果と対比して整合するかの病理組織での免疫組織学的確認実験も行う。可能であれば色素性乾皮症患者で採取された皮膚がん検体を用いて遺伝子を抽出し解析を行う。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
本研究計画は計画通りに進行し、得られたデータをまとめて、成果は論文にて査読を受けて、採択されている。
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Strategy for Future Research Activity |
今後は現在あるデータのさらなる解析を進め、新たな知見等が得られた段階で学会発表等を行っていく予定である。
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Report
(4 results)
Research Products
(2 results)