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Genomic and epigenomic analysis of non-alcoholic fatty liver disease

Research Project

Project/Area Number 19K08979
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 54040:Metabolism and endocrinology-related
Research InstitutionOsaka Ohtani University

Principal Investigator

Hotta Kikuko  大阪大谷大学, 薬学部, 教授 (30360639)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords非アルコール性脂肪肝疾患 / メチル化 / ネットワーク / 内臓脂肪 / 内臓脂肪蓄積 / メタボリックシンドローム
Outline of Research at the Start

メタボリックシンドロームの肝臓での表現型とされている非アルコール性脂肪肝疾患(NAFLD)は脂肪肝から肝炎、肝硬変、肝癌まで幅広い症状を呈する疾患である。本研究ではNAFLDの発症・進展に伴う機序及び内臓脂肪蓄積との関連性を解明し治療法・予防法を開発するために以下の研究を行う。1)NAFLD肝臓のsomatic mutationの同定と遺伝子発現及びDMRとの関連性。2)NAFLDのmiRNAと肝臓での遺伝子発現との関連性。3)肝細胞と類洞細胞及び肝臓のzonationを考慮したエピゲノム解析。4)内臓脂肪蓄積に伴う門脈内miRNAやアディポネクチン量の変化とNAFLDの関連性。

Outline of Final Research Achievements

We previously reported that two differentially methylated region (DMR) networks correlated with the fibrosis stages of nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD). We examined these DMR networks in viral hepatitis and hepatocellular carcinoma (HCC). One DMR network was clearly observed in viral hepatitis and two HCC populations. Methylation levels of genes in this network were higher in viral hepatitis and lower in HCC. The other DMR network was observed in NAFLD, but not in viral hepatitis or HCC. This second network included genes involved in transcriptional regulation, cytoskeleton organization, and cellular proliferation, which are specifically related to fibrosis and/or tumorigenesis in NAFLD. We found that several genes would be candidate targets for the prevention and treatment of HCC.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

NAFLDから肝癌発症機序は不明な点が多い。NAFLDは脂肪肝から脂肪肝炎、肝硬変へと進行する。線維化が進行しているほど肝癌発症リスクが高まる。NAFLDの線維化に関連する2個のDMRネットワークを報告してきた。本研究では1つのネットワークはウイルス性肝炎や肝癌で保存されており、ネットワークに存在する遺伝子はNAFLDの線維化に伴い発症する肝癌に関連していることが示された。もう1つのネットワークはNAFLD特異的で、細胞増殖に関連する遺伝子が含まれており、NAFLDから発症する肝癌に関連していると考えられる。これらの遺伝子はNAFLDの治療や肝癌発症予防のターゲットとなることが期待される。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] Association of protein tyrosine phosphatase 1B gene polymorphism with the effects of weight reduction therapy on bodyweight and glycolipid profiles in obese patients2021

    • Author(s)
      Yamakage Hajime、Konishi Yousuke、Muranaka Kazuya、Hotta Kikuko、Miyamoto Yoshihiro、Morisaki Hiroko、Morisaki Takayuki、Satoh‐Asahara Noriko
    • Journal Title

      Journal of Diabetes Investigation

      Volume: - Issue: 8 Pages: 1462-1470

    • DOI

      10.1111/jdi.13492

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Novel mutation identified in Leber congenital amaurosis - a case report2020

    • Author(s)
      Sato Shigeru、Morimoto Takeshi、Tanaka Sayaka、Hotta Kikuko、Fujikado Takashi、Tsujikawa Motokazu、Nishida Kohji
    • Journal Title

      BMC Ophthalmology

      Volume: 20 Issue: 1 Pages: 313-313

    • DOI

      10.1186/s12886-020-01577-9

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Eleven-year follow-up of a Japanese retinitis pigmentosa patient with an HK1 gene mutation.2019

    • Author(s)
      Sato S, Morimoto T, Hotta K, Fujikado T, Nishida K
    • Journal Title

      Ophthalmic Genet.

      Volume: 40 Issue: 5 Pages: 466-469

    • DOI

      10.1080/13816810.2019.1678179

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 非アルコール性脂肪肝疾患、C型肝炎、肝臓癌でのメチル化レベルの比較2022

    • Author(s)
      堀田紀久子
    • Organizer
      第42回日本肥満学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 非アルコール性脂肪肝疾患と肝臓癌でのメチル化解析2021

    • Author(s)
      堀田紀久子
    • Organizer
      日本肥満学会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] PTP1B遺伝子多型は日本人のBMI及び減量治療抵抗性に関連する2021

    • Author(s)
      浅原哲子、山蔭一、小西陽介、村中和哉、堀田紀久子、宮本恵宏、森崎裕子、森崎隆幸
    • Organizer
      日本肥満学会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 非アルコール性脂肪肝疾患におけるdifferentially methylated regions(DMRs)のネットワーク解析2019

    • Author(s)
      堀田紀久子, 北本綾, 北本卓也, 小川祐二, 本多靖, 結束貴臣, 米田正人, 今城健人, 留野渉, 斉藤聡, 中島淳
    • Organizer
      第40回日本肥満学会学術集会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] CDH13遺伝子の多型は血中アディポネクチン、内臓脂肪と独立してメタボリックシンドロームに関連している2019

    • Author(s)
      北本綾、北本卓也、内田千晴、堀田紀久子
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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