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Mechanism of quinolone formation by hemocyanin-like enzyme cyclopenase

Research Project

Project/Area Number 19K15757
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 38040:Bioorganic chemistry-related
Research InstitutionUniversity of Shizuoka

Principal Investigator

Kishimoto Shinji  静岡県立大学, 薬学部, 助教 (40814330)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords酵素反応 / ヘム / 新規化合物 / 糸状菌二次代謝 / 基質選択性 / シクロペナーゼ / 反応機構
Outline of Research at the Start

シクロペナーゼはヘモシアニンという酸素運搬タンパク質に類似したアミノ酸配列を有していながら化合物の骨格変換を担っている酵素である。シクロペナーゼはなぜ類似タンパク質と全く異なる機能を有するようになったのか。その原因を解明するのが本研究の目的である。これまでの研究で、ヘモシアニンには存在しないヘム結合ドメインが何らかの形でシクロペナーゼの機能に関わっていることが示唆されている。そこで、変異体酵素のⅩ線結晶構造解析など基質とタンパク質の相互作用を調べる方法や速度論的な解析を軸にしてシクロペナーゼ中でヘム結合ドメインの果たしている役割を解明する。

Outline of Final Research Achievements

We recently reported that hemocyanine-like enzyme cyclopenase converts cyclopenin to viridicatin. Why does cyclopenase show such activity? One reason is the difference of metal ion in active sites and another one is the heme-binding domain present only in cyclopenase. In this work, we tried to elucidate the role of heme-binding domain in cyclopenase.
Reducing the content of heme in cyclopenase AsqI clearly decreased the reaction rate but not the affinity to substrate, suggesting that heme-binding domain is not related to substrate binding. Mutation at either metal-binding domain or heme-binding domain abolished enzyme activity, however, mixture of both mutants converted cyclopenin to viridicatin. Cyclopenase from Aspergillus lentulus showed enzymatic activity despite mutation at heme-binding domain. These findings indicated that heme-binding domain is involved in regulation of cyclopenase.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では酸素運搬タンパク質とシクロペナーゼの違いの一つであるヘム結合ドメインがどのようにして機能しているかを明らかにするべく実験を行った。本研究期間では完全な解明には至っていないが研究を突き詰めて酵素活性の違いを生む要因を明らかにすることで、タンパク質に新しい機能を与えるための知見が得られる。これにより、将来的に望みの活性を有する新規酵素を創出できるようになると期待できる。

Report

(3 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report

Research Products

(7 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] Structural and Functional Analyses of a Spiro-Carbon-Forming, Highly Promiscuous Epoxidase from Fungal Natural Product Biosynthesis2020

    • Author(s)
      Matsushita Takuma、Kishimoto Shinji、Hara Kodai、Hashimoto Hiroshi、Watanabe Kenji
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 59 Pages: 4787-4792

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.0c00896

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Functional and Structural Analyses of trans C-Methyltransferase in Fungal Polyketide Biosynthesis2019

    • Author(s)
      Kishimoto Shinji、Tsunematsu Yuta、Matsushita Takuma、Hara Kodai、Hashimoto Hiroshi、Tang Yi、Watanabe Kenji
    • Journal Title

      Biochemistry,

      Volume: 58 Pages: 3933-3937

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.9b00702

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 特異な骨格を有する糸状菌由来天然物fumimycinの生合成研究2021

    • Author(s)
      南 歩実、岸本 真治、渡辺 賢二
    • Organizer
      日本薬学会第141年会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 糸状菌Aspergillus lentulus由来新規化合物lentopeptin類の単離・構造決定および生合成2021

    • Author(s)
      松原 有也、岸本 真治、渡辺 賢二
    • Organizer
      日本薬学会第141年会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 特異な骨格を有する糸状菌由来天然物fumimycinの生合成研究2021

    • Author(s)
      南 歩実、岸本 真治、渡辺 賢二
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 糸状菌Aspergillus lentulus由来新規化合物lentopeptin類の単離・構造決定および生合成2021

    • Author(s)
      松原 有也、岸本 真治、渡辺 賢二
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Fumagillin生合成酵素Fma-P450の触媒する多段階酸化反応2020

    • Author(s)
      蜂矢志保美、岸本真治、渡辺賢二
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2022-01-27  

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