Development of functional oligonucleotides by utilizing the reactivity of 5-trifluoromethyl pyrimidine bases
| Project/Area Number |
19K16330
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 47010:Pharmaceutical chemistry and drug development sciences-related
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| Research Institution | Tokushima Bunri University |
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Principal Investigator |
Ito Yuta 徳島文理大学, 薬学部, 助教 (90783225)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2021-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2020)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
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| Keywords | 5-トリフルオロメチルピリミジン / オリゴ核酸合成後修飾法 / 5-モノフルオロメチルウラシル / 5-ジフルオロメチルウラシル / 5-トリフルオロメチルピリミジン塩基 / 三重鎖形成核酸 / オリゴ核酸 / 三重鎖核酸 / デコイ核酸 |
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| Outline of Research at the Start |
トリフルオロメチル基を有するピリミジン塩基を導入した人工オリゴ核酸の新たな機能を開拓すべく、トリフルオロメチル基変換反応を駆動力とする三重鎖核酸形成法の開発やDNA結合タンパク質を捕捉するおとり(デコイ)核酸の創出を行う。本研究にて開発される手法は、トリフルオロメチル基の特異な反応性を利用して遺伝子発現の制御を実現可能にする革新的なコンセプトに基づいており、核酸医薬開発の発展に資する方法論となることが期待される。
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| Outline of Final Research Achievements |
In this research, we developed a novel post-synthetic modification of oligonucleotide containing 5-trifluoromethyluracil base for converting a trifluoromethyl group to a heteroaromatic ring by treatment with bis-nucleophiles. Moreover, we found that oligonucleotides containing 5-mono- and 5-di-fluoromethyluracils can also be applied to post-synthetic modification.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
ピリミジン塩基5位の官能基は水素結合やスタッキング相互作用に大きく影響を及ぼすため、この位置に様々な修飾を施して評価することで、より機能性の高いオリゴ核酸を創出できると考えられます。しかし、現在一般的に用いられているオリゴ核酸合成法では修飾塩基毎に対応するホスホロアミダイトモノマーを多工程かけて合成しなければならないため、十分な構造探索を行うことは困難です。本研究で開発したオリゴ核酸合成後修飾法は酸化度の異なる様々な官能基をウラシル塩基の5位に導入でき、機能性オリゴ核酸の探索を効率化するため、今後の核酸医薬開発の発展に資する方法論となることが期待されます。
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Report
(3 results)
Research Products
(4 results)
