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Diversity of acetylation signaling and epigenetic regulation for radiation dose rate effects.

Research Project

Project/Area Number 19K12321
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 63020:Radiation influence-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Ikura Masae  京都大学, 生命科学研究科, 研究員 (40535275)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywords線量率効果 / アセチル化シグナル / 多様性 / エピジェネティクス / TRRAP
Outline of Research at the Start

放射線の生物学的効果で、同一の吸収線量であるのに、その線量率の違いで生物学的効果が大きく異なる、線量率効果が知られているが、その違いを生み出す分子基盤については、未だ不明な点が多い。最近では、損傷応答シグナルの活性化におけるクロマチン制御の重要性が数多く報告されるようになった。このような状況下で、今回、我々は、クロマチン構成タンパク質であるヒストンH2AXのアセチル化が、ゲノムストレス応答のマーカーである同じくH2AXのリン酸化に対して、線量率の違いで、異なった関わり方をすることを見出した。本課題では、このH2AXのアセチル化に着目し、線量率効果の分子基盤を解き明かす。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we have shown that acetylation of H2AX is primarily important in response to low-dose-rate genomic stress, while phosphorylation of H2AX is crucial for both low-dose-rate and high-dose-rate genomic stress. In the present study, we found that acetylation of H2AX defines the differential role of H2AX phosphorylation at low and high dose rates. TRRAP, which is the component of TIP60 histone acetylase complex, leads DNA-PKcs to acetylation of H2AX and promotes homologous recombination repair (HR) in low-dose-rate DNA damage. On the other hand, at high dose rate DNA damage, DNA-PKcs is involved in the phosphorylation of H2AX independently of TRRAP, and promotes non-homologous end joining repair (NHEJ).

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

同一の吸収線量であるのに、その線量率の違いで生物学的効果が大きく異なる線量率効果に着目して研究を進めてきた。今回、H2AXのリン酸化の低線量率および高線量率の役割の違いをH2AXのアセチル化が規定していることが、TIP60複合体の構成因子であるTRRAPに着目することで、明らかにした。生物が、多様で複合的なストレスに対応している様が、次第に明らかになりつつあり、エピジェネティクス制御の担い手であるヒストンの化学修飾の分子機構について検討することは、次世代への影響や多様な個々の放射線応答も明らかにすることに繋がることから、学術的、社会的に意義があると考える。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2023 2022 2021 2020 2019 Other

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (12 results) (of which Invited: 4 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Machine learning extracts oncogenic‐specific γ‐H2AX foci formation pattern upon genotoxic stress2023

    • Author(s)
      Furuya Kanji、Ikura Masae、Ikura Tsuyoshi
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 28 Issue: 3 Pages: 237-243

    • DOI

      10.1111/gtc.13005

    • Related Report
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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Impact of Nuclear De Novo NAD Synthesis via Histone Dynamics on DNA Repair during Cellular Senescence To Prevent Tumorigenesis2022

    • Author(s)
      Ikura Masae、Furuya Kanji、Matsuda Tomonari、Ikura Tsuyoshi
    • Journal Title

      Molecular and Cellular Biology

      Volume: 42 Issue: 11 Pages: 1-16

    • DOI

      10.1128/mcb.00379-22

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional impacts of the ubiquitin-proteasome system on DNA damage recognition in global genome nucleotide excision repair2020

    • Author(s)
      Sakai W, Yuasa-Sunagawa M, Kusakabe M, Kishimoto A, Matsui T, Kaneko Y, Akagi JI, Huyghe N, Ikura M, Ikura T, Hanaoka F, Yokoi M, Sugasawa K.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10(1) Issue: 1 Pages: 19704-19704

    • DOI

      10.1038/s41598-020-76898-2

    • NAID

      120006940230

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Epigenetic interplays between DNA demethylation and histone methylation for protecting oncogenesis2019

    • Author(s)
      Furuya Kanji、Ikura Masae、Ikura Tsuyoshi
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 165 Issue: 4 Pages: 297-299

    • DOI

      10.1093/jb/mvy124

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      古谷 寛治, 井倉 正枝、井倉 毅
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      井倉 毅、古谷寛治、白木琢磨、井倉正枝
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      古谷寛治、井倉正枝、井倉毅
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      第42回日本分子生物学会
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      古谷寛治、井倉正枝、井倉毅
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      第42回日本分子生物学会
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    • URL

      https://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research-news/2023-01-12-3

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  • [Remarks] ゲノムストレス応答におけるNAD代謝変動

    • URL

      https://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research-news/2022-10-25

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Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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