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In vivo genomic engineering with a novel genome editing tools

Research Project

Project/Area Number 19K16025
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 42040:Laboratory animal science-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Yoshimi Kazuto  東京大学, 医科学研究所, 講師 (50709813)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
KeywordsCRISPR-Cas3 / ゲノム編集 / 受精卵 / マウス / ノックアウト / ラット / All-in-oneプラスミド / 新規ゲノム編集ツール
Outline of Research at the Start

CRISPR/Cas9の発展により遺伝子改変動物が簡単に作製できるようになった一方、オフターゲットの影響やモザイク個体の作出などの技術的問題や知的財産の問題点がある。
最近、我々は新規ゲノム編集ツールType I-E CRISPR/Cas3システムを開発し、ヒト培養細胞の標的配列に変異を導入できることを発見した。
本研究課題では、改良型のCRISPR/Cas3を作製し、マウス・ラットの受精卵および生体組織で変異導入効率を検討することで、生体におけるType I-E CRISPR/Cas3の変異パターンの解明とゲノム編集ツールとしての有用性を証明する。

Outline of Final Research Achievements

We have previously reported that the Type I-E CRISPR-Cas3 system can induce a large deletion in human genome. In this research project, we examined the knockout efficiency in fertilized eggs of mice and rats as well as human cells and also investigated several modification of this system to improve its usefulness as an in vivo genome editing tool.
We succeeded in the production of Cas3 and Cascade protein complex and found that it showed higher genome editing efficiency than plasmids. We also succeeded in generating knockout mice using CRISPR-Cas3 and demonstrated its usefulness as a genome editing tool in vivo.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

In vivoにおける自由自在なゲノム改変技術は、ライフサイエンス研究に欠かすことのできない技術になりつつある一方、オフターゲットの影響、モザイク個体、配列特異性といった技術的問題に加えて、アメリカ主導で開発されたことによる知的財産の問題点が挙げられる。本研究で日本発ゲノム編集ツールのin vivoにおける有用性を示すことができ、新規疾患モデル動物の開発のみならず、ヒト疾患への応用に向けたゲノム編集治療戦略に大きく貢献できることが期待される。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (34 results)

All 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (17 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 5 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 6 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (5 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Study of the CRISPR/Cas3 System for Xenotransplantation2022

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      Miyagawa S, Watanabe M, Nagashima H, Sato K, Kogata S, Toyama C, Masahata K, Kamiyama M, Yamamoto R, Eguchi H, Maeda A, Yoshimi K, Mashimo T, Okuyama H.
    • Journal Title

      Transplant Proc

      Volume: 54 Issue: 2 Pages: 522-524

    • DOI

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      Volume: 25 Issue: 2 Pages: 103830-103830

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.103830

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    • Journal Title

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      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 1973835-1973835

    • DOI

      10.1080/19490976.2021.1973835

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      bioRxiv

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    • Publisher
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      真下知士、吉見一人、渋村里美
    • Industrial Property Rights Holder
      真下知士、吉見一人、渋村里美
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      特許
    • Industrial Property Number
      2020-010216
    • Filing Date
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    • Inventor(s)
      真下知士、吉見一人、他5名
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      真下知士、吉見一人、他5名
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2019-072782
    • Filing Date
      2019
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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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