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Molecular mechanisms of DNA strand exchange reaction driven by eukaryotic RecA family recombinases

Research Project

Project/Area Number 19K16039
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 43010:Molecular biology-related
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

Ito Kentaro  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 特任助教 (60837128)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords相同組換え / Rad51 / DNA鎖交換反応 / RecAファミリーリコンビナーゼ / DNA鎖交換 / Homologous Recombination / Dmc1
Outline of Research at the Start

相同組換えはゲノムの維持と遺伝的多様性の創出に必須な機構で、全ての生物種で保存された重要な生命機能である。DNA鎖交換は相同組換えの中心的な反応であり、進化的に保存されたRecAファミリーリコンビナーゼによって触媒される。しかし、リコンビナーゼによる相同DNA配列認識と鎖交換の反応分子機構は依然として不明である。本研究では、DNA鎖交換反応をリアルタイムで観察する系を用いて、2種類の分裂酵母リコンビナーゼ(Rad51とDmc1)を比較解析することで、この反応の根幹であるヘテロ二重鎖形成の分子機構と真核生物で広く保存されている2種類のリコンビナーゼの本質的な違いの解明を目指す。

Outline of Final Research Achievements

Homologous recombination is a biological mechanism that is essential for the maintenance of genetic information and is conserved in all species. DNA strand exchange reaction catalyzed by RecA family recombinases is a central step of homologous recombination. However, it has been unclear how homologous DNA sequences are recognized and how DNA strands are exchanged by recombinases. In this study, to clarify the molecular mechanism of this reaction, we generated many mutants of Rad51, a eukaryotic RecA family recombinase, and analyzed DNA strand exchange reaction in real-time.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

相同組換えの機能不全は発ガンや不妊の原因になり、近年ではゲノム編集の際にも重要な役割を果たしていると考えられている。特にRad51リコンビナーゼは乳ガンの原因遺伝子であるBRCA2と直接相互作用しており、ガンのマーカーや抗ガン剤の標的として注目されている。本研究によって明らかになったRad51リコンビナーゼによるDNA鎖交換反応の分子機構は、発ガンのメカニズムの理解に貢献することが期待される。また、この研究で新たに構築したリコンビナーゼの酵素活性をリアルタイムで定量的に解析する手法は抗ガン剤の評価にも有用であると考えられる。

Report

(3 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2021 2020

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] A conserved Ctp1/CtIP C-terminal peptide stimulates Mre11 endonuclease activity2021

    • Author(s)
      Zdravkovic Aleksandar、Daley James M.、Dutta Arijit、Niwa Tatsuya、Murayama Yasuto、Kanamaru Shuji、Ito Kentaro、Maki Takahisa、Argunhan Bilge、Takahashi Masayuki、Tsubouchi Hideo、Sung Patrick、Iwasaki Hiroshi
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 118 Issue: 11 Pages: 1-7

    • DOI

      10.1073/pnas.2016287118

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Real-time tracking reveals catalytic roles for the two DNA binding sites of Rad512020

    • Author(s)
      Ito Kentaro、Murayama Yasuto、Kurokawa Yumiko、Kanamaru Shuji、Kokabu Yuichi、Maki Takahisa、Mikawa Tsutomu、Argunhan Bilge、Tsubouchi Hideo、Ikeguchi Mitsunori、Takahashi Masayuki、Iwasaki Hiroshi
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 1-17

    • DOI

      10.1038/s41467-020-16750-3

    • NAID

      120007117439

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Cooperative interactions facilitate stimulation of Rad51 by the Swi5-Sfr1 auxiliary factor complex.2020

    • Author(s)
      Argunhan B, Sakakura M, Afshar N, Kurihara M, Ito K, Maki T, Kanamaru S, Murayama Y, Tsubouchi H, Takahashi M, Takahashi H, Iwasaki H.
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 9

    • DOI

      10.7554/elife.52566

    • NAID

      120007117502

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Real-time tracking reveals catalytic roles for the two DNA binding sites of Rad512020

    • Author(s)
      Kentaro Ito, Yasuto Murayama, Yumiko Kurokawa, Shuji Kanamaru, Yuichi Kokabu, Takahisa Maki, Tsutomu Mikawa, Bilge Argunhan, Hideo Tsubouchi, Mitsunori Ikeguchi, Masayuki Takahashi, Hiroshi Iwasaki
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: -

    • NAID

      120007117439

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 分裂酵母Rad51によるDNA三本鎖中間体からヘテロ二重鎖DNA形成機構の酵素学的解析2020

    • Author(s)
      伊藤健太郎
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2022-01-27  

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