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Conformational dynamics of Ras using by SACLA and NMR for the development of anti-cancer drugs

Research Project

Project/Area Number 19K16055
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 43020:Structural biochemistry-related
Research InstitutionKobe University

Principal Investigator

Makino Yoshiteru  神戸大学, 医学研究科, 特命助教 (80822337)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
KeywordsNMR / Ras蛋白質 / SACLA/SPring-8 / 創薬科学 / 構造生命科学 / 構造生物学
Outline of Research at the Start

本研究では、光制御可能なcaged-GTPを活用することで、がん遺伝子産物Ras蛋白質のGTP加水分解反応過程に伴う動的構造変化を、NMR分光法、X線自由電子レーザー施設SACLA、並びに大型放射光施設Spring-8を駆使して補足し、可視化することを目的としている。当該研究で期待される成果は未だ成功例のないRas蛋白質を標的とした新規抗がん剤の開発に資する構造生物学的知見を与える。

Outline of Final Research Achievements

Small GTPases Ras function as a molecular switch which regulates intracellular signal transduction, including cell proliferation, differentiation, and apoptosis, through the GTP hydrolysis process. In this study, in order to obtain basic knowledge for the development of novel anti-cancer drugs targeting Ras, we performed structural dynamics analysis of Ras in the GTP hydrolysis process by SACLA, SPring-8 and nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy using photo-controllable caged-GTP. As a result, we found that the unique structural dynamics of Ras may be controlling the GTP hydrolysis mechanism.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

Rasはがん全体の約30%で常時活性化しており、がん治療薬の標的分子である。そのため、本研究で得られた機能―構造相関の結果は新たな創薬基盤情報となり得る。さらに、RasのGTP加水分解反応は酵素触媒反応のひとつであり、その作用メカニズムを結晶構造解析のみならず溶液、固体NMRを融合して解明した試みは、他の低分子量G蛋白質等の作用メカニズムの解明へと波及することが期待される。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2021 2020 2019

All Presentation (6 results)

  • [Presentation] 低分子量G蛋白質RasのGTP加水分反応過程におけるヌクレオチド近傍の構造変化2021

    • Author(s)
      佐伯茉帆, 槇野義輝, 河村高志, 南後恵理子, 熊坂崇, 島扶美
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会 2021年11月5日
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 光反応性基質を利用したがん遺伝子産物Rasの酵素触媒反応の可視化2021

    • Author(s)
      島扶美, 槇野義輝, 南後恵理子, 熊坂崇
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会 2021年11月5日
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] SACLA/SPring-8/NMRを用いたRasのアロステリック構造変化の解明2021

    • Author(s)
      槇野義輝, 島扶美
    • Organizer
      第5回徳島大学統合的がん創薬研究クラスター・合同オンラインミーティング 2022年3月8日
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Analysis of conformational dynamics of small G-protein Ras on GTP hydrolysis process by SACLA.2020

    • Author(s)
      Maho Saeki, Yoshiteru Makino, Shigeyuki Matsumoto, Takashi Kawamura, Eriko Nango, Takashi Kumasaka and Fumi Shima.
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会.
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 微小結晶を利用したRas caged-GTP時分割測定の試み2020

    • Author(s)
      河村高志,槇野義輝*,長谷川和也,中根崇智,馬場清喜,南後恵理子,田中里枝,岩田想,島扶美*,熊坂崇
    • Organizer
      第33回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Caged-GTPを用いたがん遺伝子産物RasのSACLA、Spring-8、NMRによるGTP加水分解過程の構造変化の解明2019

    • Author(s)
      槇野義輝*、河村高志、松本篤幸、南後恵理子、岩田想、熊坂崇、島扶美*
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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