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Development of novel antimicrobial drugs targeting pathogen effectors

Research Project

Project/Area Number 19K15750
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 38030:Applied biochemistry-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Nishide Akira  京都大学, 医学研究科, 特定研究員 (80807652)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsユビキチン / エフェクター / 病原細菌 / 抗菌薬 / 細菌感染
Outline of Research at the Start

ユビキチン修飾系は、標的のタンパク質へユビキチンを付加することで、免疫応答を初めとした細胞内の様々な生命現象の制御に関与している。病原細菌が感染時に宿主細胞へと分泌するタンパク質 X は、ユビキチンを付加するユビキチンリガーゼ活性を持ち、宿主のタンパク質へユビキチンを修飾し、分解経路へ導くことで、宿主の防御応答を抑え、病原細菌の感染を促進する。
本研究では、タンパク質 X と候補化合物の結合親和性や阻害活性の評価および、X線結晶構造解析を行うことで、タンパク質 X を分子標的とした新規抗菌薬の創出を行う。

Outline of Final Research Achievements

Pathogens secrete protein X, are ubiquitin ligase into host cells during infection. Protein X induce host proteins to proteasomal degradation and disrupt host cell immune response. The goal is discover protein X inhibitor as the novel antimicrobial drugs by evaluating the inhibition activity of candidates that bind to protein X.
As the results of in vitro inhibition assay, we confirmed protein X inhibition in two compounds of more than 200 candidates. Furthermore, we observed that one of two compounds inhibited protein X by measuring the inhibition activities in culture cells. In addition, we establish compound quantitative evaluating method with using that cells. Identified compound is required further evaluation and optimization, but has potential to become a new antimicrobial drug.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

近年、続々と出現する耐性菌は抗菌薬に耐性をもち、さらに類似の構造や作用機構の抗菌薬に対しても耐性を持つ。その一方で、既存の抗菌薬の作用機構は大きくわけて4種のみで遠くない未来、あらゆる抗菌薬の効かない耐性菌の出現が危ぶまれている。こういった背景から、新規の作用機構を持つ抗菌薬の開発が強く求められている。
本研究の結果、候補化合物の中から細胞内外で標的であるタンパク質Xのユビキチンリガーゼ活性を阻害する化合物を見出した。病原性細菌が分泌するタンパク質を標的にした薬剤はこれまでに存在せず、今後、見出した化合物についてさらなる評価・最適化を行うことで、新規抗菌薬となることが期待される。

Report

(3 results)
  • 2021 Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (1 results)

All 2020

All Journal Article (1 results)

  • [Journal Article] Hijacking of the host ubiquitin system by pathogenic bacteria2020

    • Author(s)
      西出 旭、KIM MINSOO
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 92 Issue: 1 Pages: 75-83

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2020.920075

    • ISSN
      0037-1017
    • Year and Date
      2020-02-25
    • Related Report
      2019 Research-status Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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