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Surveillance of clinical isolates including antimicrobial resistant genes derived from livestock

Research Project

Project/Area Number 19K16657
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 49050:Bacteriology-related
Research InstitutionToin University of Yokohama

Principal Investigator

HASUNUMA Yuya  桐蔭横浜大学, 医用工学部, 講師 (70643013)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
KeywordsESBL産生菌 / floR / qnr / AMR / β-ラクタマーゼ / 薬剤耐性菌 / 地域サーベイランス / floR遺伝子 / qnr遺伝子 / 大腸菌 / 次世代シークエンス
Outline of Research at the Start

抗菌薬耐性菌対策はWHOが提唱する「One world, One Health」のなかでより優先すべき事項の中の1つとして挙げられており、ヒトへの薬剤耐性菌の拡散は動物や環境からも生じていると言われている。本研究では家畜によく用いられる抗菌薬に対する薬剤耐性遺伝子に着目し、ヒト臨床分離株におけるその保有状況とヒトの感染症治療に影響を及ぼす薬剤耐性遺伝子との関係性を分子疫学的に明らかにしていく。そして、家畜からヒトへ薬剤耐性菌が拡散したことを示唆する耐性遺伝子マーカーを証明することにより、新たな薬剤耐性菌拡散の分子生物学的背景をモニタリングできる可能性があり、その制御方法へと繋げることを目指す。

Outline of Final Research Achievements

Antimicrobial resistant bacteria is of global concern. In particular, the drug-resistant bacteria often include antimicrobial resistant genes, that are thought to origin from livestock and environment, among clinical isolates. In this study, we focused on floR gene, which is a resistance gene to florphenicol used in livestock. The prevalent rates of floR were 1.5%, 6.4%, and 2.9% in ESBL producing Escherichia coli from clinical isolates, retail meats and healthy humans, respectively. Furthermore, the plasmid possessed the isolates from retail meat had a potential of high frequency of transconjugation.
In addition, the prevalent rate of the qnr gene, which was carried with floR in the strain, was investigated. The prevalence of qnr gene in non-ESBL and ESBL-producing E. coli was 2% and 4%, respectively, and qnrS were determined among all strain.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究において、家畜からヒトへ薬剤耐性菌が拡散したことを示唆する耐性遺伝子マーカーとしてfloR遺伝子を提案することができたと考える。この成果は、ヒト環境における薬剤耐性遺伝子流入経路の一つを明らかにすることにつながり、新たな薬剤耐性菌拡散の分子生物学的背景をモニタリングできる可能性がある。このことは、薬剤耐性菌の拡散を制御するための新たな方法へと繋がると考えられ、さらには、将来的に薬剤耐性菌による感染症の減少、患者入院期間の短縮、医療費の削減にも貢献する。

Report

(3 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2021 2020 2019 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (12 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] マイクロ波プラズマを用いた紫外線-オゾン発生法によるBacillus atrophaeusに対する殺菌効果2020

    • Author(s)
      楠元直樹 , 渡部篤也 , 蓮沼裕也 , 平岡茂美 , 川島徳道 , 徳岡由一
    • Journal Title

      材料技術

      Volume: 38(3) Pages: 41-46

    • NAID

      40022306315

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 臨床分離されたEscherichia coliにおけるニューキノロン系抗菌薬耐性遺伝子qnr遺伝子保有率調査2021

    • Author(s)
      谷津 大介 , 蓮沼 裕也 , 新国 駿 , 徳岡 由一
    • Organizer
      第32回日本臨床微生物学会総会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Ampliseqによるbla遺伝子の網羅的検出と低頻度バリアント解析系の確立2021

    • Author(s)
      新国 駿 , 蓮沼 裕也 , 徳岡 由一
    • Organizer
      第32回日本臨床微生物学会総会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] マイクロ波プラズマを用いた紫外線-オゾン発生装置による殺菌効果の評価2020

    • Author(s)
      渡部篤也 , 蓮沼裕也 , 楠元直樹 , 徳岡由一
    • Organizer
      日本環境感染学会総会・学術集会(Web)
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] マイクロ波プラズマを用いた紫外線 オゾン発生装置による殺菌効果の評価2020

    • Author(s)
      渡部篤也 , 蓮沼裕也 , 楠元直樹 , 徳岡由一
    • Organizer
      医療機器学会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] floR遺伝子保有菌株の薬剤耐性接合伝達能および分子疫学的特徴2020

    • Author(s)
      小林美里 , 新国駿 , 徳岡由一 , 蓮沼裕也
    • Organizer
      日本ワンヘルスサイエンス学会年次学術集会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 星野隼也 , 新国駿 , 徳岡由一 , 蓮沼裕也2020

    • Author(s)
      神奈川県内で臨床分離されたセフメタゾール耐性Escherichia coliの薬剤耐性伝達能評価
    • Organizer
      日本ワンヘルスサイエンス学会年次学術集会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 神奈川県内で臨床分離されたCefmetazole耐性Escherichia coliの分子疫学的特徴2020

    • Author(s)
      星野 隼也 , 蓮沼 裕也
    • Organizer
      第69回日本医学検査学会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] High-throughput sequencingによるAmpliseqを用いたβ-lactamase遺伝子の網羅的解析2020

    • Author(s)
      蓮沼 裕也、新国 駿、徳岡由一
    • Organizer
      第31回日本臨床微生物学会総会・学術集会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 神奈川県内中小規模病院から分離されたESBL産生大腸菌ST131のクレード分類2019

    • Author(s)
      新国 駿、蓮沼 裕也、天野 紗希、B. エンフジン、徳岡 由一
    • Organizer
      第68回日本医学検査学会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 市販鶏肉由来および神奈川県内臨床分離ESBL産生Escherichia coli におけるfloR遺伝子の保有状況2019

    • Author(s)
      小林 美里、蓮沼 裕也、徳岡 由一
    • Organizer
      第66回日本化学療法学会東日本支部総会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 神奈川県内で臨床分離されたqnrS遺伝子保有ESBL産生Escherichia coli株の分子生物学的特徴2019

    • Author(s)
      蓮沼 裕也、徳岡 由一
    • Organizer
      第66回日本化学療法学会東日本支部総会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 健常青年における広域セファロスポリン耐性腸内細菌科の保菌率推移と分子疫学的特徴2019

    • Author(s)
      東 希実、蓮沼 裕也、徳岡 由一
    • Organizer
      第40回 日本食品微生物学会学術総会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Remarks] 桐蔭横浜大学医用工学部 臨床微生物学研究室

    • URL

      http://www.cc.toin.ac.jp/sc/hasunuma/

    • Related Report
      2020 Annual Research Report 2019 Research-status Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2022-01-27  

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