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Development of a diagnostic algorithm through gene panel testing and genetic risk score analysis to facilitate precision medicine for diabetes

Research Project

Project/Area Number 19K16534
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 49010:Pathological biochemistry-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Hosoe Jun  東京大学, 医学部附属病院, 特任助教 (10781213)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywords糖尿病 / 精密医療 / ゲノム解析 / 疾患関連遺伝子 / 遺伝統計学 / 若年発症糖尿病
Outline of Research at the Start

糖尿病のうち単一遺伝子異常によって発症する病型に関しても、早期診断と適切な治療を行い、合併症や重症化を予防することが望ましい。本研究では、単一遺伝子異常に伴う糖尿病が疑われる症例について、糖尿病関連遺伝子群を対象とした遺伝子パネルを設定し、次世代シークエンサーを用いた遺伝子解析を行う。さらに、臨床症状に共通点を持つ疾患をデータベースから検索するツールや遺伝的リスクスコア等も活用して、病型鑑別・疾患原因変異探索を進め、有効な診断アルゴリズムの原型を構築する。

Outline of Final Research Achievements

In the present study, we performed next-generation sequencing (NGS) of genes associated with diabetes in patients with suspected monogenic diabetes, characterized by decreased insulin secretion or increased insulin resistance. We performed phenotype-driven bioinformatics analysis of candidate variants from NGS data, which suggested potential phenotypic effects of these variants.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

糖尿病の多くは1型または2型糖尿病に病型分類されるが、その他の病型として単一遺伝子異常に伴う糖尿病も知られており、40種類以上のサブタイプが報告されている。本研究で得られた知見から、次世代シークエンサーと表現型を用いたバイオインフォマティクス解析を組み合わせた遺伝学的検査システムを活用することにより、高精度かつ迅速に単一遺伝子異常に伴う糖尿病の病因を同定できる可能性が示唆された。本研究で用いた包括的な解析手法は、他の様々な疾患分野において利用されることが期待される。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] 蛋白質構造データおよび遺伝学的検査システムを活用した若年発症糖尿病の新規病因解明2022

    • Author(s)
      細江隼、加藤貴史、鈴木顕、庄嶋伸浩、山内敏正、門脇孝
    • Journal Title

      糖尿病・内分泌代謝科

      Volume: 54 Pages: 84-84

    • NAID

      40022805878

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Journal Article] Genotype-Structure-Phenotype Correlations of Disease-Associated IGF1R Variants and Similarities to Those of INSR Variants2021

    • Author(s)
      Hosoe Jun、Kawashima-Sonoyama Yuki、Miya Fuyuki、Kadowaki Hiroko、Suzuki Ken、Kato Takashi、Matsuzawa Fumiko、Aikawa Sei-Ichi、Okada Yukinori、Tsunoda Tatsuhiko、Hanaki Keiichi、Kanzaki Susumu、Shojima Nobuhiro、Yamauchi Toshimasa、Kadowaki Takashi
    • Journal Title

      Diabetes

      Volume: 70 Issue: 8 Pages: 1874

    • DOI

      10.2337/db20-1145

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis of ethnic-specific variants of PAX4 associated with type 2 diabetes2021

    • Author(s)
      Hosoe Jun、Suzuki Ken、Miya Fuyuki、Kato Takashi、Tsunoda Tatsuhiko、Okada Yukinori、Horikoshi Momoko、Shojima Nobuhiro、Yamauchi Toshimasa、Kadowaki Takashi
    • Journal Title

      Human Genome Variation

      Volume: 8 Issue: 1

    • DOI

      10.1038/s41439-021-00156-8

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 糖尿病のシークエンス解析の現状2021

    • Author(s)
      細江隼、鈴木顕、加藤貴史、庄嶋伸浩、山内敏正、門脇孝
    • Journal Title

      Medical Science Digest

      Volume: 47 Pages: 15-18

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  • [Journal Article] 黒色表皮腫2021

    • Author(s)
      細江隼、山内敏正
    • Journal Title

      Visual Dermatology

      Volume: 20 Pages: 820-820

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  • [Journal Article] Clinical usefulness of multigene screening with phenotype-driven bioinformatics analysis for the diagnosis of patients with monogenic diabetes or severe insulin resistance2020

    • Author(s)
      Hosoe Jun, ... Fujiwara Toyofumi et al.
    • Journal Title

      Diabetes Research and Clinical Practice

      Volume: 169 Pages: 108461-108461

    • DOI

      10.1016/j.diabres.2020.108461

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      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] インスリン受容体異常症について2020

