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Development of novel exosomal glyco-biomarker with glycogenomics

Research Project

Project/Area Number 19K16078
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 43030:Functional biochemistry-related
Research InstitutionKeio University

Principal Investigator

松田 厚志  慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 助教 (30722590)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2020-03-31
Project Status Discontinued (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords糖鎖 / エクソソーム / 定量解析 / バイオマーカー / リキッドバイオプシー / レクチンマイクロアレイ
Outline of Research at the Start

本申請ではレクチンマイクロアレイによる血中エクソソームの高感度比較糖鎖プロファイリング法を確立し、疾患特異的なエクソソーム表層異常糖鎖を検出・同定する。また、糖鎖・プロテオーム・遺伝子検出を組み合わせた包括的グライコゲノミクスアプローチにより、疾患特異的エクソソーム 糖鎖の生物学的機能の解明と革新的エクソソーム診断モデルを構築する。

Outline of Annual Research Achievements

エクソソームは癌を含む様々な細胞から放出される細胞外小胞の一つで、タンパク質やDNAを含んでいることからリキッドバイオプシーの新たな標的とされている。タンパク質翻訳後修飾の一つである糖鎖もエクソソーム最外殻を覆っておりその標的とされるが機能を含めた全貌は未だ明らかとされていない。医療応用ツールとしてエクソソームを活用するには、糖タンパク質・ゲノムをはじめ包括的に理解する必要がある。また、エクソソームには様々な亜型が存在し、多様な機能を構成する。これらを理解するためにはマルチオミクス解析によるアプローチが有効であると考えられる。従って本研究課題は、疾患特異的糖鎖をもつエクソソームを同定し、ゲノム解析とのマルチオミクス解析からより詳細な解析を目的とする。
まず、エクソソーム表層糖鎖解析のため、レクチンマイクロアレイを用いたエクソソーム表層比較糖鎖プロファイリング法を確立した。膵臓癌培養細胞を用いて、培養上清中分泌糖タンパク質、エクソソーム、細胞ライセートを比較したところ、各細胞株はエクソソーム固有の糖鎖を持つことが示された。更にエクソソームサブポピュレーションにおける比較糖鎖解析法も確立した。本法の確立により、これらエクソソームは各エクソソームマーカー (CD9, CD63, CD81) に応じて、その糖鎖構造も異なることが示された。

Report

(1 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2020 2019

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Comparative Glycomic Analysis of Exosome Subpopulations Derived from Pancreatic Cancer Cell Lines2020

    • Author(s)
      Matsuda Atsushi、Kuno Atsushi、Yoshida Maki、Wagatsuma Takanori、Sato Takashi、Miyagishi Makoto、Zhao Jing、Suematsu Makoto、Kabe Yasuaki、Narimatsu Hisashi
    • Journal Title

      Journal of Proteome Research

      Volume: 19 Issue: 6 Pages: 2516-2524

    • DOI

      10.1021/acs.jproteome.0c00200

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Discovery of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma-Related Aberrant Glycosylations: A Multilateral Approach of Lectin Microarray-Based Tissue Glycomic Profiling With Public Transcriptomic Datasets2020

    • Author(s)
      Wagatsuma Takanori、Nagai-Okatani Chiaki、Matsuda Atsushi、Masugi Yohei、Imaoka Masako、Yamazaki Ken、Sakamoto Michiie、Kuno Atsushi
    • Journal Title

      Frontiers in Oncology

      Volume: 10 Pages: 388-388

    • DOI

      10.3389/fonc.2020.00338

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Lectin Bead Array in a Single Tip Facilitates Fully Automatic Glycoprotein Profiling2019

    • Author(s)
      Shimazaki Hiroko、Saito Kozue、Matsuda Atsushi、Sawakami Kazumi、Kariya Minoru、Segawa Osamu、Miyashita Yukiko、Ueda Tetsuya、Koizuka Michinori、Nakamura Kazuhiro、Kaji Hiroyuki、Tajima Hideji、Kuno Atsushi
    • Journal Title

      Analytical Chemistry

      Volume: 91 Issue: 17 Pages: 11162-11169

    • DOI

      10.1021/acs.analchem.9b01876

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Comparative glycome analysis between exosomes, cell surface, and secreted glycoproteins with lectin microarray2019

    • Author(s)
      Atsushi Matsuda, Maki Yoshida, Tomomi Nakagawa, Takanori Wagatsuma, Makoto Suematsu, Hisashi Narimatsu, Yasuaki Kabe, Atsushi Kuno
    • Organizer
      The Human Proteome Organization 2019 World Congress
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2021-01-27  

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