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Establishment of prediction of lymph node metastasis by constructing a genetic algorithm in oral squamous cell carcinoma.

Research Project

Project/Area Number 19K10312
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 57060:Surgical dentistry-related
Research InstitutionEhime University

Principal Investigator

Goda Hiroyuki  愛媛大学, 医学部附属病院, 講師 (00464371)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords口腔癌 / 頸部リンパ節転移 / 遺伝子診断 / リンパ節転移
Outline of Research at the Start

口腔扁平上皮癌における最も重要な予後因子はリンパ節転移の有無である。本研究では、原発組織(生検組織)または、血清の網羅的遺伝子解析(マイクロアレイ解析)結果を用いたリンパ節転移診断アルゴリズムを構築し、cN0 症例のなかで、頚部リンパ節転移の可能性が高い症例のみを抽出する、リンパ節転移診断遺伝子アルゴリズムを構築することが目的である。本研究は、アルゴリズムの構築による cN0 症例における治療成績の向上、過剰医療や不足医療による医療費の削減、標準治療の確立という EBM に基づいた cN0 症例の治療方針へのパラダイムシフトにつなげることを最終目標としている。

Outline of Final Research Achievements

The most important prognostic factor in oral squamous cell carcinoma is the presence of lymph node metastasis. In this study, we investigated the possibility of predicting lymph node metastasis by machine learning based on gene expression profiles of primary tissues. Total RNA was extracted from primary tumors of primary cases of oral squamous cell carcinoma, and after comprehensive gene expression analysis using microarrays, a lymph node metastasis prediction model was constructed using a support vector machine (SVM). The accuracy of the model was evaluated as follows: sensitivity 60%, specificity 100%, and accuracy 80%. The results suggest that machine learning using gene expression profiles of primary tumors may be useful for predicting cervical lymph node metastasis in oral squamous cell carcinoma.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究の目的は、原発組織(生検組織)または血清の網羅的遺伝子解析から頸部郭清術の真の適応症例のみ抽出する遺伝子アルゴリズムを構築することである。厳正な適格症例の選択基準が遺伝子解析によって行われ、センチネルリンパ節生検の手法による適切な郭清領域に対する治療が行われれば、治療成績の向上、過剰医療や不足医療による医療費の削減が見込まれ、標準治療の確立という EBM に基づいた cN0 症例の治療方針へのパラダイムシフトにつなげることができると考えられる。また、他領域への適応等による医療界全体への波及効果をも期待できる研究と考えられる。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2020 2019

All Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Presentation] 口腔癌 N0 症例の治療戦略2020

    • Author(s)
      合田啓之、中城公一、日野聡史、栗林伸行、徳善紀彦、内田大亮
    • Organizer
      第 22 回 SNNS 研究会学術集会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Sentinel lymph node biopsy with RI method for clinically N0 oral squanous cell carcinoma2020

    • Author(s)
      Hiroyuki Goda, Koh-ichi Nakashiro, Norihiko Tokuzen, Nobuyuki Kuribayashi, Satoshi Hino, Daisuke Uchida
    • Organizer
      The 58th Annual Meeting of Japan Society of Clinical Oncology
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 早期舌扁平上皮癌の遺伝子発現に基づいた機械学習によるリンパ節転移予測2019

    • Author(s)
      合田啓之、中城公一、徳善紀彦、栗林伸行、内田大亮
    • Organizer
      第 64 回公益社団法人日本口腔外科学会総会・学術大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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