    • Author(s)
      山内敏正、細江隼、庄嶋伸浩、門脇孝
    • Journal Title

      月刊糖尿病

      Volume: 12 Pages: 55-61

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  • [Journal Article] 糖尿病の遺伝素因 ―単一遺伝子異常による糖尿病― 6.インスリン受容体遺伝子異常と糖尿病2019

    • Author(s)
      細江隼、庄嶋伸浩、山内敏正、門脇孝
    • Journal Title

      糖尿病

      Volume: 62 Pages: 471-473

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  • [Journal Article] パスウェイ解析を用いた2型糖尿病遺伝素因の日欧の比較2019

    • Author(s)
      細江隼、鈴木顕、加藤貴史、岡田随象、庄嶋伸浩、山内敏正、門脇孝
    • Journal Title

      内分泌・糖尿病・代謝内科

      Volume: 49 Pages: 337-342

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  • [Journal Article] 糖尿病に対するゲノム創薬の実現に向けて2019

    • Author(s)
      庄嶋伸浩、鈴木顕、細江隼、山内敏正、門脇孝
    • Journal Title

      Precision Medicine

      Volume: 2 Pages: 492-495

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  • [Presentation] タンパク質立体構造解析を用いたインスリン/IGF-1受容体における遺伝子型-表現型相関の確立2021

    • Author(s)
      細江隼、鞁嶋有紀、宮冬樹、門脇弘子、鈴木顕、加藤貴史、岡田随象、角田達彦、花木啓一、神崎晋、庄嶋伸浩、山内敏正、門脇孝
    • Organizer
      第64回日本糖尿病学会年次学術集会
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  • [Presentation] 蛋白質構造データを活用したインスリンおよびインスリン様成長因子-1受容体における遺伝子型-表現型相関の解明2021

    • Author(s)
      細江隼、鞁嶋有紀、花木啓一、神崎晋、庄嶋伸浩、山内敏正、門脇孝
    • Organizer
      第94回日本内分泌学会学術総会
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  • [Presentation] 臨床・遺伝情報に基づく診断支援システムを活用した若年発症糖尿病の新規病因解明2020

    • Author(s)
      細江隼、庄嶋伸浩、山内敏正、門脇孝
    • Organizer
      第93回 日本内分泌学会学術総会
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 若年発症糖尿病に対する臨床・遺伝データを用いた診断支援システムの臨床的有用性2020

    • Author(s)
      細江隼、門脇弘子、宮冬樹、鈴木顕、加藤貴史、脇裕典、笹子敬洋、山田朋英、藤田逸人、角田達彦、庄嶋伸浩、山内敏正、門脇孝
    • Organizer
      第63回日本糖尿病学会年次学術集会
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Usefulness of multigene screening with phenotype-driven bioinformatics analysis for diagnosis of atypical diabetes2019

    • Author(s)
      Jun Hosoe, Hiroko Kadowaki, Fuyuki Miya, Ken Suzuki, Takashi Kato, Hironori Waki, Yukinori Okada, Tatsuhiko Tsunoda, Momoko Horikoshi, Nobuhiro Shojima, Toshimasa Yamauchi, Takashi Kadowaki
    • Organizer
      IDF Congress 2019
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      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Effectiveness of Comprehensive Gene Panel-based Next-generation Sequencing with Phenotype-driven Bioinformatics Analysis for Diagnosis of Atypical Diabetes2019

    • Author(s)
      Jun Hosoe, Hiroko Kadowaki, Fuyuki Miya, Minaka Takakura, Hironori Waki, Takayoshi Sasako, Takashi Kato, Tatsuhiko Tsunoda, Nobuhiro Shojima, Toshimasa Yamauchi, Takashi Kadowaki
    • Organizer
      79th Scientific Sessions of the American Diabetes Association
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      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 臨床・遺伝情報に基づくPhenotype-driven解析を用いた高度インスリン抵抗性の病因解明2019

    • Author(s)
      細江隼、門脇弘子、宮冬樹、加藤貴史、鈴木顕、角田達彦、脇裕典、庄嶋伸浩、山内敏正、門脇孝
    • Organizer
      第69回 日本体質医学会総会
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      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 糖尿病関連遺伝子群のターゲットリシークエンスによる高度インスリン抵抗性の新規病因解明2019

    • Author(s)
      細江隼、門脇弘子、宮冬樹、高倉美菜香、脇裕典、笹子敬洋、鈴木顕、加藤貴史、濵口牧子、山田朋英、藤田逸人、角田達彦、庄嶋伸浩、山内敏正、門脇孝
    • Organizer
      第62回 日本糖尿病学会年次学術集会
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      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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